RNA–Protein interactions for RNA: YOR367W

SCP1, Transcript of Component of yeast cortical actin cytoskeleton, yeast

Gene SCP1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCP1	YOR367W	BIO4	P53630	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	PGA2	P53903	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	COX20	Q04935	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	BCH1	Q05029	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	RAX1	Q08760	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	AHC1	Q12433	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	CAP2	P13517	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	ATG7	P38862	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YIR014W	P40570	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	GIM3	P53900	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	CCE1	Q03702	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	COX2	P00410	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	MER1	P16523	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	MRPL25	P23369	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	TIR2	P33890	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	COS9	P36034	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	GPX2	P38143	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	CHK1	P38147	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	PRM9	P39551	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	OTU1	P43558	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	RRT5	P43607	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YJL118W	P47022	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	OKP1	P53298	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	STP1	Q00947	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	BSC6	Q08280	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	ALE1	Q08548	619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	ICT1	Q12385	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
SCP1	YOR367W	RAD3	P06839	778 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YSR3	P23501	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	CWP1	P28319	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	ITR2	P30606	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	TMT1	P32643	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	CYM1	P32898	989 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YKL071W	P36086	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	AIM24	P47127	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	ABM1	P47146	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	CSM3	Q04659	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	NDE2	Q07500	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	PRB1	P09232	635 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	GLN3	P18494	730 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	POP5	P28005	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	PRR1	P28708	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	ZIP1	P31111	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	KRE6	P32486	720 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	MKK1	P32490	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	SRB4	P32569	687 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YHK8	P38776	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	ALG8	P40351	577 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	AGP3	P43548	558 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	IKS1	P47042	667 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	GAT3	Q07928	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	ATG31	Q12421	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	SLY1	P22213	666 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	PTR2	P32901	601 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	SIP3	P38717	1229 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	CAF40	P53829	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	HXT11	P54862	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	PIR3	Q03180	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	GTO3	Q04806	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCP1	YOR367W	SET6	Q12529	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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