RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A DAN1P47178 298 aa-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A ERB1Q04660 807 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A SHE1P38200 338 aa-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A YIL001WP40560 513 aa-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A YGL114WP53134 725 aa-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A JJJ1P53863 590 aa-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A KTR5P53966 522 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A YPL162CQ12042 273 aa-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A ISD11Q6Q560 94 aa-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A APC1P53886 1748 aa-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A NUP170P38181 1502 aa-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A IMP2'P32351 346 aa-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A FRM2P37261 193 aa-0.18□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A MSK1P32048 576 aa-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A HMX1P32339 317 aa-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A GAT3Q07928 141 aa-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A YPL247CQ12523 523 aa-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A DFM1Q12743 341 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A YHR139C-AO13536 103 aa-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A BMH1P29311 267 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A SWD2P36104 329 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A SEN34P39707 275 aa-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A RPT4P53549 437 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A AIM36Q03798 255 aa-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A YLR456WQ06199 204 aa-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A YOR376WQ08900 122 aa-0.19□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A FBA1P14540 359 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A FAR1P21268 830 aa-0.2□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A MDH2P22133 377 aa-0.2□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A CWP1P28319 239 aa-0.2□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A VMA5P31412 392 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A IML3P38265 245 aa-0.2□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A YFL040WP43562 540 aa-0.2□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A CIN2P46670 268 aa-0.2□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A SNX4P47057 423 aa-0.2□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A SWC4P53201 476 aa-0.2□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A RRI2Q12348 645 aa-0.2□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A DSE1P40077 573 aa-0.2□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A SMC2P38989 1170 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A EMC6Q12431 108 aa-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A TIP20P33891 701 aa-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A SHC1P39000 512 aa-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A GON7P46984 123 aa-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A PGU1P47180 361 aa-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A PRP42Q03776 544 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A MED1Q12321 566 aa-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A GPM3Q12326 303 aa-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A RIF1P29539 1916 aa-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A ILV1P00927 576 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A IFM1P25038 676 aa-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A ARO4P32449 370 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A SPL2P38839 148 aa-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A PCL7P40186 285 aa-0.21□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A MEP1P40260 492 aa-0.22□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A RPS29AP41057 56 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A FYV8P46949 817 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A TIM21P53220 239 aa-0.22□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A CYT2Q00873 224 aa-0.22□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A SAS5Q99314 248 aa-0.22□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A MLP2P40457 1679 aa-0.22□□□□□ -2.44
YPL060C-AYPL060C-A PMT2P31382 759 aa-0.22□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A CYM1P32898 989 aa-0.22□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A TPO5P36029 618 aa-0.22□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A ARN2P38724 620 aa-0.22□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RCY1P39531 840 aa-0.22□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SED1Q01589 338 aa-0.22□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A MRX9Q07349 420 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A CSM1P25651 190 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A ERG2P32352 222 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SEC66P33754 206 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A NUP49Q02199 472 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SPP2Q02521 185 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SLM3Q12093 417 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SPT6P23615 1451 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YMR147WP40218 223 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A LST7P53237 242 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SLX9P53251 210 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RPN8Q08723 338 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YPR064WQ12492 139 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A CDC36P06100 191 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A DOA4P32571 926 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SFC1P33303 322 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A GDH2P33327 1092 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A FET3P38993 636 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YAR068WP39564 161 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A MPP6P53725 186 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A CGI121Q03705 181 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A PBP4Q07362 185 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A ALE1Q08548 619 aa-0.23□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A ZWF1P11412 505 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A ALP1P38971 573 aa-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YIL089WP40500 205 aa-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A PER33Q12144 273 aa-0.24□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A SPO24Q3E752 67 aa-0.24□□□□□ -2.45
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