Protein–RNA interactions for Protein: P38727

YHL044W, DUP240 protein YHL044W, yeastyeast

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL044WP38727 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.25■□□□□ 0.35
YHL044WP38727 NSR1YGR159C 1245 nt17.05■□□□□ 0.32
YHL044WP38727 NOP1YDL014W 984 nt17.03■□□□□ 0.32
YHL044WP38727 YKL036CYKL036C 393 nt15.82■□□□□ 0.12
YHL044WP38727 Q0297Q0297 156 nt14.88□□□□□ -0.03
YHL044WP38727 YJL027CYJL027C 417 nt14.78□□□□□ -0.04
YHL044WP38727 SRX1YKL086W 384 nt14.78□□□□□ -0.04
YHL044WP38727 MDJ1YFL016C 1536 nt14.73□□□□□ -0.05
YHL044WP38727 SCS3YGL126W 1143 nt14.39□□□□□ -0.11
YHL044WP38727 YCR051WYCR051W 669 nt14.01□□□□□ -0.17
YHL044WP38727 YOL085CYOL085C 342 nt13.62□□□□□ -0.23
YHL044WP38727 RPP1BYDL130W 321 nt13.35□□□□□ -0.27
YHL044WP38727 PKP1YIL042C 1185 nt13.3□□□□□ -0.28
YHL044WP38727 SCJ1YMR214W 1134 nt13.22□□□□□ -0.29
YHL044WP38727 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.17□□□□□ -0.3
YHL044WP38727 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.17□□□□□ -0.3
YHL044WP38727 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.17□□□□□ -0.3
YHL044WP38727 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.17□□□□□ -0.3
YHL044WP38727 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.17□□□□□ -0.3
YHL044WP38727 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.17□□□□□ -0.3
YHL044WP38727 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.17□□□□□ -0.3
YHL044WP38727 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.17□□□□□ -0.3
YHL044WP38727 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.17□□□□□ -0.3
YHL044WP38727 DBP2YNL112W 1641 nt13.1□□□□□ -0.31
YHL044WP38727 CCC1YLR220W 969 nt13.02□□□□□ -0.33
YHL044WP38727 ATS1YAL020C 1002 nt12.98□□□□□ -0.33
YHL044WP38727 SCR1SCR1 522 nt12.75□□□□□ -0.37
YHL044WP38727 SSA3YBL075C 1950 nt12.72□□□□□ -0.37
YHL044WP38727 YBR190WYBR190W 312 nt12.67□□□□□ -0.38
YHL044WP38727 RVS167YDR388W 1449 nt12.63□□□□□ -0.39
YHL044WP38727 PET122YER153C 765 nt12.63□□□□□ -0.39
YHL044WP38727 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YHL044WP38727 RTC3YHR087W 336 nt12.38□□□□□ -0.43
YHL044WP38727 RRN5YLR141W 1092 nt12.32□□□□□ -0.44
YHL044WP38727 YDJ1YNL064C 1230 nt12.21□□□□□ -0.45
YHL044WP38727 RSB1YOR049C 1065 nt12.17□□□□□ -0.46
YHL044WP38727 SHR5YOL110W 714 nt12.16□□□□□ -0.46
YHL044WP38727 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.07□□□□□ -0.48
YHL044WP38727 PST2YDR032C 597 nt11.97□□□□□ -0.49
YHL044WP38727 GAR1YHR089C 618 nt11.81□□□□□ -0.52
YHL044WP38727 RPN10YHR200W 807 nt11.68□□□□□ -0.54
YHL044WP38727 YKL097CYKL097C 411 nt11.67□□□□□ -0.54
YHL044WP38727 URN1YPR152C 1398 nt11.63□□□□□ -0.55
YHL044WP38727 DEP1YAL013W 1218 nt11.6□□□□□ -0.55
YHL044WP38727 YNL208WYNL208W 600 nt11.6□□□□□ -0.55
YHL044WP38727 OPI9YLR338W 858 nt11.45□□□□□ -0.58
YHL044WP38727 TIR1YER011W 765 nt11.44□□□□□ -0.58
YHL044WP38727 SHU1YHL006C 453 nt11.37□□□□□ -0.59
YHL044WP38727 SAH1YER043C 1350 nt11.23□□□□□ -0.61
