Protein–RNA interactions for Protein: Q01589

SED1, Cell wall protein SED1, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED1Q01589 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.49■□□□□ 0.39
SED1Q01589 NSR1YGR159C 1245 nt17.28■□□□□ 0.36
SED1Q01589 NOP1YDL014W 984 nt17.06■□□□□ 0.32
SED1Q01589 YKL036CYKL036C 393 nt15.86■□□□□ 0.13
SED1Q01589 MDJ1YFL016C 1536 nt15.23■□□□□ 0.03
SED1Q01589 Q0297Q0297 156 nt14.99□□□□□ -0.01
SED1Q01589 SRX1YKL086W 384 nt14.91□□□□□ -0.02
SED1Q01589 YJL027CYJL027C 417 nt14.81□□□□□ -0.04
SED1Q01589 SCS3YGL126W 1143 nt14.49□□□□□ -0.09
SED1Q01589 YCR051WYCR051W 669 nt14.13□□□□□ -0.15
SED1Q01589 YOL085CYOL085C 342 nt13.73□□□□□ -0.21
SED1Q01589 DBP2YNL112W 1641 nt13.53□□□□□ -0.24
SED1Q01589 PKP1YIL042C 1185 nt13.48□□□□□ -0.25
SED1Q01589 RPP1BYDL130W 321 nt13.44□□□□□ -0.26
SED1Q01589 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.43□□□□□ -0.26
SED1Q01589 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.43□□□□□ -0.26
SED1Q01589 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.43□□□□□ -0.26
SED1Q01589 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.43□□□□□ -0.26
SED1Q01589 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.43□□□□□ -0.26
SED1Q01589 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.43□□□□□ -0.26
SED1Q01589 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.43□□□□□ -0.26
SED1Q01589 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.43□□□□□ -0.26
SED1Q01589 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.43□□□□□ -0.26
SED1Q01589 CCC1YLR220W 969 nt13.24□□□□□ -0.29
SED1Q01589 SCJ1YMR214W 1134 nt13□□□□□ -0.33
SED1Q01589 ATS1YAL020C 1002 nt12.99□□□□□ -0.33
SED1Q01589 YBR190WYBR190W 312 nt12.96□□□□□ -0.33
SED1Q01589 PET122YER153C 765 nt12.83□□□□□ -0.36
SED1Q01589 RVS167YDR388W 1449 nt12.75□□□□□ -0.37
SED1Q01589 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.72□□□□□ -0.37
SED1Q01589 SCR1SCR1 522 nt12.71□□□□□ -0.37
SED1Q01589 RTC3YHR087W 336 nt12.66□□□□□ -0.38
SED1Q01589 RRN5YLR141W 1092 nt12.45□□□□□ -0.42
SED1Q01589 SHR5YOL110W 714 nt12.35□□□□□ -0.43
SED1Q01589 YDJ1YNL064C 1230 nt12.32□□□□□ -0.44
SED1Q01589 RSB1YOR049C 1065 nt12.23□□□□□ -0.45
SED1Q01589 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.22□□□□□ -0.45
SED1Q01589 PST2YDR032C 597 nt12□□□□□ -0.49
SED1Q01589 GAR1YHR089C 618 nt12□□□□□ -0.49
SED1Q01589 DEP1YAL013W 1218 nt11.92□□□□□ -0.5
SED1Q01589 URN1YPR152C 1398 nt11.91□□□□□ -0.5
SED1Q01589 RPN10YHR200W 807 nt11.78□□□□□ -0.52
SED1Q01589 YNL208WYNL208W 600 nt11.78□□□□□ -0.52
SED1Q01589 OPI9YLR338W 858 nt11.73□□□□□ -0.53
SED1Q01589 PUT4YOR348C 1884 nt11.68□□□□□ -0.54
SED1Q01589 SAH1YER043C 1350 nt11.6□□□□□ -0.55
SED1Q01589 TIR1YER011W 765 nt11.6□□□□□ -0.55
SED1Q01589 YKL097CYKL097C 411 nt11.59□□□□□ -0.55
SED1Q01589 ARE1YCR048W 1833 nt11.5□□□□□ -0.57
