Protein–RNA interactions for Protein: Q12421

ATG31, Autophagy-related protein 31, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG31Q12421 NSR1YGR159C 1245 nt16.76■□□□□ 0.27
ATG31Q12421 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.55■□□□□ 0.24
ATG31Q12421 NOP1YDL014W 984 nt16.1■□□□□ 0.17
ATG31Q12421 MDJ1YFL016C 1536 nt15.68■□□□□ 0.1
ATG31Q12421 YKL036CYKL036C 393 nt14.51□□□□□ -0.09
ATG31Q12421 SSA3YBL075C 1950 nt14.42□□□□□ -0.1
ATG31Q12421 YJL027CYJL027C 417 nt14.38□□□□□ -0.11
ATG31Q12421 SRX1YKL086W 384 nt13.99□□□□□ -0.17
ATG31Q12421 Q0297Q0297 156 nt13.92□□□□□ -0.18
ATG31Q12421 YBR190WYBR190W 312 nt13.62□□□□□ -0.23
ATG31Q12421 DBP2YNL112W 1641 nt13.52□□□□□ -0.25
ATG31Q12421 YCR051WYCR051W 669 nt13.23□□□□□ -0.29
ATG31Q12421 RTC3YHR087W 336 nt13.22□□□□□ -0.29
ATG31Q12421 PUT4YOR348C 1884 nt13.06□□□□□ -0.32
ATG31Q12421 SCS3YGL126W 1143 nt12.98□□□□□ -0.33
ATG31Q12421 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG31Q12421 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG31Q12421 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG31Q12421 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG31Q12421 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG31Q12421 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG31Q12421 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG31Q12421 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG31Q12421 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG31Q12421 CCC1YLR220W 969 nt12.63□□□□□ -0.39
ATG31Q12421 SPT5YML010W 3192 nt12.59□□□□□ -0.39
ATG31Q12421 SSA4YER103W 1929 nt12.58□□□□□ -0.39
ATG31Q12421 ARE1YCR048W 1833 nt12.54□□□□□ -0.4
ATG31Q12421 POA1YBR022W 534 nt12.54□□□□□ -0.4
ATG31Q12421 YOL085CYOL085C 342 nt12.53□□□□□ -0.4
ATG31Q12421 RVS167YDR388W 1449 nt12.51□□□□□ -0.41
ATG31Q12421 RPP1BYDL130W 321 nt12.49□□□□□ -0.41
ATG31Q12421 BSC6YOL137W 1494 nt12.46□□□□□ -0.41
ATG31Q12421 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.38□□□□□ -0.43
ATG31Q12421 PKP1YIL042C 1185 nt12.31□□□□□ -0.44
ATG31Q12421 SCJ1YMR214W 1134 nt12.28□□□□□ -0.44
ATG31Q12421 SAH1YER043C 1350 nt12.23□□□□□ -0.45
ATG31Q12421 BDF1YLR399C 2061 nt12.2□□□□□ -0.46
ATG31Q12421 OPI9YLR338W 858 nt12.1□□□□□ -0.47
ATG31Q12421 URN1YPR152C 1398 nt12.07□□□□□ -0.48
ATG31Q12421 PAC11YDR488C 1602 nt12.04□□□□□ -0.48
ATG31Q12421 TAT1YBR069C 1860 nt12.04□□□□□ -0.48
ATG31Q12421 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12□□□□□ -0.49
ATG31Q12421 BUD23YCR047C 828 nt11.99□□□□□ -0.49
ATG31Q12421 SHR5YOL110W 714 nt11.93□□□□□ -0.5
ATG31Q12421 PET122YER153C 765 nt11.9□□□□□ -0.5
ATG31Q12421 SCR1SCR1 522 nt11.83□□□□□ -0.52
ATG31Q12421 MEP2YNL142W 1500 nt11.81□□□□□ -0.52
ATG31Q12421 DEP1YAL013W 1218 nt11.79□□□□□ -0.52
ATG31Q12421 NVJ2YPR091C 2313 nt11.76□□□□□ -0.53
