Protein–RNA interactions for Protein: Q12144

PER33, Pore and endoplasmic reticulum protein of 33 kDa, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PER33Q12144 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.74■□□□□ 0.91
PER33Q12144 NSR1YGR159C 1245 nt20.41■□□□□ 0.86
PER33Q12144 NOP1YDL014W 984 nt20.22■□□□□ 0.83
PER33Q12144 YKL036CYKL036C 393 nt18.87■□□□□ 0.61
PER33Q12144 MDJ1YFL016C 1536 nt17.96■□□□□ 0.47
PER33Q12144 Q0297Q0297 156 nt17.78■□□□□ 0.44
PER33Q12144 SRX1YKL086W 384 nt17.68■□□□□ 0.42
PER33Q12144 YJL027CYJL027C 417 nt17.66■□□□□ 0.42
PER33Q12144 SCS3YGL126W 1143 nt17.29■□□□□ 0.36
PER33Q12144 YCR051WYCR051W 669 nt16.81■□□□□ 0.28
PER33Q12144 YOL085CYOL085C 342 nt16.36■□□□□ 0.21
PER33Q12144 PKP1YIL042C 1185 nt16.12■□□□□ 0.17
PER33Q12144 DBP2YNL112W 1641 nt15.97■□□□□ 0.15
PER33Q12144 RPP1BYDL130W 321 nt15.95■□□□□ 0.14
PER33Q12144 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.86■□□□□ 0.13
PER33Q12144 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.86■□□□□ 0.13
PER33Q12144 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.86■□□□□ 0.13
PER33Q12144 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.86■□□□□ 0.13
PER33Q12144 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.86■□□□□ 0.13
PER33Q12144 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.86■□□□□ 0.13
PER33Q12144 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.86■□□□□ 0.13
PER33Q12144 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.86■□□□□ 0.13
PER33Q12144 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.86■□□□□ 0.13
PER33Q12144 CCC1YLR220W 969 nt15.75■□□□□ 0.11
PER33Q12144 ATS1YAL020C 1002 nt15.53■□□□□ 0.08
PER33Q12144 SCJ1YMR214W 1134 nt15.53■□□□□ 0.08
PER33Q12144 PET122YER153C 765 nt15.24■□□□□ 0.03
PER33Q12144 YBR190WYBR190W 312 nt15.22■□□□□ 0.03
PER33Q12144 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.1■□□□□ 0.01
PER33Q12144 SCR1SCR1 522 nt15.1■□□□□ 0.01
PER33Q12144 RVS167YDR388W 1449 nt15.01□□□□□ -0.01
PER33Q12144 RTC3YHR087W 336 nt14.93□□□□□ -0.02
PER33Q12144 RRN5YLR141W 1092 nt14.84□□□□□ -0.03
PER33Q12144 RSB1YOR049C 1065 nt14.58□□□□□ -0.08
PER33Q12144 YDJ1YNL064C 1230 nt14.57□□□□□ -0.08
PER33Q12144 SHR5YOL110W 714 nt14.56□□□□□ -0.08
PER33Q12144 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.54□□□□□ -0.08
PER33Q12144 PST2YDR032C 597 nt14.35□□□□□ -0.11
PER33Q12144 GAR1YHR089C 618 nt14.26□□□□□ -0.13
PER33Q12144 DEP1YAL013W 1218 nt14.14□□□□□ -0.15
PER33Q12144 URN1YPR152C 1398 nt14.04□□□□□ -0.16
PER33Q12144 YNL208WYNL208W 600 nt13.88□□□□□ -0.19
PER33Q12144 YKL097CYKL097C 411 nt13.87□□□□□ -0.19
PER33Q12144 RPN10YHR200W 807 nt13.83□□□□□ -0.2
PER33Q12144 OPI9YLR338W 858 nt13.78□□□□□ -0.2
PER33Q12144 TIR1YER011W 765 nt13.75□□□□□ -0.21
PER33Q12144 SHU1YHL006C 453 nt13.73□□□□□ -0.21
PER33Q12144 PUT4YOR348C 1884 nt13.67□□□□□ -0.22
PER33Q12144 SAH1YER043C 1350 nt13.67□□□□□ -0.22
PER33Q12144 SSA1YAL005C 1929 nt13.56□□□□□ -0.24
PER33Q12144 ARE1YCR048W 1833 nt13.5□□□□□ -0.25
PER33Q12144 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.49□□□□□ -0.25
PER33Q12144 SRB2YHR041C 633 nt13.41□□□□□ -0.26
PER33Q12144 YJR018WYJR018W 363 nt13.41□□□□□ -0.26
PER33Q12144 PUN1YLR414C 792 nt13.37□□□□□ -0.27
PER33Q12144 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.32□□□□□ -0.28
PER33Q12144 YOR139CYOR139C 393 nt13.31□□□□□ -0.28
PER33Q12144 POA1YBR022W 534 nt13.3□□□□□ -0.28
PER33Q12144 YJR120WYJR120W 351 nt13.26□□□□□ -0.29
PER33Q12144 WWM1YFL010C 636 nt13.21□□□□□ -0.29
PER33Q12144 PTC2YER089C 1395 nt13.2□□□□□ -0.3
PER33Q12144 RPP2BYDR382W 333 nt13.17□□□□□ -0.3
PER33Q12144 SSA3YBL075C 1950 nt13.15□□□□□ -0.3
PER33Q12144 HOM6YJR139C 1080 nt13.14□□□□□ -0.31
PER33Q12144 YGR021WYGR021W 873 nt13.13□□□□□ -0.31
PER33Q12144 NPL3YDR432W 1245 nt13.12□□□□□ -0.31
PER33Q12144 MNP1YGL068W 585 nt13.12□□□□□ -0.31
PER33Q12144 BUD23YCR047C 828 nt13.05□□□□□ -0.32
PER33Q12144 NAB2YGL122C 1578 nt12.98□□□□□ -0.33
PER33Q12144 BDH2YAL061W 1254 nt12.95□□□□□ -0.34
PER33Q12144 BSC6YOL137W 1494 nt12.94□□□□□ -0.34
PER33Q12144 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.94□□□□□ -0.34
PER33Q12144 RKM5YLR137W 1104 nt12.94□□□□□ -0.34
PER33Q12144 YOL037CYOL037C 354 nt12.92□□□□□ -0.34
PER33Q12144 INM2YDR287W 879 nt12.89□□□□□ -0.35
PER33Q12144 FPR4YLR449W 1179 nt12.86□□□□□ -0.35
PER33Q12144 DAL1YIR027C 1383 nt12.85□□□□□ -0.35
PER33Q12144 FIS1YIL065C 468 nt12.82□□□□□ -0.36
PER33Q12144 LSM3YLR438C-A 270 nt12.82□□□□□ -0.36
PER33Q12144 YBL100CYBL100C 315 nt12.81□□□□□ -0.36
PER33Q12144 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.78□□□□□ -0.36
PER33Q12144 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.78□□□□□ -0.36
PER33Q12144 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.78□□□□□ -0.36
PER33Q12144 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.78□□□□□ -0.36
PER33Q12144 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.78□□□□□ -0.36
PER33Q12144 PHO4YFR034C 939 nt12.74□□□□□ -0.37
PER33Q12144 TRM9YML014W 840 nt12.69□□□□□ -0.38
PER33Q12144 FUN26YAL022C 1554 nt12.68□□□□□ -0.38
PER33Q12144 YLR281CYLR281C 468 nt12.66□□□□□ -0.38
PER33Q12144 PUS2YGL063W 1113 nt12.62□□□□□ -0.39
PER33Q12144 WHI5YOR083W 888 nt12.6□□□□□ -0.39
PER33Q12144 CCT6YDR188W 1641 nt12.52□□□□□ -0.4
PER33Q12144 ALF1YNL148C 765 nt12.43□□□□□ -0.42
PER33Q12144 YPS1YLR120C 1710 nt12.41□□□□□ -0.42
PER33Q12144 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.41□□□□□ -0.42
PER33Q12144 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.39□□□□□ -0.43
PER33Q12144 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.39□□□□□ -0.43
PER33Q12144 YPR011CYPR011C 981 nt12.38□□□□□ -0.43
PER33Q12144 YDR095CYDR095C 411 nt12.36□□□□□ -0.43
PER33Q12144 MOT3YMR070W 1473 nt12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.9 ms