RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P PDS5Q04264 1277 aa3.48□□□□□ -1.85
tW(CCA)PtW(CCA)P EDE1P34216 1381 aa3.48□□□□□ -1.85
tW(CCA)PtW(CCA)P TOP1P04786 769 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)PtW(CCA)P CTT1P06115 562 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)PtW(CCA)P CAF20P12962 161 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD4P14736 754 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)PtW(CCA)P KAR2P16474 682 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)PtW(CCA)P SER1P33330 395 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)PtW(CCA)P YER156CP40093 338 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)PtW(CCA)P DSD1P53095 428 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)PtW(CCA)P TAP42Q04372 366 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)PtW(CCA)P TEA1P47988 759 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL082WP53155 381 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P KIN4Q01919 800 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P NYV1Q12255 253 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P AUS1Q08409 1394 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC3P33332 1336 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P YRF1-3P0CX14 1859 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P YRF1-7P0CX15 1859 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P YRF1-6P53819 1859 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P TRK1P12685 1235 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P YKL222CP35995 705 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P SLI15P38283 698 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P ALE1Q08548 619 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P SIR4P11978 1358 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P FKS3Q04952 1785 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P SSA4P22202 642 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P ICL1P28240 557 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P SMY1P32364 656 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P POL5P39985 1022 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P NST1P53935 1240 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P NUP145P49687 1317 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P LPD1P09624 499 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P ERT1P38140 529 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P RMT2Q03305 412 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P AOS1Q06624 347 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P NOP53Q12080 455 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P APC1P53886 1748 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P NTH2P35172 780 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P YBR287WP38355 427 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX21P50091 288 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P CTF4Q01454 927 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P IRC3Q06683 689 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P MHP1P43638 1398 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P YIL177CP40434 1758 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P YJL225CP40889 1758 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P THS1P04801 734 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P KCC4P25389 1037 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P YKU70P32807 602 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P APL2P36000 726 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P PFF1P38244 976 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS64Q03944 604 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P PUS5Q06244 254 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P BDF2Q07442 638 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)PtW(CCA)P DCD1P06773 312 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P RET1P22276 1149 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P FRD1P32614 470 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P RPN1P38764 993 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P PSD2P53037 1138 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P ZDS2P54786 942 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P ATG20Q07528 640 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P PHM7Q12252 991 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P GAP1P19145 602 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P RRP46P53256 223 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P FPK1P53739 893 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P AIM7Q12156 149 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P ARG8P18544 423 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P SIT4P20604 311 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P RTR1P40084 226 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P ZDS1P50111 915 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P MDG1P53885 366 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P ERO1Q03103 563 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P SAS4Q04003 481 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P IOC4Q04213 475 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P NSE3Q05541 303 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P SSP2Q08646 371 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P SNF2P22082 1703 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P COQ4O13525 335 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P MSM1P22438 575 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P SHC1P39000 512 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P VHR2P40041 505 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL050CP53952 270 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P PKH1Q03407 766 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR204WQ08995 1032 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P PRD1P25375 712 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P UGA3P26370 528 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P RTG2P32608 588 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P FET4P40988 552 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P GSM1P42950 618 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P TRM44Q02648 567 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P FCP1Q03254 732 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P DPL1Q05567 589 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)PtW(CCA)P HAT1Q12341 374 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 114.2 ms