Protein–RNA interactions for Protein: P53011

SEH1, Nucleoporin SEH1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEH1P53011 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.79■□□□□ 0.6
SEH1P53011 NSR1YGR159C 1245 nt18.66■□□□□ 0.58
SEH1P53011 NOP1YDL014W 984 nt18.31■□□□□ 0.52
SEH1P53011 YKL036CYKL036C 393 nt16.95■□□□□ 0.3
SEH1P53011 MDJ1YFL016C 1536 nt16.5■□□□□ 0.23
SEH1P53011 Q0297Q0297 156 nt16.04■□□□□ 0.16
SEH1P53011 SRX1YKL086W 384 nt15.99■□□□□ 0.15
SEH1P53011 YJL027CYJL027C 417 nt15.85■□□□□ 0.13
SEH1P53011 SCS3YGL126W 1143 nt15.47■□□□□ 0.07
SEH1P53011 YCR051WYCR051W 669 nt15.17■□□□□ 0.02
SEH1P53011 YOL085CYOL085C 342 nt14.66□□□□□ -0.06
SEH1P53011 DBP2YNL112W 1641 nt14.63□□□□□ -0.07
SEH1P53011 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.43□□□□□ -0.1
SEH1P53011 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.43□□□□□ -0.1
SEH1P53011 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.43□□□□□ -0.1
SEH1P53011 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.43□□□□□ -0.1
SEH1P53011 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.43□□□□□ -0.1
SEH1P53011 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.43□□□□□ -0.1
SEH1P53011 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.43□□□□□ -0.1
SEH1P53011 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.43□□□□□ -0.1
SEH1P53011 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.43□□□□□ -0.1
SEH1P53011 PKP1YIL042C 1185 nt14.42□□□□□ -0.1
SEH1P53011 RPP1BYDL130W 321 nt14.39□□□□□ -0.11
SEH1P53011 CCC1YLR220W 969 nt14.29□□□□□ -0.12
SEH1P53011 YBR190WYBR190W 312 nt14.08□□□□□ -0.16
SEH1P53011 SCJ1YMR214W 1134 nt14□□□□□ -0.17
SEH1P53011 ATS1YAL020C 1002 nt13.91□□□□□ -0.18
SEH1P53011 RVS167YDR388W 1449 nt13.78□□□□□ -0.2
SEH1P53011 RTC3YHR087W 336 nt13.77□□□□□ -0.21
SEH1P53011 PET122YER153C 765 nt13.73□□□□□ -0.21
SEH1P53011 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.67□□□□□ -0.22
SEH1P53011 SSA3YBL075C 1950 nt13.65□□□□□ -0.22
SEH1P53011 SCR1SCR1 522 nt13.62□□□□□ -0.23
SEH1P53011 RRN5YLR141W 1092 nt13.36□□□□□ -0.27
SEH1P53011 SHR5YOL110W 714 nt13.3□□□□□ -0.28
SEH1P53011 YDJ1YNL064C 1230 nt13.22□□□□□ -0.29
SEH1P53011 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.09□□□□□ -0.31
SEH1P53011 RSB1YOR049C 1065 nt13.08□□□□□ -0.32
SEH1P53011 GAR1YHR089C 618 nt12.92□□□□□ -0.34
SEH1P53011 DEP1YAL013W 1218 nt12.9□□□□□ -0.34
SEH1P53011 URN1YPR152C 1398 nt12.9□□□□□ -0.34
SEH1P53011 PST2YDR032C 597 nt12.84□□□□□ -0.35
SEH1P53011 PUT4YOR348C 1884 nt12.74□□□□□ -0.37
SEH1P53011 RPN10YHR200W 807 nt12.72□□□□□ -0.37
SEH1P53011 YNL208WYNL208W 600 nt12.72□□□□□ -0.37
SEH1P53011 OPI9YLR338W 858 nt12.71□□□□□ -0.37
SEH1P53011 SAH1YER043C 1350 nt12.61□□□□□ -0.39
SEH1P53011 ARE1YCR048W 1833 nt12.53□□□□□ -0.4
SEH1P53011 TIR1YER011W 765 nt12.48□□□□□ -0.41
