Protein–RNA interactions for Protein: P34233

ASH1, Transcriptional regulatory protein ASH1, yeastyeast

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ASH1P34233 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.48■■□□□ 1.35
ASH1P34233 NOP1YDL014W 984 nt23.09■■□□□ 1.29
ASH1P34233 NSR1YGR159C 1245 nt22.77■■□□□ 1.24
ASH1P34233 YKL036CYKL036C 393 nt21.93■■□□□ 1.1
ASH1P34233 YJL027CYJL027C 417 nt20.59■□□□□ 0.89
ASH1P34233 Q0297Q0297 156 nt20.44■□□□□ 0.86
ASH1P34233 SCS3YGL126W 1143 nt20.29■□□□□ 0.84
ASH1P34233 SRX1YKL086W 384 nt20.19■□□□□ 0.82
ASH1P34233 MDJ1YFL016C 1536 nt19.61■□□□□ 0.73
ASH1P34233 YCR051WYCR051W 669 nt19.21■□□□□ 0.67
ASH1P34233 YOL085CYOL085C 342 nt18.98■□□□□ 0.63
ASH1P34233 SCJ1YMR214W 1134 nt18.79■□□□□ 0.6
ASH1P34233 PKP1YIL042C 1185 nt18.62■□□□□ 0.57
ASH1P34233 RPP1BYDL130W 321 nt18.34■□□□□ 0.53
ASH1P34233 ATS1YAL020C 1002 nt18.34■□□□□ 0.53
ASH1P34233 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.87■□□□□ 0.45
ASH1P34233 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.87■□□□□ 0.45
ASH1P34233 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.87■□□□□ 0.45
ASH1P34233 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.87■□□□□ 0.45
ASH1P34233 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.87■□□□□ 0.45
ASH1P34233 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.87■□□□□ 0.45
ASH1P34233 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.87■□□□□ 0.45
ASH1P34233 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.87■□□□□ 0.45
ASH1P34233 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.87■□□□□ 0.45
ASH1P34233 CCC1YLR220W 969 nt17.71■□□□□ 0.43
ASH1P34233 DBP2YNL112W 1641 nt17.62■□□□□ 0.41
ASH1P34233 PET122YER153C 765 nt17.45■□□□□ 0.38
ASH1P34233 SCR1SCR1 522 nt17.43■□□□□ 0.38
ASH1P34233 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.13■□□□□ 0.33
ASH1P34233 RTC3YHR087W 336 nt17.09■□□□□ 0.33
ASH1P34233 RRN5YLR141W 1092 nt17.03■□□□□ 0.32
ASH1P34233 PST2YDR032C 597 nt16.88■□□□□ 0.29
ASH1P34233 RSB1YOR049C 1065 nt16.86■□□□□ 0.29
ASH1P34233 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.7■□□□□ 0.26
ASH1P34233 RVS167YDR388W 1449 nt16.7■□□□□ 0.26
ASH1P34233 YDJ1YNL064C 1230 nt16.55■□□□□ 0.24
ASH1P34233 YKL097CYKL097C 411 nt16.54■□□□□ 0.24
ASH1P34233 YBR190WYBR190W 312 nt16.54■□□□□ 0.24
ASH1P34233 SHR5YOL110W 714 nt16.28■□□□□ 0.2
ASH1P34233 GAR1YHR089C 618 nt16.09■□□□□ 0.17
ASH1P34233 SHU1YHL006C 453 nt16.04■□□□□ 0.16
ASH1P34233 YOR139CYOR139C 393 nt15.78■□□□□ 0.12
ASH1P34233 DEP1YAL013W 1218 nt15.62■□□□□ 0.09
ASH1P34233 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.6■□□□□ 0.09
ASH1P34233 TIR1YER011W 765 nt15.52■□□□□ 0.08
ASH1P34233 NPL3YDR432W 1245 nt15.48■□□□□ 0.07
ASH1P34233 YNL208WYNL208W 600 nt15.43■□□□□ 0.06
ASH1P34233 URN1YPR152C 1398 nt15.42■□□□□ 0.06
ASH1P34233 RPN10YHR200W 807 nt15.33■□□□□ 0.04
ASH1P34233 SSA1YAL005C 1929 nt15.2■□□□□ 0.02
ASH1P34233 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.12■□□□□ 0.01
ASH1P34233 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.12■□□□□ 0.01
ASH1P34233 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.12■□□□□ 0.01
ASH1P34233 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.12■□□□□ 0.01
ASH1P34233 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.12■□□□□ 0.01
ASH1P34233 SRB2YHR041C 633 nt15.09■□□□□ 0.01
ASH1P34233 MNP1YGL068W 585 nt15.07■□□□□ 0
ASH1P34233 OPI9YLR338W 858 nt15.06■□□□□ 0
ASH1P34233 YOL037CYOL037C 354 nt15.06■□□□□ 0
ASH1P34233 YGR021WYGR021W 873 nt15.05■□□□□ -0
ASH1P34233 HOM6YJR139C 1080 nt15.05■□□□□ -0
ASH1P34233 WWM1YFL010C 636 nt14.96□□□□□ -0.01
ASH1P34233 RKM5YLR137W 1104 nt14.82□□□□□ -0.04
ASH1P34233 SAH1YER043C 1350 nt14.8□□□□□ -0.04
ASH1P34233 MOT3YMR070W 1473 nt14.79□□□□□ -0.04
ASH1P34233 PUS2YGL063W 1113 nt14.76□□□□□ -0.05
ASH1P34233 YJR018WYJR018W 363 nt14.76□□□□□ -0.05
ASH1P34233 BSC6YOL137W 1494 nt14.7□□□□□ -0.06
ASH1P34233 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.69□□□□□ -0.06
ASH1P34233 YLR281CYLR281C 468 nt14.69□□□□□ -0.06
ASH1P34233 YJR120WYJR120W 351 nt14.68□□□□□ -0.06
ASH1P34233 RPP2BYDR382W 333 nt14.63□□□□□ -0.07
ASH1P34233 PUN1YLR414C 792 nt14.62□□□□□ -0.07
ASH1P34233 SSA3YBL075C 1950 nt14.54□□□□□ -0.08
ASH1P34233 WHI5YOR083W 888 nt14.54□□□□□ -0.08
ASH1P34233 PUT4YOR348C 1884 nt14.51□□□□□ -0.09
ASH1P34233 ARE1YCR048W 1833 nt14.46□□□□□ -0.09
ASH1P34233 BDH2YAL061W 1254 nt14.45□□□□□ -0.1
ASH1P34233 MRPL8YJL063C 717 nt14.44□□□□□ -0.1
ASH1P34233 FMP45YDL222C 930 nt14.39□□□□□ -0.11
ASH1P34233 LSM3YLR438C-A 270 nt14.39□□□□□ -0.11
ASH1P34233 YPR011CYPR011C 981 nt14.35□□□□□ -0.11
ASH1P34233 PTC2YER089C 1395 nt14.34□□□□□ -0.11
ASH1P34233 DSK2YMR276W 1122 nt14.3□□□□□ -0.12
ASH1P34233 YCH1YGR203W 447 nt14.28□□□□□ -0.12
ASH1P34233 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.27□□□□□ -0.13
ASH1P34233 YLR236CYLR236C 324 nt14.25□□□□□ -0.13
ASH1P34233 UBX6YJL048C 1191 nt14.2□□□□□ -0.14
ASH1P34233 IMP2'YIL154C 1041 nt14.19□□□□□ -0.14
ASH1P34233 ADO1YJR105W 1023 nt14.17□□□□□ -0.14
ASH1P34233 INM2YDR287W 879 nt14.14□□□□□ -0.15
ASH1P34233 POA1YBR022W 534 nt14.13□□□□□ -0.15
ASH1P34233 YBL100CYBL100C 315 nt14.12□□□□□ -0.15
ASH1P34233 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.1□□□□□ -0.15
ASH1P34233 YEL076CYEL076C 651 nt14.1□□□□□ -0.15
ASH1P34233 YLR464WYLR464W 651 nt14.1□□□□□ -0.15
ASH1P34233 TRM9YML014W 840 nt14.08□□□□□ -0.16
ASH1P34233 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.07□□□□□ -0.16
ASH1P34233 NAB2YGL122C 1578 nt14.05□□□□□ -0.16
ASH1P34233 DAL1YIR027C 1383 nt14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms