Protein–RNA interactions for Protein: O13536

YHR139C-A, Uncharacterized protein YHR139C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR139C-AO13536 NSR1YGR159C 1245 nt13.04□□□□□ -0.32
YHR139C-AO13536 YML009W-BYML009W-B 477 nt12.67□□□□□ -0.38
YHR139C-AO13536 NOP1YDL014W 984 nt12.31□□□□□ -0.44
YHR139C-AO13536 MDJ1YFL016C 1536 nt11.83□□□□□ -0.52
YHR139C-AO13536 SSA3YBL075C 1950 nt11.57□□□□□ -0.56
YHR139C-AO13536 YKL036CYKL036C 393 nt10.96□□□□□ -0.65
YHR139C-AO13536 YJL027CYJL027C 417 nt10.91□□□□□ -0.66
YHR139C-AO13536 SRX1YKL086W 384 nt10.72□□□□□ -0.69
YHR139C-AO13536 Q0297Q0297 156 nt10.64□□□□□ -0.71
YHR139C-AO13536 YBR190WYBR190W 312 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR139C-AO13536 DBP2YNL112W 1641 nt10.29□□□□□ -0.76
YHR139C-AO13536 PUT4YOR348C 1884 nt10.06□□□□□ -0.8
YHR139C-AO13536 YCR051WYCR051W 669 nt10.05□□□□□ -0.8
YHR139C-AO13536 RTC3YHR087W 336 nt10.05□□□□□ -0.8
YHR139C-AO13536 SSA4YER103W 1929 nt9.94□□□□□ -0.82
YHR139C-AO13536 SPT5YML010W 3192 nt9.88□□□□□ -0.83
YHR139C-AO13536 TRN1tP(UGG)A 72 nt9.88□□□□□ -0.83
YHR139C-AO13536 SUF9tP(UGG)F 72 nt9.88□□□□□ -0.83
YHR139C-AO13536 SUF8tP(UGG)H 72 nt9.88□□□□□ -0.83
YHR139C-AO13536 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt9.88□□□□□ -0.83
YHR139C-AO13536 SUF7tP(UGG)M 72 nt9.88□□□□□ -0.83
YHR139C-AO13536 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt9.88□□□□□ -0.83
YHR139C-AO13536 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt9.88□□□□□ -0.83
YHR139C-AO13536 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt9.88□□□□□ -0.83
YHR139C-AO13536 SUF11tP(UGG)O2 72 nt9.88□□□□□ -0.83
YHR139C-AO13536 PAC11YDR488C 1602 nt9.74□□□□□ -0.85
YHR139C-AO13536 SCS3YGL126W 1143 nt9.72□□□□□ -0.85
YHR139C-AO13536 RVS167YDR388W 1449 nt9.71□□□□□ -0.86
YHR139C-AO13536 BDF1YLR399C 2061 nt9.68□□□□□ -0.86
YHR139C-AO13536 CCC1YLR220W 969 nt9.65□□□□□ -0.86
YHR139C-AO13536 POA1YBR022W 534 nt9.65□□□□□ -0.86
YHR139C-AO13536 ARE1YCR048W 1833 nt9.61□□□□□ -0.87
YHR139C-AO13536 BSC6YOL137W 1494 nt9.61□□□□□ -0.87
YHR139C-AO13536 NVJ2YPR091C 2313 nt9.6□□□□□ -0.87
YHR139C-AO13536 Q0182Q0182 405 nt9.57□□□□□ -0.88
YHR139C-AO13536 TAT1YBR069C 1860 nt9.53□□□□□ -0.88
YHR139C-AO13536 RPP1BYDL130W 321 nt9.52□□□□□ -0.89
YHR139C-AO13536 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt9.47□□□□□ -0.89
YHR139C-AO13536 YOL085CYOL085C 342 nt9.46□□□□□ -0.9
YHR139C-AO13536 SCJ1YMR214W 1134 nt9.43□□□□□ -0.9
YHR139C-AO13536 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.37□□□□□ -0.91
YHR139C-AO13536 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.37□□□□□ -0.91
YHR139C-AO13536 SSA1YAL005C 1929 nt9.35□□□□□ -0.91
YHR139C-AO13536 YJL225CYJL225C 5277 nt9.31□□□□□ -0.92
YHR139C-AO13536 SAH1YER043C 1350 nt9.3□□□□□ -0.92
YHR139C-AO13536 URN1YPR152C 1398 nt9.3□□□□□ -0.92
YHR139C-AO13536 SHR5YOL110W 714 nt9.26□□□□□ -0.93
