RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M PDS5Q04264 1277 aa3.48□□□□□ -1.85
tW(CCA)MtW(CCA)M EDE1P34216 1381 aa3.48□□□□□ -1.85
tW(CCA)MtW(CCA)M TOP1P04786 769 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)MtW(CCA)M CTT1P06115 562 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)MtW(CCA)M CAF20P12962 161 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD4P14736 754 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)MtW(CCA)M KAR2P16474 682 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)MtW(CCA)M SER1P33330 395 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)MtW(CCA)M YER156CP40093 338 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)MtW(CCA)M DSD1P53095 428 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)MtW(CCA)M TAP42Q04372 366 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)MtW(CCA)M TEA1P47988 759 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M YGL082WP53155 381 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M KIN4Q01919 800 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M NYV1Q12255 253 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M AUS1Q08409 1394 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC3P33332 1336 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M YRF1-3P0CX14 1859 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M YRF1-7P0CX15 1859 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M YRF1-6P53819 1859 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M TRK1P12685 1235 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M YKL222CP35995 705 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M SLI15P38283 698 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M ALE1Q08548 619 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M SIR4P11978 1358 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M FKS3Q04952 1785 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M SSA4P22202 642 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M ICL1P28240 557 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M SMY1P32364 656 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M POL5P39985 1022 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M NST1P53935 1240 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M NUP145P49687 1317 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M LPD1P09624 499 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M ERT1P38140 529 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M RMT2Q03305 412 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M AOS1Q06624 347 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M NOP53Q12080 455 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M APC1P53886 1748 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M NTH2P35172 780 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR287WP38355 427 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX21P50091 288 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M CTF4Q01454 927 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M IRC3Q06683 689 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M MHP1P43638 1398 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M YIL177CP40434 1758 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL225CP40889 1758 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M THS1P04801 734 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M KCC4P25389 1037 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M YKU70P32807 602 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M APL2P36000 726 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M PFF1P38244 976 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS64Q03944 604 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M PUS5Q06244 254 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M BDF2Q07442 638 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)MtW(CCA)M DCD1P06773 312 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M RET1P22276 1149 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M FRD1P32614 470 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M RPN1P38764 993 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M PSD2P53037 1138 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M ZDS2P54786 942 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG20Q07528 640 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M PHM7Q12252 991 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M GAP1P19145 602 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M RRP46P53256 223 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M FPK1P53739 893 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM7Q12156 149 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M ARG8P18544 423 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M SIT4P20604 311 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M RTR1P40084 226 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M ZDS1P50111 915 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M MDG1P53885 366 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M ERO1Q03103 563 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M SAS4Q04003 481 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M IOC4Q04213 475 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M NSE3Q05541 303 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M SSP2Q08646 371 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M SNF2P22082 1703 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M COQ4O13525 335 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M MSM1P22438 575 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M SHC1P39000 512 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M VHR2P40041 505 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL050CP53952 270 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M PKH1Q03407 766 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR204WQ08995 1032 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M PRD1P25375 712 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M UGA3P26370 528 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M RTG2P32608 588 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M FET4P40988 552 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M GSM1P42950 618 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M TRM44Q02648 567 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M FCP1Q03254 732 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M DPL1Q05567 589 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)MtW(CCA)M HAT1Q12341 374 aa3.36□□□□□ -1.87
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