Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.33■■□□□ 1.01
YPQ1Q12010 NSR1YGR159C 1245 nt20.91■□□□□ 0.94
YPQ1Q12010 NOP1YDL014W 984 nt20.82■□□□□ 0.92
YPQ1Q12010 YKL036CYKL036C 393 nt19.52■□□□□ 0.72
YPQ1Q12010 Q0297Q0297 156 nt18.34■□□□□ 0.53
YPQ1Q12010 MDJ1YFL016C 1536 nt18.32■□□□□ 0.52
YPQ1Q12010 YJL027CYJL027C 417 nt18.28■□□□□ 0.52
YPQ1Q12010 SRX1YKL086W 384 nt18.21■□□□□ 0.51
YPQ1Q12010 SCS3YGL126W 1143 nt17.93■□□□□ 0.46
YPQ1Q12010 YCR051WYCR051W 669 nt17.32■□□□□ 0.36
YPQ1Q12010 YOL085CYOL085C 342 nt16.91■□□□□ 0.3
YPQ1Q12010 PKP1YIL042C 1185 nt16.64■□□□□ 0.25
YPQ1Q12010 RPP1BYDL130W 321 nt16.46■□□□□ 0.23
YPQ1Q12010 DBP2YNL112W 1641 nt16.34■□□□□ 0.21
YPQ1Q12010 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.29■□□□□ 0.2
YPQ1Q12010 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.29■□□□□ 0.2
YPQ1Q12010 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.29■□□□□ 0.2
YPQ1Q12010 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.29■□□□□ 0.2
YPQ1Q12010 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.29■□□□□ 0.2
YPQ1Q12010 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.29■□□□□ 0.2
YPQ1Q12010 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.29■□□□□ 0.2
YPQ1Q12010 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.29■□□□□ 0.2
YPQ1Q12010 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.29■□□□□ 0.2
YPQ1Q12010 SCJ1YMR214W 1134 nt16.23■□□□□ 0.19
YPQ1Q12010 CCC1YLR220W 969 nt16.16■□□□□ 0.18
YPQ1Q12010 ATS1YAL020C 1002 nt16.13■□□□□ 0.17
YPQ1Q12010 PET122YER153C 765 nt15.71■□□□□ 0.11
YPQ1Q12010 SCR1SCR1 522 nt15.6■□□□□ 0.09
YPQ1Q12010 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.52■□□□□ 0.08
YPQ1Q12010 YBR190WYBR190W 312 nt15.51■□□□□ 0.07
YPQ1Q12010 RVS167YDR388W 1449 nt15.38■□□□□ 0.05
YPQ1Q12010 RRN5YLR141W 1092 nt15.29■□□□□ 0.04
YPQ1Q12010 RTC3YHR087W 336 nt15.2■□□□□ 0.02
YPQ1Q12010 RSB1YOR049C 1065 nt15.06■□□□□ 0
YPQ1Q12010 YER088W-BYER088W-B 147 nt15□□□□□ -0.01
YPQ1Q12010 YDJ1YNL064C 1230 nt14.99□□□□□ -0.01
YPQ1Q12010 SHR5YOL110W 714 nt14.93□□□□□ -0.02
YPQ1Q12010 PST2YDR032C 597 nt14.88□□□□□ -0.03
YPQ1Q12010 GAR1YHR089C 618 nt14.64□□□□□ -0.07
YPQ1Q12010 DEP1YAL013W 1218 nt14.45□□□□□ -0.1
YPQ1Q12010 YKL097CYKL097C 411 nt14.45□□□□□ -0.1
YPQ1Q12010 URN1YPR152C 1398 nt14.34□□□□□ -0.11
YPQ1Q12010 SHU1YHL006C 453 nt14.22□□□□□ -0.13
YPQ1Q12010 YNL208WYNL208W 600 nt14.21□□□□□ -0.13
YPQ1Q12010 RPN10YHR200W 807 nt14.17□□□□□ -0.14
YPQ1Q12010 TIR1YER011W 765 nt14.13□□□□□ -0.15
YPQ1Q12010 OPI9YLR338W 858 nt14.06□□□□□ -0.16
YPQ1Q12010 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.93□□□□□ -0.18
YPQ1Q12010 SAH1YER043C 1350 nt13.92□□□□□ -0.18
YPQ1Q12010 SSA1YAL005C 1929 nt13.91□□□□□ -0.18
YPQ1Q12010 PUT4YOR348C 1884 nt13.87□□□□□ -0.19
YPQ1Q12010 YOR139CYOR139C 393 nt13.84□□□□□ -0.19
YPQ1Q12010 SRB2YHR041C 633 nt13.77□□□□□ -0.21
YPQ1Q12010 ARE1YCR048W 1833 nt13.72□□□□□ -0.21
YPQ1Q12010 YJR018WYJR018W 363 nt13.69□□□□□ -0.22
YPQ1Q12010 PUN1YLR414C 792 nt13.64□□□□□ -0.23
YPQ1Q12010 NPL3YDR432W 1245 nt13.62□□□□□ -0.23
YPQ1Q12010 YJR120WYJR120W 351 nt13.58□□□□□ -0.24
YPQ1Q12010 WWM1YFL010C 636 nt13.57□□□□□ -0.24
YPQ1Q12010 MNP1YGL068W 585 nt13.54□□□□□ -0.24
YPQ1Q12010 YGR021WYGR021W 873 nt13.54□□□□□ -0.24
YPQ1Q12010 HOM6YJR139C 1080 nt13.54□□□□□ -0.24
YPQ1Q12010 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.53□□□□□ -0.24
YPQ1Q12010 RPP2BYDR382W 333 nt13.48□□□□□ -0.25
YPQ1Q12010 POA1YBR022W 534 nt13.47□□□□□ -0.25
YPQ1Q12010 PTC2YER089C 1395 nt13.45□□□□□ -0.26
YPQ1Q12010 YOL037CYOL037C 354 nt13.4□□□□□ -0.26
YPQ1Q12010 RKM5YLR137W 1104 nt13.35□□□□□ -0.27
YPQ1Q12010 SSA3YBL075C 1950 nt13.31□□□□□ -0.28
YPQ1Q12010 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.31□□□□□ -0.28
YPQ1Q12010 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.28□□□□□ -0.28
YPQ1Q12010 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.28□□□□□ -0.28
YPQ1Q12010 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.28□□□□□ -0.28
YPQ1Q12010 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.28□□□□□ -0.28
YPQ1Q12010 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.28□□□□□ -0.28
YPQ1Q12010 BDH2YAL061W 1254 nt13.28□□□□□ -0.28
YPQ1Q12010 BUD23YCR047C 828 nt13.25□□□□□ -0.29
YPQ1Q12010 NAB2YGL122C 1578 nt13.2□□□□□ -0.3
YPQ1Q12010 INM2YDR287W 879 nt13.15□□□□□ -0.3
YPQ1Q12010 LSM3YLR438C-A 270 nt13.15□□□□□ -0.3
YPQ1Q12010 BSC6YOL137W 1494 nt13.1□□□□□ -0.31
YPQ1Q12010 DAL1YIR027C 1383 nt13.1□□□□□ -0.31
YPQ1Q12010 FPR4YLR449W 1179 nt13.1□□□□□ -0.31
YPQ1Q12010 YLR281CYLR281C 468 nt13.09□□□□□ -0.31
YPQ1Q12010 YBL100CYBL100C 315 nt13.09□□□□□ -0.31
YPQ1Q12010 PUS2YGL063W 1113 nt13.07□□□□□ -0.32
YPQ1Q12010 FIS1YIL065C 468 nt13.07□□□□□ -0.32
YPQ1Q12010 WHI5YOR083W 888 nt13.01□□□□□ -0.33
YPQ1Q12010 PHO4YFR034C 939 nt12.98□□□□□ -0.33
YPQ1Q12010 TRM9YML014W 840 nt12.98□□□□□ -0.33
YPQ1Q12010 FUN26YAL022C 1554 nt12.95□□□□□ -0.34
YPQ1Q12010 MOT3YMR070W 1473 nt12.86□□□□□ -0.35
YPQ1Q12010 CCT6YDR188W 1641 nt12.83□□□□□ -0.36
YPQ1Q12010 YPR011CYPR011C 981 nt12.79□□□□□ -0.36
YPQ1Q12010 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.76□□□□□ -0.37
YPQ1Q12010 DSK2YMR276W 1122 nt12.75□□□□□ -0.37
YPQ1Q12010 FMP45YDL222C 930 nt12.74□□□□□ -0.37
YPQ1Q12010 YLR236CYLR236C 324 nt12.73□□□□□ -0.37
YPQ1Q12010 ALF1YNL148C 765 nt12.69□□□□□ -0.38
YPQ1Q12010 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1587.3 ms