Protein–RNA interactions for Protein: P32048

MSK1, Lysine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSK1P32048 NSR1YGR159C 1245 nt16.41■□□□□ 0.22
MSK1P32048 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.86■□□□□ 0.13
MSK1P32048 NOP1YDL014W 984 nt15.2■□□□□ 0.02
MSK1P32048 MDJ1YFL016C 1536 nt15.15■□□□□ 0.02
MSK1P32048 YJL027CYJL027C 417 nt13.95□□□□□ -0.18
MSK1P32048 YKL036CYKL036C 393 nt13.36□□□□□ -0.27
MSK1P32048 SSA3YBL075C 1950 nt13.3□□□□□ -0.28
MSK1P32048 SRX1YKL086W 384 nt13.26□□□□□ -0.29
MSK1P32048 DBP2YNL112W 1641 nt13.14□□□□□ -0.31
MSK1P32048 YBR190WYBR190W 312 nt13.14□□□□□ -0.31
MSK1P32048 Q0297Q0297 156 nt13.07□□□□□ -0.32
MSK1P32048 RTC3YHR087W 336 nt12.79□□□□□ -0.36
MSK1P32048 YCR051WYCR051W 669 nt12.5□□□□□ -0.41
MSK1P32048 PUT4YOR348C 1884 nt12.44□□□□□ -0.42
MSK1P32048 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.38□□□□□ -0.43
MSK1P32048 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.38□□□□□ -0.43
MSK1P32048 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.38□□□□□ -0.43
MSK1P32048 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.38□□□□□ -0.43
MSK1P32048 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.38□□□□□ -0.43
MSK1P32048 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.38□□□□□ -0.43
MSK1P32048 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.38□□□□□ -0.43
MSK1P32048 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.38□□□□□ -0.43
MSK1P32048 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.38□□□□□ -0.43
MSK1P32048 RVS167YDR388W 1449 nt12.24□□□□□ -0.45
MSK1P32048 CCC1YLR220W 969 nt12.23□□□□□ -0.45
MSK1P32048 ARE1YCR048W 1833 nt12□□□□□ -0.49
MSK1P32048 SCJ1YMR214W 1134 nt11.98□□□□□ -0.49
MSK1P32048 POA1YBR022W 534 nt11.98□□□□□ -0.49
MSK1P32048 BSC6YOL137W 1494 nt11.86□□□□□ -0.51
MSK1P32048 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.84□□□□□ -0.51
MSK1P32048 SPT5YML010W 3192 nt11.83□□□□□ -0.52
MSK1P32048 SCS3YGL126W 1143 nt11.79□□□□□ -0.52
MSK1P32048 SAH1YER043C 1350 nt11.79□□□□□ -0.52
MSK1P32048 SSA4YER103W 1929 nt11.75□□□□□ -0.53
MSK1P32048 URN1YPR152C 1398 nt11.72□□□□□ -0.53
MSK1P32048 RPP1BYDL130W 321 nt11.71□□□□□ -0.53
MSK1P32048 OPI9YLR338W 858 nt11.71□□□□□ -0.53
MSK1P32048 SHR5YOL110W 714 nt11.64□□□□□ -0.55
MSK1P32048 YOL085CYOL085C 342 nt11.59□□□□□ -0.55
MSK1P32048 BUD23YCR047C 828 nt11.51□□□□□ -0.57
MSK1P32048 DEP1YAL013W 1218 nt11.5□□□□□ -0.57
MSK1P32048 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.48□□□□□ -0.57
MSK1P32048 PKP1YIL042C 1185 nt11.46□□□□□ -0.57
MSK1P32048 RPN10YHR200W 807 nt11.42□□□□□ -0.58
MSK1P32048 BDF1YLR399C 2061 nt11.37□□□□□ -0.59
MSK1P32048 PUN1YLR414C 792 nt11.37□□□□□ -0.59
MSK1P32048 PTC2YER089C 1395 nt11.33□□□□□ -0.6
MSK1P32048 NAB2YGL122C 1578 nt11.29□□□□□ -0.6
MSK1P32048 Q0182Q0182 405 nt11.29□□□□□ -0.6
MSK1P32048 YNL208WYNL208W 600 nt11.28□□□□□ -0.6
MSK1P32048 PET122YER153C 765 nt11.25□□□□□ -0.61
MSK1P32048 MEP2YNL142W 1500 nt11.22□□□□□ -0.61
MSK1P32048 TAT1YBR069C 1860 nt11.21□□□□□ -0.62
MSK1P32048 YJR018WYJR018W 363 nt11.16□□□□□ -0.62
MSK1P32048 YDJ1YNL064C 1230 nt11.14□□□□□ -0.63
MSK1P32048 FIS1YIL065C 468 nt11.04□□□□□ -0.64
MSK1P32048 PAC11YDR488C 1602 nt11.04□□□□□ -0.64
MSK1P32048 DAL1YIR027C 1383 nt11.01□□□□□ -0.65
MSK1P32048 DCW1YKL046C 1350 nt11□□□□□ -0.65
MSK1P32048 SCR1SCR1 522 nt10.98□□□□□ -0.65
MSK1P32048 GAR1YHR089C 618 nt10.97□□□□□ -0.65
MSK1P32048 FPR4YLR449W 1179 nt10.94□□□□□ -0.66
MSK1P32048 YPS1YLR120C 1710 nt10.93□□□□□ -0.66
MSK1P32048 PHO4YFR034C 939 nt10.9□□□□□ -0.66
MSK1P32048 YBR220CYBR220C 1683 nt10.89□□□□□ -0.67
MSK1P32048 INM2YDR287W 879 nt10.87□□□□□ -0.67
MSK1P32048 RRN5YLR141W 1092 nt10.87□□□□□ -0.67
MSK1P32048 YMR090WYMR090W 684 nt10.87□□□□□ -0.67
MSK1P32048 EMI2YDR516C 1503 nt10.85□□□□□ -0.67
MSK1P32048 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.85□□□□□ -0.67
MSK1P32048 YJR120WYJR120W 351 nt10.81□□□□□ -0.68
MSK1P32048 YDR095CYDR095C 411 nt10.76□□□□□ -0.69
MSK1P32048 RPP2BYDR382W 333 nt10.75□□□□□ -0.69
MSK1P32048 SDH1YKL148C 1923 nt10.72□□□□□ -0.69
MSK1P32048 YDL221WYDL221W 552 nt10.72□□□□□ -0.69
MSK1P32048 NVJ2YPR091C 2313 nt10.7□□□□□ -0.7
MSK1P32048 PCH2YBR186W 1695 nt10.66□□□□□ -0.7
MSK1P32048 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.65□□□□□ -0.7
MSK1P32048 TIR1YER011W 765 nt10.64□□□□□ -0.71
MSK1P32048 SSA1YAL005C 1929 nt10.64□□□□□ -0.71
MSK1P32048 GUT2YIL155C 1950 nt10.63□□□□□ -0.71
MSK1P32048 SEC11YIR022W 504 nt10.63□□□□□ -0.71
MSK1P32048 YBL100CYBL100C 315 nt10.62□□□□□ -0.71
MSK1P32048 CAC2YML102W 1407 nt10.61□□□□□ -0.71
MSK1P32048 MOT3YMR070W 1473 nt10.61□□□□□ -0.71
MSK1P32048 PTP1YDL230W 1008 nt10.58□□□□□ -0.72
MSK1P32048 RPP2AYOL039W 321 nt10.56□□□□□ -0.72
MSK1P32048 SCC4YER147C 1875 nt10.55□□□□□ -0.72
MSK1P32048 ALF1YNL148C 765 nt10.48□□□□□ -0.73
MSK1P32048 FUN26YAL022C 1554 nt10.48□□□□□ -0.73
MSK1P32048 IRC15YPL017C 1500 nt10.45□□□□□ -0.74
MSK1P32048 YJL225CYJL225C 5277 nt10.44□□□□□ -0.74
MSK1P32048 PIB2YGL023C 1908 nt10.43□□□□□ -0.74
MSK1P32048 RSB1YOR049C 1065 nt10.43□□□□□ -0.74
MSK1P32048 FPS1YLL043W 2010 nt10.43□□□□□ -0.74
MSK1P32048 BDH2YAL061W 1254 nt10.42□□□□□ -0.74
MSK1P32048 GIS3YLR094C 1509 nt10.41□□□□□ -0.74
MSK1P32048 YSC84YHR016C 1407 nt10.37□□□□□ -0.75
MSK1P32048 ATS1YAL020C 1002 nt10.37□□□□□ -0.75
MSK1P32048 TRM9YML014W 840 nt10.35□□□□□ -0.75
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