SED1Q01589 SHU1YHL006C 453 nt11.49□□□□□ -0.57
SED1Q01589 SSA1YAL005C 1929 nt11.44□□□□□ -0.58
SED1Q01589 PUN1YLR414C 792 nt11.39□□□□□ -0.59
SED1Q01589 YJR018WYJR018W 363 nt11.37□□□□□ -0.59
SED1Q01589 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.36□□□□□ -0.59
SED1Q01589 POA1YBR022W 534 nt11.3□□□□□ -0.6
SED1Q01589 SRB2YHR041C 633 nt11.28□□□□□ -0.6
SED1Q01589 YJR120WYJR120W 351 nt11.25□□□□□ -0.61
SED1Q01589 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.25□□□□□ -0.61
SED1Q01589 PTC2YER089C 1395 nt11.2□□□□□ -0.62
SED1Q01589 RPP2BYDR382W 333 nt11.17□□□□□ -0.62
SED1Q01589 YOR139CYOR139C 393 nt11.11□□□□□ -0.63
SED1Q01589 WWM1YFL010C 636 nt11.1□□□□□ -0.63
SED1Q01589 YGR021WYGR021W 873 nt11.1□□□□□ -0.63
SED1Q01589 BUD23YCR047C 828 nt11.09□□□□□ -0.63
SED1Q01589 HOM6YJR139C 1080 nt11.07□□□□□ -0.64
SED1Q01589 NAB2YGL122C 1578 nt11.05□□□□□ -0.64
SED1Q01589 BSC6YOL137W 1494 nt11.05□□□□□ -0.64
SED1Q01589 MNP1YGL068W 585 nt11.03□□□□□ -0.64
SED1Q01589 NPL3YDR432W 1245 nt10.99□□□□□ -0.65
SED1Q01589 BDH2YAL061W 1254 nt10.98□□□□□ -0.65
SED1Q01589 SSA3YBL075C 1950 nt10.97□□□□□ -0.65
SED1Q01589 INM2YDR287W 879 nt10.95□□□□□ -0.66
SED1Q01589 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.95□□□□□ -0.66
SED1Q01589 FIS1YIL065C 468 nt10.95□□□□□ -0.66
SED1Q01589 DAL1YIR027C 1383 nt10.94□□□□□ -0.66
SED1Q01589 YOL037CYOL037C 354 nt10.91□□□□□ -0.66
SED1Q01589 RKM5YLR137W 1104 nt10.9□□□□□ -0.66
SED1Q01589 FPR4YLR449W 1179 nt10.88□□□□□ -0.67
SED1Q01589 LSM3YLR438C-A 270 nt10.87□□□□□ -0.67
SED1Q01589 YBL100CYBL100C 315 nt10.87□□□□□ -0.67
SED1Q01589 PHO4YFR034C 939 nt10.84□□□□□ -0.67
SED1Q01589 FUN26YAL022C 1554 nt10.74□□□□□ -0.69
SED1Q01589 TRM9YML014W 840 nt10.72□□□□□ -0.69
SED1Q01589 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.66□□□□□ -0.7
SED1Q01589 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.66□□□□□ -0.7
SED1Q01589 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.66□□□□□ -0.7
SED1Q01589 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.66□□□□□ -0.7
SED1Q01589 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.66□□□□□ -0.7
SED1Q01589 CCT6YDR188W 1641 nt10.64□□□□□ -0.71
SED1Q01589 YLR281CYLR281C 468 nt10.63□□□□□ -0.71
SED1Q01589 YPS1YLR120C 1710 nt10.58□□□□□ -0.72
SED1Q01589 WHI5YOR083W 888 nt10.57□□□□□ -0.72
SED1Q01589 YDR095CYDR095C 411 nt10.55□□□□□ -0.72
SED1Q01589 PUS2YGL063W 1113 nt10.55□□□□□ -0.72
SED1Q01589 ALF1YNL148C 765 nt10.55□□□□□ -0.72
SED1Q01589 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.54□□□□□ -0.72
SED1Q01589 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.54□□□□□ -0.72
SED1Q01589 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.47□□□□□ -0.73
SED1Q01589 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.44□□□□□ -0.74
SED1Q01589 SPT5YML010W 3192 nt10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms