RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HAL9	YOL089C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	PCH2	P38126	564 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	FHL1	P39521	936 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	GAT2	P40209	560 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	PAC11	P40960	533 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YHC3	P47040	408 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	CDH1	P53197	566 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YDR541C	Q03049	344 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ARR1	Q06596	294 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	RMD5	Q12508	421 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	VHS2	P40463	436 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YNL146W	P53906	100 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SLT2	Q00772	484 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MSC3	Q05812	728 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	RAX1	Q08760	435 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MMT2	Q08970	484 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MHP1	P43638	1398 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MET5	P47169	1442 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SEC63	P14906	663 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	RPB5	P20434	215 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	PPQ1	P32945	549 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	SKT5	P34226	696 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	RRT13	P40042	185 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	YPS6	P40583	537 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	AIM33	Q04516	312 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	AAD15	Q08361	143 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	ERP4	Q12450	207 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	PDR10	P51533	1564 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HAL9	YOL089C	MMS1	Q06211	1407 aa		0.59	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	MSP1	P28737	362 aa		0.59	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	NFU1	P32860	256 aa		0.59	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	COX3	P00420	269 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	STE7	P06784	515 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	YLL053C	P0CD98	152 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	ERD1	P16151	362 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	URA10	P30402	227 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	LDS1	P31379	325 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	PDC2	P32896	925 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	SPO23	P33757	523 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	LTV1	P34078	463 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	YIL059C	P40520	121 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	BNS1	P50084	137 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	MPS2	P53159	387 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	CAX4	P53223	239 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	MFG1	Q07684	458 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	FRE6	Q12473	712 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	UBA3	Q99344	299 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	AUS1	Q08409	1394 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	GIT1	P25346	518 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	GPX2	P38143	162 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	PMT5	P52867	743 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	FAR10	Q06001	478 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	APC5	Q08683	685 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	RGS2	Q99188	309 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	ITR2	P30606	609 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	SMI1	P32566	505 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	RBG1	P39729	369 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	PGU1	P47180	361 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	YDR114C	Q04597	100 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	GAT3	Q07928	141 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	ATP16	Q12165	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	RUP1	Q12242	671 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	FSH3	Q99369	266 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	SNT2	P53127	1403 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	GEX1	P25596	615 aa		0.57	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	CIN8	P27895	1000 aa		0.57	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
HAL9	YOL089C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32

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