SEH1P53011 YKL097CYKL097C 411 nt12.45□□□□□ -0.42
SEH1P53011 POA1YBR022W 534 nt12.36□□□□□ -0.43
SEH1P53011 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.35□□□□□ -0.43
SEH1P53011 PUN1YLR414C 792 nt12.34□□□□□ -0.43
SEH1P53011 SSA1YAL005C 1929 nt12.33□□□□□ -0.44
SEH1P53011 YJR018WYJR018W 363 nt12.32□□□□□ -0.44
SEH1P53011 SHU1YHL006C 453 nt12.25□□□□□ -0.45
SEH1P53011 PTC2YER089C 1395 nt12.18□□□□□ -0.46
SEH1P53011 SRB2YHR041C 633 nt12.11□□□□□ -0.47
SEH1P53011 YJR120WYJR120W 351 nt12.11□□□□□ -0.47
SEH1P53011 BUD23YCR047C 828 nt12.08□□□□□ -0.48
SEH1P53011 RPP2BYDR382W 333 nt12.08□□□□□ -0.48
SEH1P53011 BSC6YOL137W 1494 nt12.07□□□□□ -0.48
SEH1P53011 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.05□□□□□ -0.48
SEH1P53011 NAB2YGL122C 1578 nt12.02□□□□□ -0.49
SEH1P53011 WWM1YFL010C 636 nt11.94□□□□□ -0.5
SEH1P53011 YGR021WYGR021W 873 nt11.89□□□□□ -0.51
SEH1P53011 INM2YDR287W 879 nt11.88□□□□□ -0.51
SEH1P53011 DAL1YIR027C 1383 nt11.87□□□□□ -0.51
SEH1P53011 YOR139CYOR139C 393 nt11.86□□□□□ -0.51
SEH1P53011 HOM6YJR139C 1080 nt11.85□□□□□ -0.51
SEH1P53011 BDH2YAL061W 1254 nt11.85□□□□□ -0.51
SEH1P53011 FPR4YLR449W 1179 nt11.84□□□□□ -0.51
SEH1P53011 FIS1YIL065C 468 nt11.83□□□□□ -0.52
SEH1P53011 NPL3YDR432W 1245 nt11.8□□□□□ -0.52
SEH1P53011 MNP1YGL068W 585 nt11.78□□□□□ -0.52
SEH1P53011 YBL100CYBL100C 315 nt11.76□□□□□ -0.53
SEH1P53011 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.75□□□□□ -0.53
SEH1P53011 PHO4YFR034C 939 nt11.75□□□□□ -0.53
SEH1P53011 LSM3YLR438C-A 270 nt11.71□□□□□ -0.53
SEH1P53011 RKM5YLR137W 1104 nt11.67□□□□□ -0.54
SEH1P53011 YOL037CYOL037C 354 nt11.66□□□□□ -0.54
SEH1P53011 TRM9YML014W 840 nt11.63□□□□□ -0.55
SEH1P53011 FUN26YAL022C 1554 nt11.62□□□□□ -0.55
SEH1P53011 NVJ2YPR091C 2313 nt11.61□□□□□ -0.55
SEH1P53011 PAC11YDR488C 1602 nt11.59□□□□□ -0.55
SEH1P53011 YPS1YLR120C 1710 nt11.51□□□□□ -0.57
SEH1P53011 CCT6YDR188W 1641 nt11.5□□□□□ -0.57
SEH1P53011 SPT5YML010W 3192 nt11.47□□□□□ -0.57
SEH1P53011 SSA4YER103W 1929 nt11.47□□□□□ -0.57
SEH1P53011 ALF1YNL148C 765 nt11.46□□□□□ -0.57
SEH1P53011 FPS1YLL043W 2010 nt11.45□□□□□ -0.58
SEH1P53011 YDR095CYDR095C 411 nt11.44□□□□□ -0.58
SEH1P53011 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.41□□□□□ -0.58
SEH1P53011 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.41□□□□□ -0.58
SEH1P53011 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.41□□□□□ -0.58
SEH1P53011 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.41□□□□□ -0.58
SEH1P53011 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.41□□□□□ -0.58
SEH1P53011 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.4□□□□□ -0.58
SEH1P53011 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.4□□□□□ -0.58
SEH1P53011 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.38□□□□□ -0.59
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