Protein–RNA interactions for Protein: P47178

DAN1, Cell wall protein DAN1, yeastyeast

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DAN1P47178 NSR1YGR159C 1245 nt15.78■□□□□ 0.12
DAN1P47178 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.21■□□□□ 0.03
DAN1P47178 MDJ1YFL016C 1536 nt14.78□□□□□ -0.04
DAN1P47178 NOP1YDL014W 984 nt14.43□□□□□ -0.1
DAN1P47178 YJL027CYJL027C 417 nt13.53□□□□□ -0.24
DAN1P47178 SSA3YBL075C 1950 nt13.4□□□□□ -0.26
DAN1P47178 YBR190WYBR190W 312 nt12.79□□□□□ -0.36
DAN1P47178 DBP2YNL112W 1641 nt12.77□□□□□ -0.36
DAN1P47178 SRX1YKL086W 384 nt12.62□□□□□ -0.39
DAN1P47178 YKL036CYKL036C 393 nt12.6□□□□□ -0.39
DAN1P47178 RTC3YHR087W 336 nt12.46□□□□□ -0.41
DAN1P47178 Q0297Q0297 156 nt12.39□□□□□ -0.43
DAN1P47178 PUT4YOR348C 1884 nt12.24□□□□□ -0.45
DAN1P47178 YCR051WYCR051W 669 nt11.92□□□□□ -0.5
DAN1P47178 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.89□□□□□ -0.51
DAN1P47178 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.89□□□□□ -0.51
DAN1P47178 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.89□□□□□ -0.51
DAN1P47178 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.89□□□□□ -0.51
DAN1P47178 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.89□□□□□ -0.51
DAN1P47178 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.89□□□□□ -0.51
DAN1P47178 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.89□□□□□ -0.51
DAN1P47178 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.89□□□□□ -0.51
DAN1P47178 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.89□□□□□ -0.51
DAN1P47178 POA1YBR022W 534 nt11.79□□□□□ -0.52
DAN1P47178 ARE1YCR048W 1833 nt11.79□□□□□ -0.52
DAN1P47178 RVS167YDR388W 1449 nt11.77□□□□□ -0.52
DAN1P47178 SPT5YML010W 3192 nt11.77□□□□□ -0.52
DAN1P47178 CCC1YLR220W 969 nt11.77□□□□□ -0.53
DAN1P47178 SSA4YER103W 1929 nt11.74□□□□□ -0.53
DAN1P47178 BSC6YOL137W 1494 nt11.68□□□□□ -0.54
DAN1P47178 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.62□□□□□ -0.55
DAN1P47178 SCJ1YMR214W 1134 nt11.61□□□□□ -0.55
DAN1P47178 SAH1YER043C 1350 nt11.53□□□□□ -0.56
DAN1P47178 URN1YPR152C 1398 nt11.39□□□□□ -0.59
DAN1P47178 BDF1YLR399C 2061 nt11.39□□□□□ -0.59
DAN1P47178 OPI9YLR338W 858 nt11.37□□□□□ -0.59
DAN1P47178 BUD23YCR047C 828 nt11.28□□□□□ -0.6
DAN1P47178 SHR5YOL110W 714 nt11.2□□□□□ -0.62
DAN1P47178 TAT1YBR069C 1860 nt11.2□□□□□ -0.62
DAN1P47178 DEP1YAL013W 1218 nt11.17□□□□□ -0.62
DAN1P47178 PAC11YDR488C 1602 nt11.17□□□□□ -0.62
DAN1P47178 SCS3YGL126W 1143 nt11.14□□□□□ -0.63
DAN1P47178 RPP1BYDL130W 321 nt11.12□□□□□ -0.63
DAN1P47178 MEP2YNL142W 1500 nt11.05□□□□□ -0.64
DAN1P47178 PTC2YER089C 1395 nt11.04□□□□□ -0.64
DAN1P47178 PUN1YLR414C 792 nt11.02□□□□□ -0.65
DAN1P47178 NAB2YGL122C 1578 nt11□□□□□ -0.65
DAN1P47178 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.99□□□□□ -0.65
DAN1P47178 RPN10YHR200W 807 nt10.99□□□□□ -0.65
DAN1P47178 YOL085CYOL085C 342 nt10.97□□□□□ -0.65
DAN1P47178 PKP1YIL042C 1185 nt10.9□□□□□ -0.66
DAN1P47178 NVJ2YPR091C 2313 nt10.89□□□□□ -0.67
DAN1P47178 YNL208WYNL208W 600 nt10.88□□□□□ -0.67
DAN1P47178 DCW1YKL046C 1350 nt10.88□□□□□ -0.67
DAN1P47178 YJR018WYJR018W 363 nt10.8□□□□□ -0.68
DAN1P47178 FIS1YIL065C 468 nt10.79□□□□□ -0.68
DAN1P47178 YBR220CYBR220C 1683 nt10.77□□□□□ -0.69
DAN1P47178 PET122YER153C 765 nt10.74□□□□□ -0.69
DAN1P47178 DAL1YIR027C 1383 nt10.7□□□□□ -0.7
DAN1P47178 YPS1YLR120C 1710 nt10.7□□□□□ -0.7
DAN1P47178 EMI2YDR516C 1503 nt10.68□□□□□ -0.7
DAN1P47178 FPR4YLR449W 1179 nt10.67□□□□□ -0.7
DAN1P47178 YMR090WYMR090W 684 nt10.65□□□□□ -0.7
DAN1P47178 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.62□□□□□ -0.71
DAN1P47178 YDJ1YNL064C 1230 nt10.62□□□□□ -0.71
DAN1P47178 PHO4YFR034C 939 nt10.61□□□□□ -0.71
DAN1P47178 PCH2YBR186W 1695 nt10.58□□□□□ -0.72
DAN1P47178 SDH1YKL148C 1923 nt10.57□□□□□ -0.72
DAN1P47178 GUT2YIL155C 1950 nt10.55□□□□□ -0.72
DAN1P47178 YDL221WYDL221W 552 nt10.53□□□□□ -0.72
DAN1P47178 GAR1YHR089C 618 nt10.53□□□□□ -0.72
DAN1P47178 INM2YDR287W 879 nt10.5□□□□□ -0.73
DAN1P47178 YJR120WYJR120W 351 nt10.5□□□□□ -0.73
DAN1P47178 FPS1YLL043W 2010 nt10.5□□□□□ -0.73
DAN1P47178 YDR095CYDR095C 411 nt10.49□□□□□ -0.73
DAN1P47178 SEC11YIR022W 504 nt10.47□□□□□ -0.73
DAN1P47178 CAC2YML102W 1407 nt10.43□□□□□ -0.74
DAN1P47178 PIB2YGL023C 1908 nt10.39□□□□□ -0.75
DAN1P47178 SCC4YER147C 1875 nt10.38□□□□□ -0.75
DAN1P47178 SCR1SCR1 522 nt10.38□□□□□ -0.75
DAN1P47178 PTP1YDL230W 1008 nt10.36□□□□□ -0.75
DAN1P47178 RPP2BYDR382W 333 nt10.35□□□□□ -0.75
DAN1P47178 RRN5YLR141W 1092 nt10.34□□□□□ -0.75
DAN1P47178 YBL100CYBL100C 315 nt10.3□□□□□ -0.76
DAN1P47178 RPP2AYOL039W 321 nt10.29□□□□□ -0.76
DAN1P47178 IRC15YPL017C 1500 nt10.28□□□□□ -0.76
DAN1P47178 SSA1YAL005C 1929 nt10.27□□□□□ -0.77
DAN1P47178 YSC84YHR016C 1407 nt10.24□□□□□ -0.77
DAN1P47178 RTF1YGL244W 1677 nt10.23□□□□□ -0.77
DAN1P47178 GIS3YLR094C 1509 nt10.23□□□□□ -0.77
DAN1P47178 TIR1YER011W 765 nt10.21□□□□□ -0.77
DAN1P47178 YHL050CYHL050C 2094 nt10.18□□□□□ -0.78
DAN1P47178 FUN26YAL022C 1554 nt10.15□□□□□ -0.78
DAN1P47178 ALF1YNL148C 765 nt10.15□□□□□ -0.78
DAN1P47178 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.13□□□□□ -0.79
DAN1P47178 UME6YDR207C 2511 nt10.13□□□□□ -0.79
DAN1P47178 PTK1YKL198C 1989 nt10.12□□□□□ -0.79
DAN1P47178 BOP3YNL042W 1191 nt10.09□□□□□ -0.79
DAN1P47178 BOR1YNL275W 1731 nt10.07□□□□□ -0.8
DAN1P47178 RRT12YCR045C 1476 nt10.05□□□□□ -0.8
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