YHL044WP38727 PUT4YOR348C 1884 nt11.19□□□□□ -0.62
YHL044WP38727 PUN1YLR414C 792 nt11.19□□□□□ -0.62
YHL044WP38727 SSA1YAL005C 1929 nt11.15□□□□□ -0.62
YHL044WP38727 YJR018WYJR018W 363 nt11.14□□□□□ -0.63
YHL044WP38727 RPP2BYDR382W 333 nt11.1□□□□□ -0.63
YHL044WP38727 YGR021WYGR021W 873 nt11.09□□□□□ -0.63
YHL044WP38727 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.07□□□□□ -0.64
YHL044WP38727 ARE1YCR048W 1833 nt11.05□□□□□ -0.64
YHL044WP38727 NPL3YDR432W 1245 nt11.05□□□□□ -0.64
YHL044WP38727 YOR139CYOR139C 393 nt11.02□□□□□ -0.65
YHL044WP38727 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.94□□□□□ -0.66
YHL044WP38727 HOM6YJR139C 1080 nt10.91□□□□□ -0.66
YHL044WP38727 YOL037CYOL037C 354 nt10.91□□□□□ -0.66
YHL044WP38727 PTC2YER089C 1395 nt10.9□□□□□ -0.66
YHL044WP38727 WWM1YFL010C 636 nt10.89□□□□□ -0.67
YHL044WP38727 POA1YBR022W 534 nt10.89□□□□□ -0.67
YHL044WP38727 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.85□□□□□ -0.67
YHL044WP38727 SRB2YHR041C 633 nt10.84□□□□□ -0.67
YHL044WP38727 YJR120WYJR120W 351 nt10.82□□□□□ -0.68
YHL044WP38727 BDH2YAL061W 1254 nt10.82□□□□□ -0.68
YHL044WP38727 SSA4YER103W 1929 nt10.82□□□□□ -0.68
YHL044WP38727 PAC11YDR488C 1602 nt10.81□□□□□ -0.68
YHL044WP38727 INM2YDR287W 879 nt10.81□□□□□ -0.68
YHL044WP38727 NAB2YGL122C 1578 nt10.81□□□□□ -0.68
YHL044WP38727 MNP1YGL068W 585 nt10.8□□□□□ -0.68
YHL044WP38727 LSM3YLR438C-A 270 nt10.79□□□□□ -0.68
YHL044WP38727 RKM5YLR137W 1104 nt10.77□□□□□ -0.69
YHL044WP38727 BUD23YCR047C 828 nt10.74□□□□□ -0.69
YHL044WP38727 DAL1YIR027C 1383 nt10.69□□□□□ -0.7
YHL044WP38727 NVJ2YPR091C 2313 nt10.67□□□□□ -0.7
YHL044WP38727 YBL100CYBL100C 315 nt10.65□□□□□ -0.7
YHL044WP38727 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.63□□□□□ -0.71
YHL044WP38727 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.63□□□□□ -0.71
YHL044WP38727 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.63□□□□□ -0.71
YHL044WP38727 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.63□□□□□ -0.71
YHL044WP38727 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.63□□□□□ -0.71
YHL044WP38727 FPR4YLR449W 1179 nt10.63□□□□□ -0.71
YHL044WP38727 TRM9YML014W 840 nt10.63□□□□□ -0.71
YHL044WP38727 SPT5YML010W 3192 nt10.63□□□□□ -0.71
YHL044WP38727 BSC6YOL137W 1494 nt10.61□□□□□ -0.71
YHL044WP38727 YLR281CYLR281C 468 nt10.56□□□□□ -0.72
YHL044WP38727 FIS1YIL065C 468 nt10.54□□□□□ -0.72
YHL044WP38727 PHO4YFR034C 939 nt10.53□□□□□ -0.72
YHL044WP38727 PUS2YGL063W 1113 nt10.52□□□□□ -0.73
YHL044WP38727 BDF1YLR399C 2061 nt10.52□□□□□ -0.73
YHL044WP38727 FUN26YAL022C 1554 nt10.51□□□□□ -0.73
YHL044WP38727 WHI5YOR083W 888 nt10.48□□□□□ -0.73
YHL044WP38727 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.47□□□□□ -0.73
YHL044WP38727 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.47□□□□□ -0.73
YHL044WP38727 CCT6YDR188W 1641 nt10.44□□□□□ -0.74
YHL044WP38727 IMP2'YIL154C 1041 nt10.44□□□□□ -0.74
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