YHR139C-AO13536 PKP1YIL042C 1185 nt9.24□□□□□ -0.93
YHR139C-AO13536 FPS1YLL043W 2010 nt9.24□□□□□ -0.93
YHR139C-AO13536 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt9.21□□□□□ -0.94
YHR139C-AO13536 OPI9YLR338W 858 nt9.18□□□□□ -0.94
YHR139C-AO13536 BUD23YCR047C 828 nt9.17□□□□□ -0.94
YHR139C-AO13536 MEP2YNL142W 1500 nt9.15□□□□□ -0.95
YHR139C-AO13536 RPN10YHR200W 807 nt9.06□□□□□ -0.96
YHR139C-AO13536 PET122YER153C 765 nt9.05□□□□□ -0.96
YHR139C-AO13536 MOT3YMR070W 1473 nt9.02□□□□□ -0.96
YHR139C-AO13536 YDJ1YNL064C 1230 nt8.99□□□□□ -0.97
YHR139C-AO13536 SCR1SCR1 522 nt8.97□□□□□ -0.97
YHR139C-AO13536 YBR220CYBR220C 1683 nt8.97□□□□□ -0.97
YHR139C-AO13536 NAB2YGL122C 1578 nt8.95□□□□□ -0.98
YHR139C-AO13536 DEP1YAL013W 1218 nt8.95□□□□□ -0.98
YHR139C-AO13536 YNL208WYNL208W 600 nt8.94□□□□□ -0.98
YHR139C-AO13536 DCW1YKL046C 1350 nt8.94□□□□□ -0.98
YHR139C-AO13536 PUN1YLR414C 792 nt8.93□□□□□ -0.98
YHR139C-AO13536 PTC2YER089C 1395 nt8.92□□□□□ -0.98
YHR139C-AO13536 PCH2YBR186W 1695 nt8.9□□□□□ -0.98
YHR139C-AO13536 UME6YDR207C 2511 nt8.88□□□□□ -0.99
YHR139C-AO13536 GUT2YIL155C 1950 nt8.88□□□□□ -0.99
YHR139C-AO13536 YMR090WYMR090W 684 nt8.87□□□□□ -0.99
YHR139C-AO13536 SEC11YIR022W 504 nt8.83□□□□□ -1
YHR139C-AO13536 EMI2YDR516C 1503 nt8.82□□□□□ -1
YHR139C-AO13536 RRN5YLR141W 1092 nt8.76□□□□□ -1.01
YHR139C-AO13536 SDH1YKL148C 1923 nt8.76□□□□□ -1.01
YHR139C-AO13536 YJR018WYJR018W 363 nt8.74□□□□□ -1.01
YHR139C-AO13536 YPS1YLR120C 1710 nt8.72□□□□□ -1.01
YHR139C-AO13536 GAR1YHR089C 618 nt8.71□□□□□ -1.02
YHR139C-AO13536 PIB2YGL023C 1908 nt8.71□□□□□ -1.02
YHR139C-AO13536 FIS1YIL065C 468 nt8.7□□□□□ -1.02
YHR139C-AO13536 YDL221WYDL221W 552 nt8.68□□□□□ -1.02
YHR139C-AO13536 BOR1YNL275W 1731 nt8.66□□□□□ -1.02
YHR139C-AO13536 DAL1YIR027C 1383 nt8.66□□□□□ -1.02
YHR139C-AO13536 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt8.65□□□□□ -1.02
YHR139C-AO13536 ATS1YAL020C 1002 nt8.62□□□□□ -1.03
YHR139C-AO13536 YER088W-BYER088W-B 147 nt8.6□□□□□ -1.03
YHR139C-AO13536 RTF1YGL244W 1677 nt8.57□□□□□ -1.04
YHR139C-AO13536 SCC4YER147C 1875 nt8.56□□□□□ -1.04
YHR139C-AO13536 PHO4YFR034C 939 nt8.56□□□□□ -1.04
YHR139C-AO13536 FPR4YLR449W 1179 nt8.56□□□□□ -1.04
YHR139C-AO13536 INM2YDR287W 879 nt8.55□□□□□ -1.04
YHR139C-AO13536 YDR095CYDR095C 411 nt8.53□□□□□ -1.04
YHR139C-AO13536 RPP2BYDR382W 333 nt8.53□□□□□ -1.04
YHR139C-AO13536 CAC2YML102W 1407 nt8.49□□□□□ -1.05
YHR139C-AO13536 TIR1YER011W 765 nt8.49□□□□□ -1.05
YHR139C-AO13536 MCH5YOR306C 1566 nt8.48□□□□□ -1.05
YHR139C-AO13536 RSB1YOR049C 1065 nt8.47□□□□□ -1.05
YHR139C-AO13536 PTK1YKL198C 1989 nt8.46□□□□□ -1.06
YHR139C-AO13536 YSC84YHR016C 1407 nt8.46□□□□□ -1.06
YHR139C-AO13536 YJR120WYJR120W 351 nt8.45□□□□□ -1.06
YHR139C-AO13536 BOP3YNL042W 1191 nt8.44□□□□□ -1.06
YHR139C-AO13536 PTP1YDL230W 1008 nt8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms