Protein–RNA interactions for Protein: P25038

IFM1, Translation initiation factor IF-2, mitochondrial, yeastyeast

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IFM1P25038 NSR1YGR159C 1245 nt17.37■□□□□ 0.37
IFM1P25038 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.2■□□□□ 0.34
IFM1P25038 NOP1YDL014W 984 nt16.61■□□□□ 0.25
IFM1P25038 MDJ1YFL016C 1536 nt15.7■□□□□ 0.1
IFM1P25038 YKL036CYKL036C 393 nt15□□□□□ -0.01
IFM1P25038 YJL027CYJL027C 417 nt14.51□□□□□ -0.09
IFM1P25038 SRX1YKL086W 384 nt14.47□□□□□ -0.09
IFM1P25038 Q0297Q0297 156 nt14.37□□□□□ -0.11
IFM1P25038 YCR051WYCR051W 669 nt13.75□□□□□ -0.21
IFM1P25038 DBP2YNL112W 1641 nt13.71□□□□□ -0.22
IFM1P25038 SSA3YBL075C 1950 nt13.65□□□□□ -0.22
IFM1P25038 YBR190WYBR190W 312 nt13.49□□□□□ -0.25
IFM1P25038 SCS3YGL126W 1143 nt13.43□□□□□ -0.26
IFM1P25038 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.25□□□□□ -0.29
IFM1P25038 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.25□□□□□ -0.29
IFM1P25038 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.25□□□□□ -0.29
IFM1P25038 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.25□□□□□ -0.29
IFM1P25038 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.25□□□□□ -0.29
IFM1P25038 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.25□□□□□ -0.29
IFM1P25038 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.25□□□□□ -0.29
IFM1P25038 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.25□□□□□ -0.29
IFM1P25038 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.25□□□□□ -0.29
IFM1P25038 RTC3YHR087W 336 nt13.23□□□□□ -0.29
IFM1P25038 CCC1YLR220W 969 nt13.19□□□□□ -0.3
IFM1P25038 YOL085CYOL085C 342 nt12.97□□□□□ -0.33
IFM1P25038 RVS167YDR388W 1449 nt12.92□□□□□ -0.34
IFM1P25038 RPP1BYDL130W 321 nt12.91□□□□□ -0.34
IFM1P25038 PKP1YIL042C 1185 nt12.84□□□□□ -0.35
IFM1P25038 SCJ1YMR214W 1134 nt12.68□□□□□ -0.38
IFM1P25038 PUT4YOR348C 1884 nt12.47□□□□□ -0.41
IFM1P25038 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.45□□□□□ -0.42
IFM1P25038 PET122YER153C 765 nt12.37□□□□□ -0.43
IFM1P25038 SHR5YOL110W 714 nt12.35□□□□□ -0.43
IFM1P25038 URN1YPR152C 1398 nt12.22□□□□□ -0.45
IFM1P25038 SCR1SCR1 522 nt12.21□□□□□ -0.45
IFM1P25038 DEP1YAL013W 1218 nt12.14□□□□□ -0.47
IFM1P25038 ARE1YCR048W 1833 nt12.12□□□□□ -0.47
IFM1P25038 SAH1YER043C 1350 nt12.11□□□□□ -0.47
IFM1P25038 OPI9YLR338W 858 nt12.09□□□□□ -0.47
IFM1P25038 POA1YBR022W 534 nt12.09□□□□□ -0.47
IFM1P25038 YDJ1YNL064C 1230 nt12.05□□□□□ -0.48
IFM1P25038 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.01□□□□□ -0.49
IFM1P25038 RPN10YHR200W 807 nt12.01□□□□□ -0.49
IFM1P25038 RRN5YLR141W 1092 nt12□□□□□ -0.49
IFM1P25038 ATS1YAL020C 1002 nt11.93□□□□□ -0.5
IFM1P25038 YNL208WYNL208W 600 nt11.91□□□□□ -0.5
IFM1P25038 BSC6YOL137W 1494 nt11.89□□□□□ -0.51