ATG31Q12421 PUN1YLR414C 792 nt11.74□□□□□ -0.53
ATG31Q12421 PTC2YER089C 1395 nt11.72□□□□□ -0.53
ATG31Q12421 NAB2YGL122C 1578 nt11.71□□□□□ -0.53
ATG31Q12421 RPN10YHR200W 807 nt11.71□□□□□ -0.53
ATG31Q12421 YDJ1YNL064C 1230 nt11.67□□□□□ -0.54
ATG31Q12421 DCW1YKL046C 1350 nt11.57□□□□□ -0.56
ATG31Q12421 ATS1YAL020C 1002 nt11.56□□□□□ -0.56
ATG31Q12421 RRN5YLR141W 1092 nt11.55□□□□□ -0.56
ATG31Q12421 YNL208WYNL208W 600 nt11.54□□□□□ -0.56
ATG31Q12421 YBR220CYBR220C 1683 nt11.51□□□□□ -0.57
ATG31Q12421 FIS1YIL065C 468 nt11.5□□□□□ -0.57
ATG31Q12421 YJR018WYJR018W 363 nt11.46□□□□□ -0.57
ATG31Q12421 YMR090WYMR090W 684 nt11.41□□□□□ -0.58
ATG31Q12421 EMI2YDR516C 1503 nt11.4□□□□□ -0.58
ATG31Q12421 YPS1YLR120C 1710 nt11.4□□□□□ -0.58
ATG31Q12421 DAL1YIR027C 1383 nt11.4□□□□□ -0.59
ATG31Q12421 GAR1YHR089C 618 nt11.39□□□□□ -0.59
ATG31Q12421 PCH2YBR186W 1695 nt11.33□□□□□ -0.6
ATG31Q12421 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.31□□□□□ -0.6
ATG31Q12421 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.31□□□□□ -0.6
ATG31Q12421 GUT2YIL155C 1950 nt11.3□□□□□ -0.6
ATG31Q12421 PHO4YFR034C 939 nt11.3□□□□□ -0.6
ATG31Q12421 FPR4YLR449W 1179 nt11.3□□□□□ -0.6
ATG31Q12421 SDH1YKL148C 1923 nt11.29□□□□□ -0.6
ATG31Q12421 YDL221WYDL221W 552 nt11.26□□□□□ -0.61
ATG31Q12421 RSB1YOR049C 1065 nt11.26□□□□□ -0.61
ATG31Q12421 SEC11YIR022W 504 nt11.25□□□□□ -0.61
ATG31Q12421 YDR095CYDR095C 411 nt11.19□□□□□ -0.62
ATG31Q12421 Q0182Q0182 405 nt11.19□□□□□ -0.62
ATG31Q12421 INM2YDR287W 879 nt11.17□□□□□ -0.62
ATG31Q12421 FPS1YLL043W 2010 nt11.16□□□□□ -0.62
ATG31Q12421 YJR120WYJR120W 351 nt11.12□□□□□ -0.63
ATG31Q12421 PIB2YGL023C 1908 nt11.11□□□□□ -0.63
ATG31Q12421 SCC4YER147C 1875 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG31Q12421 CAC2YML102W 1407 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG31Q12421 TIR1YER011W 765 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG31Q12421 PTP1YDL230W 1008 nt11.02□□□□□ -0.65
ATG31Q12421 RPP2BYDR382W 333 nt11□□□□□ -0.65
ATG31Q12421 SSA1YAL005C 1929 nt10.97□□□□□ -0.65
ATG31Q12421 RPP2AYOL039W 321 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG31Q12421 RTF1YGL244W 1677 nt10.95□□□□□ -0.66
ATG31Q12421 IRC15YPL017C 1500 nt10.94□□□□□ -0.66
ATG31Q12421 YSC84YHR016C 1407 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG31Q12421 YBL100CYBL100C 315 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG31Q12421 UME6YDR207C 2511 nt10.92□□□□□ -0.66
ATG31Q12421 GIS3YLR094C 1509 nt10.87□□□□□ -0.67
ATG31Q12421 YJL225CYJL225C 5277 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG31Q12421 YHL050CYHL050C 2094 nt10.85□□□□□ -0.67
ATG31Q12421 BOR1YNL275W 1731 nt10.84□□□□□ -0.67
ATG31Q12421 BOP3YNL042W 1191 nt10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms