RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J PDS5Q04264 1277 aa3.48□□□□□ -1.85
tW(CCA)JtW(CCA)J EDE1P34216 1381 aa3.48□□□□□ -1.85
tW(CCA)JtW(CCA)J TOP1P04786 769 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)JtW(CCA)J CTT1P06115 562 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)JtW(CCA)J CAF20P12962 161 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD4P14736 754 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)JtW(CCA)J KAR2P16474 682 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)JtW(CCA)J SER1P33330 395 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)JtW(CCA)J YER156CP40093 338 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)JtW(CCA)J DSD1P53095 428 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)JtW(CCA)J TAP42Q04372 366 aa3.47□□□□□ -1.85
tW(CCA)JtW(CCA)J TEA1P47988 759 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL082WP53155 381 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J KIN4Q01919 800 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J NYV1Q12255 253 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J AUS1Q08409 1394 aa3.46□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC3P33332 1336 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J YRF1-3P0CX14 1859 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J YRF1-7P0CX15 1859 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J YRF1-6P53819 1859 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J TRK1P12685 1235 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL222CP35995 705 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J SLI15P38283 698 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J ALE1Q08548 619 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J SIR4P11978 1358 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J FKS3Q04952 1785 aa3.45□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J SSA4P22202 642 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J ICL1P28240 557 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J SMY1P32364 656 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J POL5P39985 1022 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J NST1P53935 1240 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J NUP145P49687 1317 aa3.44□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J LPD1P09624 499 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J ERT1P38140 529 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J RMT2Q03305 412 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J AOS1Q06624 347 aa3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP53Q12080 455 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J APC1P53886 1748 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J NTH2P35172 780 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR287WP38355 427 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX21P50091 288 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J CTF4Q01454 927 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J IRC3Q06683 689 aa3.42□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J MHP1P43638 1398 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL177CP40434 1758 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL225CP40889 1758 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J THS1P04801 734 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J KCC4P25389 1037 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J YKU70P32807 602 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J APL2P36000 726 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J PFF1P38244 976 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS64Q03944 604 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J PUS5Q06244 254 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J BDF2Q07442 638 aa3.41□□□□□ -1.86
tW(CCA)JtW(CCA)J DCD1P06773 312 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J RET1P22276 1149 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J FRD1P32614 470 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J RPN1P38764 993 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J PSD2P53037 1138 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J ZDS2P54786 942 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG20Q07528 640 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J PHM7Q12252 991 aa3.4□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J GAP1P19145 602 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP46P53256 223 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J FPK1P53739 893 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM7Q12156 149 aa3.39□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J ARG8P18544 423 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J SIT4P20604 311 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J RTR1P40084 226 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J ZDS1P50111 915 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J MDG1P53885 366 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J ERO1Q03103 563 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J SAS4Q04003 481 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J IOC4Q04213 475 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J NSE3Q05541 303 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J SSP2Q08646 371 aa3.38□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J SNF2P22082 1703 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J COQ4O13525 335 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J MSM1P22438 575 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J SHC1P39000 512 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J VHR2P40041 505 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL050CP53952 270 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J PKH1Q03407 766 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR204WQ08995 1032 aa3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J PRD1P25375 712 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J UGA3P26370 528 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J RTG2P32608 588 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J FET4P40988 552 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J GSM1P42950 618 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J TRM44Q02648 567 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J FCP1Q03254 732 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J DPL1Q05567 589 aa3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
tW(CCA)JtW(CCA)J HAT1Q12341 374 aa3.36□□□□□ -1.87
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