Protein–RNA interactions for Protein: Q12473

FRE6, Ferric reductase transmembrane component 6, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FRE6Q12473 NSR1YGR159C 1245 nt18.07■□□□□ 0.48
FRE6Q12473 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.9■□□□□ 0.46
FRE6Q12473 NOP1YDL014W 984 nt17.24■□□□□ 0.35
FRE6Q12473 MDJ1YFL016C 1536 nt16.44■□□□□ 0.22
FRE6Q12473 YKL036CYKL036C 393 nt15.55■□□□□ 0.08
FRE6Q12473 YJL027CYJL027C 417 nt15.14■□□□□ 0.01
FRE6Q12473 SRX1YKL086W 384 nt15.03■□□□□ -0
FRE6Q12473 Q0297Q0297 156 nt14.93□□□□□ -0.02
FRE6Q12473 DBP2YNL112W 1641 nt14.34□□□□□ -0.11
FRE6Q12473 YCR051WYCR051W 669 nt14.28□□□□□ -0.12
FRE6Q12473 YBR190WYBR190W 312 nt14.09□□□□□ -0.15
FRE6Q12473 SCS3YGL126W 1143 nt13.95□□□□□ -0.18
FRE6Q12473 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.82□□□□□ -0.2
FRE6Q12473 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.82□□□□□ -0.2
FRE6Q12473 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.82□□□□□ -0.2
FRE6Q12473 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.82□□□□□ -0.2
FRE6Q12473 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.82□□□□□ -0.2
FRE6Q12473 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.82□□□□□ -0.2
FRE6Q12473 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.82□□□□□ -0.2
FRE6Q12473 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.82□□□□□ -0.2
FRE6Q12473 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.82□□□□□ -0.2
FRE6Q12473 RTC3YHR087W 336 nt13.81□□□□□ -0.2
FRE6Q12473 CCC1YLR220W 969 nt13.72□□□□□ -0.21
FRE6Q12473 YOL085CYOL085C 342 nt13.47□□□□□ -0.25
FRE6Q12473 RVS167YDR388W 1449 nt13.46□□□□□ -0.26
FRE6Q12473 RPP1BYDL130W 321 nt13.42□□□□□ -0.26
FRE6Q12473 PKP1YIL042C 1185 nt13.34□□□□□ -0.27
FRE6Q12473 SCJ1YMR214W 1134 nt13.29□□□□□ -0.28
FRE6Q12473 SSA3YBL075C 1950 nt13.18□□□□□ -0.3
FRE6Q12473 PUT4YOR348C 1884 nt13.06□□□□□ -0.32
FRE6Q12473 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.96□□□□□ -0.33
FRE6Q12473 SHR5YOL110W 714 nt12.88□□□□□ -0.35
FRE6Q12473 PET122YER153C 765 nt12.87□□□□□ -0.35
FRE6Q12473 URN1YPR152C 1398 nt12.76□□□□□ -0.37
FRE6Q12473 ARE1YCR048W 1833 nt12.72□□□□□ -0.37
FRE6Q12473 DEP1YAL013W 1218 nt12.67□□□□□ -0.38
FRE6Q12473 POA1YBR022W 534 nt12.66□□□□□ -0.38
FRE6Q12473 SAH1YER043C 1350 nt12.66□□□□□ -0.38
FRE6Q12473 Q0182Q0182 405 nt12.65□□□□□ -0.38
FRE6Q12473 SCR1SCR1 522 nt12.65□□□□□ -0.38
FRE6Q12473 OPI9YLR338W 858 nt12.63□□□□□ -0.39
FRE6Q12473 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.59□□□□□ -0.39
FRE6Q12473 YDJ1YNL064C 1230 nt12.52□□□□□ -0.41
FRE6Q12473 RPN10YHR200W 807 nt12.5□□□□□ -0.41
FRE6Q12473 RRN5YLR141W 1092 nt12.45□□□□□ -0.42
FRE6Q12473 BSC6YOL137W 1494 nt12.45□□□□□ -0.42
FRE6Q12473 YNL208WYNL208W 600 nt12.41□□□□□ -0.42
FRE6Q12473 ATS1YAL020C 1002 nt12.37□□□□□ -0.43
FRE6Q12473 GAR1YHR089C 618 nt12.34□□□□□ -0.43
FRE6Q12473 BUD23YCR047C 828 nt12.29□□□□□ -0.44
FRE6Q12473 PUN1YLR414C 792 nt12.27□□□□□ -0.45
FRE6Q12473 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.21□□□□□ -0.45
FRE6Q12473 PTC2YER089C 1395 nt12.19□□□□□ -0.46
FRE6Q12473 YJR018WYJR018W 363 nt12.14□□□□□ -0.47
FRE6Q12473 RSB1YOR049C 1065 nt12.12□□□□□ -0.47
FRE6Q12473 NAB2YGL122C 1578 nt12.08□□□□□ -0.48
FRE6Q12473 SPT5YML010W 3192 nt12.04□□□□□ -0.48
FRE6Q12473 TIR1YER011W 765 nt11.93□□□□□ -0.5
FRE6Q12473 MOT3YMR070W 1473 nt11.89□□□□□ -0.51
FRE6Q12473 FIS1YIL065C 468 nt11.87□□□□□ -0.51
FRE6Q12473 FPR4YLR449W 1179 nt11.86□□□□□ -0.51
FRE6Q12473 SSA4YER103W 1929 nt11.86□□□□□ -0.51
FRE6Q12473 DAL1YIR027C 1383 nt11.85□□□□□ -0.51
FRE6Q12473 SSA1YAL005C 1929 nt11.85□□□□□ -0.51
FRE6Q12473 YJR120WYJR120W 351 nt11.84□□□□□ -0.51
FRE6Q12473 RPP2BYDR382W 333 nt11.82□□□□□ -0.52
FRE6Q12473 INM2YDR287W 879 nt11.75□□□□□ -0.53
FRE6Q12473 PHO4YFR034C 939 nt11.74□□□□□ -0.53
FRE6Q12473 MEP2YNL142W 1500 nt11.7□□□□□ -0.54
FRE6Q12473 YPS1YLR120C 1710 nt11.63□□□□□ -0.55
FRE6Q12473 YBL100CYBL100C 315 nt11.6□□□□□ -0.55
FRE6Q12473 SRB2YHR041C 633 nt11.57□□□□□ -0.56
FRE6Q12473 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.57□□□□□ -0.56
FRE6Q12473 DCW1YKL046C 1350 nt11.53□□□□□ -0.56
FRE6Q12473 PST2YDR032C 597 nt11.5□□□□□ -0.57
FRE6Q12473 YDR095CYDR095C 411 nt11.49□□□□□ -0.57
FRE6Q12473 BDH2YAL061W 1254 nt11.49□□□□□ -0.57
FRE6Q12473 FUN26YAL022C 1554 nt11.44□□□□□ -0.58
FRE6Q12473 BDF1YLR399C 2061 nt11.39□□□□□ -0.59
FRE6Q12473 ALF1YNL148C 765 nt11.38□□□□□ -0.59
FRE6Q12473 EMI2YDR516C 1503 nt11.37□□□□□ -0.59
FRE6Q12473 WWM1YFL010C 636 nt11.34□□□□□ -0.59
FRE6Q12473 TRM9YML014W 840 nt11.34□□□□□ -0.59
FRE6Q12473 YMR090WYMR090W 684 nt11.34□□□□□ -0.59
FRE6Q12473 RPP2AYOL039W 321 nt11.29□□□□□ -0.6
FRE6Q12473 YDL221WYDL221W 552 nt11.26□□□□□ -0.61
FRE6Q12473 LSM3YLR438C-A 270 nt11.26□□□□□ -0.61
FRE6Q12473 YBR220CYBR220C 1683 nt11.26□□□□□ -0.61
FRE6Q12473 PTP1YDL230W 1008 nt11.25□□□□□ -0.61
FRE6Q12473 CAC2YML102W 1407 nt11.25□□□□□ -0.61
FRE6Q12473 TAT1YBR069C 1860 nt11.24□□□□□ -0.61
FRE6Q12473 CCT6YDR188W 1641 nt11.24□□□□□ -0.61
FRE6Q12473 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.19□□□□□ -0.62
FRE6Q12473 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.19□□□□□ -0.62
FRE6Q12473 SDH1YKL148C 1923 nt11.17□□□□□ -0.62
FRE6Q12473 YGR021WYGR021W 873 nt11.17□□□□□ -0.62
FRE6Q12473 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.16□□□□□ -0.62
FRE6Q12473 SIS1YNL007C 1059 nt11.16□□□□□ -0.62
FRE6Q12473 SHU1YHL006C 453 nt11.14□□□□□ -0.63
FRE6Q12473 FPS1YLL043W 2010 nt11.13□□□□□ -0.63
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