RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	SER3	P40054	469 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YER188W	P40103	239 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	GAB1	P41733	394 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ZIM17	P42844	174 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	NBP35	P52920	328 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	BUD32	P53323	261 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PRM1	P53835	661 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	GOR1	P53839	350 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ALF1	P53904	254 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CDD1	Q06549	142 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ATG10	Q07879	167 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RIM20	Q12033	661 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	TPO4	Q12256	659 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	HSP42	Q12329	375 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CEX1	Q12453	761 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	STT4	P37297	1900 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	JIP3	O13555	125 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SEC63	P14906	663 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PPH21	P23594	369 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ADH7	P25377	361 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	IMG1	P25626	169 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SIN4	P32259	974 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	HIR2	P32480	875 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	FMT1	P32785	401 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YKL102C	P34249	101 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PSY4	P38193	441 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SIP3	P38717	1229 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YHL044W	P38727	235 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YHR210C	P38893	341 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	0.95	□□□□□ -2.26	RIP-Chip
PAM16	YJL104W	SAP185	P40856	1058 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CUP9	P41817	306 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RAD17	P48581	401 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	TOM22	P49334	152 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SWC4	P53201	476 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RTC4	P53850	401 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YNL143C	P53908	130 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	GRX8	Q05926	109 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YPR114W	Q06107	315 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	TEN1	Q07921	160 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SIL1	Q08199	421 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	TRM8	Q12009	286 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YOR019W	Q99248	730 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	VCX1	Q99385	411 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	BLM10	P43583	2143 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YBR085C-A	O43137	85 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	GEX1	P25596	615 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PEP3	P27801	918 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	NDI1	P32340	513 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	KRE6	P32486	720 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	IME2	P32581	645 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	SWI3	P32591	825 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	MNS1	P32906	549 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PMT1	P33775	817 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YHL041W	P38730	149 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	TDA11	P38854	504 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YHR182W	P38870	785 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	FET3	P38993	636 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	GDS1	P41913	522 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	NCA3	P46955	337 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	AVT4	P50944	713 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	EMC4	P53073	190 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YGL138C	P53122	345 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RPN14	P53196	417 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RSC1	P53236	928 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CBK1	P53894	756 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ARP5	P53946	755 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	VAC7	P53950	1165 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	UBX4	P54730	416 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	CCE1	Q03702	353 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	EMI1	Q04406	187 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RCO1	Q04779	684 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	YLR012C	Q07927	99 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	IRC25	Q07951	179 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	PLB3	Q08108	686 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PAM16	YJL104W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms