Protein–RNA interactions for Protein: P34226

SKT5, Protein SKT5, yeastyeast

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKT5P34226 NSR1YGR159C 1245 nt20.09■□□□□ 0.81
SKT5P34226 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.07■□□□□ 0.8
SKT5P34226 NOP1YDL014W 984 nt19.44■□□□□ 0.7
SKT5P34226 MDJ1YFL016C 1536 nt17.98■□□□□ 0.47
SKT5P34226 YKL036CYKL036C 393 nt17.89■□□□□ 0.45
SKT5P34226 SRX1YKL086W 384 nt16.99■□□□□ 0.31
SKT5P34226 Q0297Q0297 156 nt16.96■□□□□ 0.31
SKT5P34226 YJL027CYJL027C 417 nt16.71■□□□□ 0.27
SKT5P34226 SCS3YGL126W 1143 nt16.25■□□□□ 0.19
SKT5P34226 YCR051WYCR051W 669 nt16.1■□□□□ 0.17
SKT5P34226 DBP2YNL112W 1641 nt15.85■□□□□ 0.13
SKT5P34226 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.46■□□□□ 0.07
SKT5P34226 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.46■□□□□ 0.07
SKT5P34226 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.46■□□□□ 0.07
SKT5P34226 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.46■□□□□ 0.07
SKT5P34226 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.46■□□□□ 0.07
SKT5P34226 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.46■□□□□ 0.07
SKT5P34226 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.46■□□□□ 0.07
SKT5P34226 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.46■□□□□ 0.07
SKT5P34226 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.46■□□□□ 0.07
SKT5P34226 YOL085CYOL085C 342 nt15.45■□□□□ 0.06
SKT5P34226 YBR190WYBR190W 312 nt15.38■□□□□ 0.05
SKT5P34226 CCC1YLR220W 969 nt15.29■□□□□ 0.04
SKT5P34226 RPP1BYDL130W 321 nt15.22■□□□□ 0.03
SKT5P34226 PKP1YIL042C 1185 nt15.19■□□□□ 0.02
SKT5P34226 RTC3YHR087W 336 nt15.03■□□□□ -0
SKT5P34226 RVS167YDR388W 1449 nt14.87□□□□□ -0.03
SKT5P34226 SCJ1YMR214W 1134 nt14.75□□□□□ -0.05
SKT5P34226 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.57□□□□□ -0.08
SKT5P34226 ATS1YAL020C 1002 nt14.57□□□□□ -0.08
SKT5P34226 PET122YER153C 765 nt14.56□□□□□ -0.08
SKT5P34226 SCR1SCR1 522 nt14.44□□□□□ -0.1
SKT5P34226 SHR5YOL110W 714 nt14.31□□□□□ -0.12
SKT5P34226 RRN5YLR141W 1092 nt14.13□□□□□ -0.15
SKT5P34226 YDJ1YNL064C 1230 nt14.1□□□□□ -0.15
SKT5P34226 PUT4YOR348C 1884 nt14.09□□□□□ -0.15
SKT5P34226 URN1YPR152C 1398 nt14.01□□□□□ -0.17
SKT5P34226 DEP1YAL013W 1218 nt13.96□□□□□ -0.17
SKT5P34226 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.85□□□□□ -0.19
SKT5P34226 OPI9YLR338W 858 nt13.84□□□□□ -0.19
SKT5P34226 RSB1YOR049C 1065 nt13.83□□□□□ -0.2
SKT5P34226 GAR1YHR089C 618 nt13.81□□□□□ -0.2
SKT5P34226 SAH1YER043C 1350 nt13.79□□□□□ -0.2
SKT5P34226 ARE1YCR048W 1833 nt13.78□□□□□ -0.2
SKT5P34226 RPN10YHR200W 807 nt13.77□□□□□ -0.21
SKT5P34226 YNL208WYNL208W 600 nt13.72□□□□□ -0.21
SKT5P34226 POA1YBR022W 534 nt13.63□□□□□ -0.23
SKT5P34226 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.61□□□□□ -0.23
SKT5P34226 SSA3YBL075C 1950 nt13.49□□□□□ -0.25
SKT5P34226 PST2YDR032C 597 nt13.47□□□□□ -0.25
SKT5P34226 PUN1YLR414C 792 nt13.44□□□□□ -0.26
SKT5P34226 BSC6YOL137W 1494 nt13.37□□□□□ -0.27
SKT5P34226 YJR018WYJR018W 363 nt13.36□□□□□ -0.27
SKT5P34226 TIR1YER011W 765 nt13.35□□□□□ -0.27
SKT5P34226 PTC2YER089C 1395 nt13.31□□□□□ -0.28
SKT5P34226 BUD23YCR047C 828 nt13.28□□□□□ -0.28
SKT5P34226 SSA1YAL005C 1929 nt13.23□□□□□ -0.29
SKT5P34226 NAB2YGL122C 1578 nt13.15□□□□□ -0.3
SKT5P34226 YJR120WYJR120W 351 nt13.11□□□□□ -0.31
SKT5P34226 RPP2BYDR382W 333 nt13.05□□□□□ -0.32
SKT5P34226 YKL097CYKL097C 411 nt13.02□□□□□ -0.33
SKT5P34226 SRB2YHR041C 633 nt12.97□□□□□ -0.33
SKT5P34226 DAL1YIR027C 1383 nt12.95□□□□□ -0.34
SKT5P34226 FIS1YIL065C 468 nt12.95□□□□□ -0.34
SKT5P34226 FPR4YLR449W 1179 nt12.91□□□□□ -0.34
SKT5P34226 INM2YDR287W 879 nt12.9□□□□□ -0.34
SKT5P34226 SHU1YHL006C 453 nt12.88□□□□□ -0.35
SKT5P34226 SPT5YML010W 3192 nt12.86□□□□□ -0.35
SKT5P34226 PHO4YFR034C 939 nt12.83□□□□□ -0.36
SKT5P34226 BDH2YAL061W 1254 nt12.76□□□□□ -0.37
SKT5P34226 YBL100CYBL100C 315 nt12.75□□□□□ -0.37
SKT5P34226 WWM1YFL010C 636 nt12.73□□□□□ -0.37
SKT5P34226 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.66□□□□□ -0.38
SKT5P34226 YPS1YLR120C 1710 nt12.64□□□□□ -0.39
SKT5P34226 YGR021WYGR021W 873 nt12.61□□□□□ -0.39
SKT5P34226 FUN26YAL022C 1554 nt12.6□□□□□ -0.39
SKT5P34226 MEP2YNL142W 1500 nt12.57□□□□□ -0.4
SKT5P34226 HOM6YJR139C 1080 nt12.56□□□□□ -0.4
SKT5P34226 LSM3YLR438C-A 270 nt12.56□□□□□ -0.4
SKT5P34226 TRM9YML014W 840 nt12.55□□□□□ -0.4
SKT5P34226 YDR095CYDR095C 411 nt12.53□□□□□ -0.4
SKT5P34226 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.53□□□□□ -0.4
SKT5P34226 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.5□□□□□ -0.41
SKT5P34226 MNP1YGL068W 585 nt12.48□□□□□ -0.41
SKT5P34226 SSA4YER103W 1929 nt12.45□□□□□ -0.42
SKT5P34226 ALF1YNL148C 765 nt12.45□□□□□ -0.42
SKT5P34226 CCT6YDR188W 1641 nt12.43□□□□□ -0.42
SKT5P34226 NPL3YDR432W 1245 nt12.39□□□□□ -0.43
SKT5P34226 YOR139CYOR139C 393 nt12.39□□□□□ -0.43
SKT5P34226 RKM5YLR137W 1104 nt12.38□□□□□ -0.43
SKT5P34226 DCW1YKL046C 1350 nt12.36□□□□□ -0.43
SKT5P34226 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.34□□□□□ -0.43
SKT5P34226 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.34□□□□□ -0.43
SKT5P34226 YOL037CYOL037C 354 nt12.31□□□□□ -0.44
SKT5P34226 RPP2AYOL039W 321 nt12.3□□□□□ -0.44
SKT5P34226 SIS1YNL007C 1059 nt12.27□□□□□ -0.45
SKT5P34226 PTP1YDL230W 1008 nt12.26□□□□□ -0.45
SKT5P34226 EMI2YDR516C 1503 nt12.21□□□□□ -0.45
SKT5P34226 CAC2YML102W 1407 nt12.18□□□□□ -0.46
SKT5P34226 YMR090WYMR090W 684 nt12.14□□□□□ -0.47
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