Protein–RNA interactions for Protein: Q12256

TPO4, Polyamine transporter 4, yeastyeast

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPO4Q12256 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.89■□□□□ 0.61
TPO4Q12256 NSR1YGR159C 1245 nt18.63■□□□□ 0.57
TPO4Q12256 NOP1YDL014W 984 nt18.51■□□□□ 0.55
TPO4Q12256 YKL036CYKL036C 393 nt17.28■□□□□ 0.36
TPO4Q12256 MDJ1YFL016C 1536 nt16.74■□□□□ 0.27
TPO4Q12256 Q0297Q0297 156 nt16.28■□□□□ 0.2
TPO4Q12256 SRX1YKL086W 384 nt16.17■□□□□ 0.18
TPO4Q12256 YJL027CYJL027C 417 nt16.16■□□□□ 0.18
TPO4Q12256 SCS3YGL126W 1143 nt15.81■□□□□ 0.12
TPO4Q12256 YCR051WYCR051W 669 nt15.32■□□□□ 0.04
TPO4Q12256 YOL085CYOL085C 342 nt14.94□□□□□ -0.02
TPO4Q12256 DBP2YNL112W 1641 nt14.69□□□□□ -0.06
TPO4Q12256 PKP1YIL042C 1185 nt14.64□□□□□ -0.07
TPO4Q12256 RPP1BYDL130W 321 nt14.59□□□□□ -0.07
TPO4Q12256 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.47□□□□□ -0.09
TPO4Q12256 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.47□□□□□ -0.09
TPO4Q12256 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.47□□□□□ -0.09
TPO4Q12256 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.47□□□□□ -0.09
TPO4Q12256 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.47□□□□□ -0.09
TPO4Q12256 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.47□□□□□ -0.09
TPO4Q12256 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.47□□□□□ -0.09
TPO4Q12256 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.47□□□□□ -0.09
TPO4Q12256 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.47□□□□□ -0.09
TPO4Q12256 SCJ1YMR214W 1134 nt14.37□□□□□ -0.11
TPO4Q12256 YBR190WYBR190W 312 nt14.34□□□□□ -0.11
TPO4Q12256 CCC1YLR220W 969 nt14.28□□□□□ -0.12
TPO4Q12256 ATS1YAL020C 1002 nt14.21□□□□□ -0.13
TPO4Q12256 RTC3YHR087W 336 nt14.02□□□□□ -0.17
TPO4Q12256 PET122YER153C 765 nt13.88□□□□□ -0.19
TPO4Q12256 SCR1SCR1 522 nt13.84□□□□□ -0.19
TPO4Q12256 RVS167YDR388W 1449 nt13.82□□□□□ -0.2
TPO4Q12256 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.76□□□□□ -0.21
TPO4Q12256 RRN5YLR141W 1092 nt13.51□□□□□ -0.25
TPO4Q12256 YDJ1YNL064C 1230 nt13.34□□□□□ -0.27
TPO4Q12256 RSB1YOR049C 1065 nt13.3□□□□□ -0.28
TPO4Q12256 SHR5YOL110W 714 nt13.29□□□□□ -0.28
TPO4Q12256 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.25□□□□□ -0.29
TPO4Q12256 PUT4YOR348C 1884 nt13.19□□□□□ -0.3
TPO4Q12256 PST2YDR032C 597 nt13.13□□□□□ -0.31
TPO4Q12256 URN1YPR152C 1398 nt13.04□□□□□ -0.32
TPO4Q12256 GAR1YHR089C 618 nt12.95□□□□□ -0.34
TPO4Q12256 DEP1YAL013W 1218 nt12.94□□□□□ -0.34
TPO4Q12256 SSA3YBL075C 1950 nt12.9□□□□□ -0.34
TPO4Q12256 ARE1YCR048W 1833 nt12.88□□□□□ -0.35
TPO4Q12256 OPI9YLR338W 858 nt12.88□□□□□ -0.35
TPO4Q12256 SAH1YER043C 1350 nt12.85□□□□□ -0.35
TPO4Q12256 RPN10YHR200W 807 nt12.82□□□□□ -0.36
TPO4Q12256 POA1YBR022W 534 nt12.76□□□□□ -0.37
TPO4Q12256 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.75□□□□□ -0.37
TPO4Q12256 YKL097CYKL097C 411 nt12.74□□□□□ -0.37
TPO4Q12256 YNL208WYNL208W 600 nt12.74□□□□□ -0.37
TPO4Q12256 BSC6YOL137W 1494 nt12.54□□□□□ -0.4
TPO4Q12256 TIR1YER011W 765 nt12.53□□□□□ -0.4
TPO4Q12256 PUN1YLR414C 792 nt12.53□□□□□ -0.4
TPO4Q12256 SHU1YHL006C 453 nt12.52□□□□□ -0.41
TPO4Q12256 BUD23YCR047C 828 nt12.43□□□□□ -0.42
TPO4Q12256 YJR018WYJR018W 363 nt12.41□□□□□ -0.42
TPO4Q12256 PTC2YER089C 1395 nt12.4□□□□□ -0.42
TPO4Q12256 SSA1YAL005C 1929 nt12.31□□□□□ -0.44
TPO4Q12256 NAB2YGL122C 1578 nt12.27□□□□□ -0.44
TPO4Q12256 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.22□□□□□ -0.45
TPO4Q12256 YOR139CYOR139C 393 nt12.16□□□□□ -0.46
TPO4Q12256 YJR120WYJR120W 351 nt12.15□□□□□ -0.46
TPO4Q12256 RPP2BYDR382W 333 nt12.13□□□□□ -0.47
TPO4Q12256 SRB2YHR041C 633 nt12.1□□□□□ -0.47
TPO4Q12256 FIS1YIL065C 468 nt12.09□□□□□ -0.47
TPO4Q12256 DAL1YIR027C 1383 nt12.07□□□□□ -0.48
TPO4Q12256 SPT5YML010W 3192 nt12.07□□□□□ -0.48
TPO4Q12256 YGR021WYGR021W 873 nt12.05□□□□□ -0.48
TPO4Q12256 NPL3YDR432W 1245 nt12.04□□□□□ -0.48
TPO4Q12256 FPR4YLR449W 1179 nt12.04□□□□□ -0.48
TPO4Q12256 INM2YDR287W 879 nt12□□□□□ -0.49
TPO4Q12256 HOM6YJR139C 1080 nt12□□□□□ -0.49
TPO4Q12256 WWM1YFL010C 636 nt11.99□□□□□ -0.49
TPO4Q12256 PHO4YFR034C 939 nt11.97□□□□□ -0.49
TPO4Q12256 MNP1YGL068W 585 nt11.92□□□□□ -0.5
TPO4Q12256 YOL037CYOL037C 354 nt11.9□□□□□ -0.5
TPO4Q12256 YBL100CYBL100C 315 nt11.87□□□□□ -0.51
TPO4Q12256 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.85□□□□□ -0.51
TPO4Q12256 BDH2YAL061W 1254 nt11.83□□□□□ -0.52
TPO4Q12256 RKM5YLR137W 1104 nt11.82□□□□□ -0.52
TPO4Q12256 YPS1YLR120C 1710 nt11.8□□□□□ -0.52
TPO4Q12256 MEP2YNL142W 1500 nt11.79□□□□□ -0.52
TPO4Q12256 SSA4YER103W 1929 nt11.78□□□□□ -0.52
TPO4Q12256 LSM3YLR438C-A 270 nt11.74□□□□□ -0.53
TPO4Q12256 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.71□□□□□ -0.53
TPO4Q12256 FUN26YAL022C 1554 nt11.71□□□□□ -0.54
TPO4Q12256 YDR095CYDR095C 411 nt11.7□□□□□ -0.54
TPO4Q12256 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.68□□□□□ -0.54
TPO4Q12256 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.68□□□□□ -0.54
TPO4Q12256 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.68□□□□□ -0.54
TPO4Q12256 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.68□□□□□ -0.54
TPO4Q12256 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.68□□□□□ -0.54
TPO4Q12256 TRM9YML014W 840 nt11.64□□□□□ -0.55
TPO4Q12256 ALF1YNL148C 765 nt11.61□□□□□ -0.55
TPO4Q12256 DCW1YKL046C 1350 nt11.59□□□□□ -0.55
TPO4Q12256 YLR281CYLR281C 468 nt11.57□□□□□ -0.56
TPO4Q12256 CCT6YDR188W 1641 nt11.53□□□□□ -0.56
TPO4Q12256 PUS2YGL063W 1113 nt11.51□□□□□ -0.57
TPO4Q12256 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.48□□□□□ -0.57
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