Protein–RNA interactions for Protein: Q12042

YPL162C, Vacuolar membrane protein YPL162C, yeastyeast

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL162CQ12042 NSR1YGR159C 1245 nt15.64■□□□□ 0.09
YPL162CQ12042 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.57■□□□□ 0.08
YPL162CQ12042 NOP1YDL014W 984 nt15.21■□□□□ 0.03
YPL162CQ12042 MDJ1YFL016C 1536 nt13.9□□□□□ -0.19
YPL162CQ12042 YKL036CYKL036C 393 nt13.8□□□□□ -0.2
YPL162CQ12042 SRX1YKL086W 384 nt13.19□□□□□ -0.3
YPL162CQ12042 Q0297Q0297 156 nt13.15□□□□□ -0.3
YPL162CQ12042 YJL027CYJL027C 417 nt12.95□□□□□ -0.34
YPL162CQ12042 SSA3YBL075C 1950 nt12.54□□□□□ -0.4
YPL162CQ12042 YCR051WYCR051W 669 nt12.5□□□□□ -0.41
YPL162CQ12042 SCS3YGL126W 1143 nt12.4□□□□□ -0.42
YPL162CQ12042 DBP2YNL112W 1641 nt12.18□□□□□ -0.46
YPL162CQ12042 YBR190WYBR190W 312 nt12□□□□□ -0.49
YPL162CQ12042 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YPL162CQ12042 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YPL162CQ12042 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YPL162CQ12042 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YPL162CQ12042 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YPL162CQ12042 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YPL162CQ12042 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YPL162CQ12042 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YPL162CQ12042 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.97□□□□□ -0.49
YPL162CQ12042 YOL085CYOL085C 342 nt11.88□□□□□ -0.51
YPL162CQ12042 CCC1YLR220W 969 nt11.84□□□□□ -0.51
YPL162CQ12042 RPP1BYDL130W 321 nt11.81□□□□□ -0.52
YPL162CQ12042 RTC3YHR087W 336 nt11.74□□□□□ -0.53
YPL162CQ12042 RVS167YDR388W 1449 nt11.69□□□□□ -0.54
YPL162CQ12042 PKP1YIL042C 1185 nt11.67□□□□□ -0.54
YPL162CQ12042 PUT4YOR348C 1884 nt11.36□□□□□ -0.59
YPL162CQ12042 SCJ1YMR214W 1134 nt11.34□□□□□ -0.59
YPL162CQ12042 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.28□□□□□ -0.6
YPL162CQ12042 SCR1SCR1 522 nt11.24□□□□□ -0.61
YPL162CQ12042 PET122YER153C 765 nt11.23□□□□□ -0.61
YPL162CQ12042 SHR5YOL110W 714 nt11.15□□□□□ -0.62
YPL162CQ12042 ATS1YAL020C 1002 nt11.06□□□□□ -0.64
YPL162CQ12042 YDJ1YNL064C 1230 nt10.96□□□□□ -0.65
YPL162CQ12042 SSA4YER103W 1929 nt10.94□□□□□ -0.66
YPL162CQ12042 POA1YBR022W 534 nt10.93□□□□□ -0.66
YPL162CQ12042 ARE1YCR048W 1833 nt10.91□□□□□ -0.66
YPL162CQ12042 SPT5YML010W 3192 nt10.91□□□□□ -0.66
YPL162CQ12042 RRN5YLR141W 1092 nt10.9□□□□□ -0.66
YPL162CQ12042 URN1YPR152C 1398 nt10.89□□□□□ -0.67
YPL162CQ12042 RPN10YHR200W 807 nt10.86□□□□□ -0.67
YPL162CQ12042 BSC6YOL137W 1494 nt10.86□□□□□ -0.67
YPL162CQ12042 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.8□□□□□ -0.68
YPL162CQ12042 DEP1YAL013W 1218 nt10.78□□□□□ -0.68
YPL162CQ12042 OPI9YLR338W 858 nt10.77□□□□□ -0.69
YPL162CQ12042 YNL208WYNL208W 600 nt10.72□□□□□ -0.69
YPL162CQ12042 RSB1YOR049C 1065 nt10.69□□□□□ -0.7
YPL162CQ12042 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.68□□□□□ -0.7
YPL162CQ12042 GAR1YHR089C 618 nt10.68□□□□□ -0.7
YPL162CQ12042 SAH1YER043C 1350 nt10.66□□□□□ -0.7
YPL162CQ12042 BDF1YLR399C 2061 nt10.6□□□□□ -0.71
YPL162CQ12042 PUN1YLR414C 792 nt10.53□□□□□ -0.72
YPL162CQ12042 PAC11YDR488C 1602 nt10.5□□□□□ -0.73
YPL162CQ12042 BUD23YCR047C 828 nt10.48□□□□□ -0.73
YPL162CQ12042 TAT1YBR069C 1860 nt10.44□□□□□ -0.74
YPL162CQ12042 YJR018WYJR018W 363 nt10.4□□□□□ -0.74
YPL162CQ12042 TIR1YER011W 765 nt10.35□□□□□ -0.75
YPL162CQ12042 PTC2YER089C 1395 nt10.33□□□□□ -0.76
YPL162CQ12042 MEP2YNL142W 1500 nt10.28□□□□□ -0.76
YPL162CQ12042 NAB2YGL122C 1578 nt10.27□□□□□ -0.76
YPL162CQ12042 RPP2BYDR382W 333 nt10.27□□□□□ -0.77
YPL162CQ12042 PST2YDR032C 597 nt10.23□□□□□ -0.77
YPL162CQ12042 NVJ2YPR091C 2313 nt10.21□□□□□ -0.77
YPL162CQ12042 SSA1YAL005C 1929 nt10.17□□□□□ -0.78
YPL162CQ12042 INM2YDR287W 879 nt10.11□□□□□ -0.79
YPL162CQ12042 DAL1YIR027C 1383 nt10.1□□□□□ -0.79
YPL162CQ12042 DCW1YKL046C 1350 nt10.08□□□□□ -0.8
YPL162CQ12042 FPR4YLR449W 1179 nt10.07□□□□□ -0.8
YPL162CQ12042 YJR120WYJR120W 351 nt10.03□□□□□ -0.8
YPL162CQ12042 FIS1YIL065C 468 nt10.02□□□□□ -0.81
YPL162CQ12042 YBR220CYBR220C 1683 nt10.01□□□□□ -0.81
YPL162CQ12042 PHO4YFR034C 939 nt9.98□□□□□ -0.81
YPL162CQ12042 YMR090WYMR090W 684 nt9.97□□□□□ -0.81
YPL162CQ12042 YBL100CYBL100C 315 nt9.95□□□□□ -0.82
YPL162CQ12042 EMI2YDR516C 1503 nt9.94□□□□□ -0.82
YPL162CQ12042 BDH2YAL061W 1254 nt9.94□□□□□ -0.82
YPL162CQ12042 YPS1YLR120C 1710 nt9.93□□□□□ -0.82
YPL162CQ12042 YGR021WYGR021W 873 nt9.88□□□□□ -0.83
YPL162CQ12042 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.88□□□□□ -0.83
YPL162CQ12042 PCH2YBR186W 1695 nt9.87□□□□□ -0.83
YPL162CQ12042 YKL097CYKL097C 411 nt9.85□□□□□ -0.83
YPL162CQ12042 SDH1YKL148C 1923 nt9.84□□□□□ -0.83
YPL162CQ12042 GUT2YIL155C 1950 nt9.83□□□□□ -0.84
YPL162CQ12042 SHU1YHL006C 453 nt9.83□□□□□ -0.84
YPL162CQ12042 LSM3YLR438C-A 270 nt9.82□□□□□ -0.84
YPL162CQ12042 WWM1YFL010C 636 nt9.81□□□□□ -0.84
YPL162CQ12042 SRB2YHR041C 633 nt9.81□□□□□ -0.84
YPL162CQ12042 SEC11YIR022W 504 nt9.81□□□□□ -0.84
YPL162CQ12042 TRM9YML014W 840 nt9.81□□□□□ -0.84
YPL162CQ12042 YDL221WYDL221W 552 nt9.8□□□□□ -0.84
YPL162CQ12042 FUN26YAL022C 1554 nt9.8□□□□□ -0.84
YPL162CQ12042 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.78□□□□□ -0.84
YPL162CQ12042 ALF1YNL148C 765 nt9.78□□□□□ -0.84
YPL162CQ12042 YDR095CYDR095C 411 nt9.74□□□□□ -0.85
YPL162CQ12042 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.72□□□□□ -0.85
YPL162CQ12042 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.72□□□□□ -0.85
YPL162CQ12042 HOM6YJR139C 1080 nt9.7□□□□□ -0.86
YPL162CQ12042 FPS1YLL043W 2010 nt9.68□□□□□ -0.86
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