IFM1P25038 GAR1YHR089C 618 nt11.86□□□□□ -0.51
IFM1P25038 SSA4YER103W 1929 nt11.83□□□□□ -0.52
IFM1P25038 SPT5YML010W 3192 nt11.81□□□□□ -0.52
IFM1P25038 PUN1YLR414C 792 nt11.77□□□□□ -0.53
IFM1P25038 BUD23YCR047C 828 nt11.76□□□□□ -0.53
IFM1P25038 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.73□□□□□ -0.53
IFM1P25038 RSB1YOR049C 1065 nt11.68□□□□□ -0.54
IFM1P25038 PTC2YER089C 1395 nt11.67□□□□□ -0.54
IFM1P25038 YJR018WYJR018W 363 nt11.65□□□□□ -0.54
IFM1P25038 NAB2YGL122C 1578 nt11.57□□□□□ -0.56
IFM1P25038 BDF1YLR399C 2061 nt11.5□□□□□ -0.57
IFM1P25038 TIR1YER011W 765 nt11.47□□□□□ -0.57
IFM1P25038 PAC11YDR488C 1602 nt11.43□□□□□ -0.58
IFM1P25038 RPP2BYDR382W 333 nt11.37□□□□□ -0.59
IFM1P25038 FPR4YLR449W 1179 nt11.37□□□□□ -0.59
IFM1P25038 NVJ2YPR091C 2313 nt11.37□□□□□ -0.59
IFM1P25038 SSA1YAL005C 1929 nt11.35□□□□□ -0.59
IFM1P25038 DAL1YIR027C 1383 nt11.34□□□□□ -0.59
IFM1P25038 TAT1YBR069C 1860 nt11.33□□□□□ -0.6
IFM1P25038 FIS1YIL065C 468 nt11.3□□□□□ -0.6
IFM1P25038 YJR120WYJR120W 351 nt11.3□□□□□ -0.6
IFM1P25038 INM2YDR287W 879 nt11.29□□□□□ -0.6
IFM1P25038 MEP2YNL142W 1500 nt11.24□□□□□ -0.61
IFM1P25038 PHO4YFR034C 939 nt11.22□□□□□ -0.61
IFM1P25038 FPS1YLL043W 2010 nt11.21□□□□□ -0.61
IFM1P25038 YJL225CYJL225C 5277 nt11.11□□□□□ -0.63
IFM1P25038 YBL100CYBL100C 315 nt11.11□□□□□ -0.63
IFM1P25038 YPS1YLR120C 1710 nt11.11□□□□□ -0.63
IFM1P25038 PST2YDR032C 597 nt11.09□□□□□ -0.63
IFM1P25038 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.06□□□□□ -0.64
IFM1P25038 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.06□□□□□ -0.64
IFM1P25038 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.06□□□□□ -0.64
IFM1P25038 SRB2YHR041C 633 nt11.05□□□□□ -0.64
IFM1P25038 BDH2YAL061W 1254 nt11.04□□□□□ -0.64
IFM1P25038 YDR095CYDR095C 411 nt10.99□□□□□ -0.65
IFM1P25038 DCW1YKL046C 1350 nt10.99□□□□□ -0.65
IFM1P25038 YMR090WYMR090W 684 nt10.97□□□□□ -0.65
IFM1P25038 FUN26YAL022C 1554 nt10.96□□□□□ -0.65
IFM1P25038 TRM9YML014W 840 nt10.93□□□□□ -0.66
IFM1P25038 ALF1YNL148C 765 nt10.93□□□□□ -0.66
IFM1P25038 WWM1YFL010C 636 nt10.89□□□□□ -0.67
IFM1P25038 EMI2YDR516C 1503 nt10.89□□□□□ -0.67
IFM1P25038 YBR220CYBR220C 1683 nt10.85□□□□□ -0.67
IFM1P25038 LSM3YLR438C-A 270 nt10.83□□□□□ -0.68
IFM1P25038 RPP2AYOL039W 321 nt10.82□□□□□ -0.68
IFM1P25038 YDL221WYDL221W 552 nt10.77□□□□□ -0.69
IFM1P25038 CCT6YDR188W 1641 nt10.76□□□□□ -0.69
IFM1P25038 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.76□□□□□ -0.69
IFM1P25038 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.76□□□□□ -0.69
IFM1P25038 YGR021WYGR021W 873 nt10.74□□□□□ -0.69
IFM1P25038 SDH1YKL148C 1923 nt10.74□□□□□ -0.69
IFM1P25038 PTP1YDL230W 1008 nt10.73□□□□□ -0.69
IFM1P25038 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.73□□□□□ -0.69
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