RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	ASF1	P32447	279 aa		5.86	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	RRN6	P32786	894 aa		5.86	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	BRE2	P43132	505 aa		5.86	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	AGE1	Q04412	482 aa		5.86	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	ATG32	P40458	529 aa		5.85	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	YJL007C	P47080	104 aa		5.85	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	CSN12	P47130	423 aa		5.85	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	CDC4	P07834	779 aa		5.84	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	BRN1	P38170	754 aa		5.84	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	MOD5	P07884	428 aa		5.83	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TTI1	P36097	1038 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	RTF1	P53064	558 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TUB4	P53378	473 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY2B-C	P25384	1770 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		5.82	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	SIT4	P20604	311 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	OCA5	P38738	679 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	HED1	Q03937	162 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	SIS2	P36024	562 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	FAR11	P53917	953 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	YNL115C	P53925	644 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	CPS1	P27614	576 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	TEA1	P47988	759 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	NIS1	P53939	407 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	GCR2	Q01722	534 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	SVF1	Q05515	481 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RPS1B	YML063W	CSE4	P36012	229 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	SPC42	P36094	363 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	YPL062W	Q02781	134 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	ITT1	Q04638	464 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	SCC2	Q04002	1493 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	SEC20	P28791	383 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	YBL036C	P38197	257 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	YAF9	P53930	226 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	MET32	Q12041	191 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	UFD4	P33202	1483 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	NNF1	P47149	201 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	PUS5	Q06244	254 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	YPR204W	Q08995	1032 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	HAT1	Q12341	374 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	YPK9	Q12697	1472 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	CDC25	P04821	1589 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-H	O13535	1793 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	TPD3	P31383	635 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	MET22	P32179	357 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	FPK1	P53739	893 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RPS1B	YML063W	AFT1	P22149	690 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	ASH1	P34233	588 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	PUP1	P25043	261 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	ENV9	Q08651	330 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	DNF1	P32660	1571 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RPS1B	YML063W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5

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