Protein–RNA interactions for Protein: P47156

JHD2, Histone demethylase JHD2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
JHD2P47156 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.17■□□□□ 0.66
JHD2P47156 NSR1YGR159C 1245 nt18.85■□□□□ 0.61
JHD2P47156 NOP1YDL014W 984 nt18.69■□□□□ 0.58
JHD2P47156 YKL036CYKL036C 393 nt17.45■□□□□ 0.38
JHD2P47156 MDJ1YFL016C 1536 nt16.83■□□□□ 0.28
JHD2P47156 Q0297Q0297 156 nt16.45■□□□□ 0.22
JHD2P47156 SRX1YKL086W 384 nt16.35■□□□□ 0.21
JHD2P47156 YJL027CYJL027C 417 nt16.32■□□□□ 0.2
JHD2P47156 SCS3YGL126W 1143 nt16.01■□□□□ 0.15
JHD2P47156 YCR051WYCR051W 669 nt15.51■□□□□ 0.07
JHD2P47156 YOL085CYOL085C 342 nt15.11■□□□□ 0.01
JHD2P47156 PKP1YIL042C 1185 nt14.86□□□□□ -0.03
JHD2P47156 DBP2YNL112W 1641 nt14.77□□□□□ -0.05
JHD2P47156 RPP1BYDL130W 321 nt14.76□□□□□ -0.05
JHD2P47156 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.7□□□□□ -0.06
JHD2P47156 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.7□□□□□ -0.06
JHD2P47156 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.7□□□□□ -0.06
JHD2P47156 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.7□□□□□ -0.06
JHD2P47156 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.7□□□□□ -0.06
JHD2P47156 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.7□□□□□ -0.06
JHD2P47156 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.7□□□□□ -0.06
JHD2P47156 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.7□□□□□ -0.06
JHD2P47156 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.7□□□□□ -0.06
JHD2P47156 CCC1YLR220W 969 nt14.5□□□□□ -0.09
JHD2P47156 YBR190WYBR190W 312 nt14.46□□□□□ -0.09
JHD2P47156 SCJ1YMR214W 1134 nt14.4□□□□□ -0.1
JHD2P47156 ATS1YAL020C 1002 nt14.35□□□□□ -0.11
JHD2P47156 PET122YER153C 765 nt14.1□□□□□ -0.15
JHD2P47156 RTC3YHR087W 336 nt14.1□□□□□ -0.15
JHD2P47156 SCR1SCR1 522 nt13.96□□□□□ -0.17
JHD2P47156 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.95□□□□□ -0.18
JHD2P47156 RVS167YDR388W 1449 nt13.9□□□□□ -0.18
JHD2P47156 RRN5YLR141W 1092 nt13.68□□□□□ -0.22
JHD2P47156 SSA3YBL075C 1950 nt13.62□□□□□ -0.23
JHD2P47156 YDJ1YNL064C 1230 nt13.49□□□□□ -0.25
JHD2P47156 SHR5YOL110W 714 nt13.49□□□□□ -0.25
JHD2P47156 PUT4YOR348C 1884 nt13.47□□□□□ -0.25
JHD2P47156 RSB1YOR049C 1065 nt13.47□□□□□ -0.25
JHD2P47156 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.43□□□□□ -0.26
JHD2P47156 PST2YDR032C 597 nt13.25□□□□□ -0.29
JHD2P47156 GAR1YHR089C 618 nt13.15□□□□□ -0.3
JHD2P47156 ARE1YCR048W 1833 nt13.09□□□□□ -0.31
JHD2P47156 URN1YPR152C 1398 nt13.06□□□□□ -0.32
JHD2P47156 DEP1YAL013W 1218 nt13.02□□□□□ -0.33
JHD2P47156 POA1YBR022W 534 nt13.01□□□□□ -0.33
JHD2P47156 SAH1YER043C 1350 nt12.99□□□□□ -0.33
JHD2P47156 OPI9YLR338W 858 nt12.97□□□□□ -0.33
JHD2P47156 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.92□□□□□ -0.34
JHD2P47156 YKL097CYKL097C 411 nt12.84□□□□□ -0.35
JHD2P47156 YNL208WYNL208W 600 nt12.84□□□□□ -0.35
JHD2P47156 BSC6YOL137W 1494 nt12.81□□□□□ -0.36
JHD2P47156 RPN10YHR200W 807 nt12.81□□□□□ -0.36
JHD2P47156 TIR1YER011W 765 nt12.7□□□□□ -0.38
JHD2P47156 SHU1YHL006C 453 nt12.68□□□□□ -0.38
JHD2P47156 BUD23YCR047C 828 nt12.58□□□□□ -0.4
JHD2P47156 PUN1YLR414C 792 nt12.57□□□□□ -0.4
JHD2P47156 SPT5YML010W 3192 nt12.55□□□□□ -0.4
JHD2P47156 SSA1YAL005C 1929 nt12.52□□□□□ -0.4
JHD2P47156 PTC2YER089C 1395 nt12.49□□□□□ -0.41
JHD2P47156 YJR018WYJR018W 363 nt12.43□□□□□ -0.42
JHD2P47156 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.4□□□□□ -0.42
JHD2P47156 SRB2YHR041C 633 nt12.39□□□□□ -0.43
JHD2P47156 NAB2YGL122C 1578 nt12.39□□□□□ -0.43
JHD2P47156 YOR139CYOR139C 393 nt12.31□□□□□ -0.44
JHD2P47156 SSA4YER103W 1929 nt12.3□□□□□ -0.44
JHD2P47156 YJR120WYJR120W 351 nt12.29□□□□□ -0.44
JHD2P47156 FIS1YIL065C 468 nt12.19□□□□□ -0.46
JHD2P47156 WWM1YFL010C 636 nt12.18□□□□□ -0.46
JHD2P47156 YGR021WYGR021W 873 nt12.18□□□□□ -0.46
JHD2P47156 RPP2BYDR382W 333 nt12.17□□□□□ -0.46
JHD2P47156 HOM6YJR139C 1080 nt12.16□□□□□ -0.46
JHD2P47156 MNP1YGL068W 585 nt12.15□□□□□ -0.46
JHD2P47156 DAL1YIR027C 1383 nt12.15□□□□□ -0.46
JHD2P47156 NPL3YDR432W 1245 nt12.14□□□□□ -0.47
JHD2P47156 FPR4YLR449W 1179 nt12.09□□□□□ -0.47
JHD2P47156 MEP2YNL142W 1500 nt12.08□□□□□ -0.48
JHD2P47156 INM2YDR287W 879 nt12.04□□□□□ -0.48
JHD2P47156 PHO4YFR034C 939 nt12.04□□□□□ -0.48
JHD2P47156 YOL037CYOL037C 354 nt12.01□□□□□ -0.49
JHD2P47156 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.99□□□□□ -0.49
JHD2P47156 BDH2YAL061W 1254 nt11.98□□□□□ -0.49
JHD2P47156 RKM5YLR137W 1104 nt11.98□□□□□ -0.49
JHD2P47156 YPS1YLR120C 1710 nt11.96□□□□□ -0.49
JHD2P47156 DCW1YKL046C 1350 nt11.88□□□□□ -0.51
JHD2P47156 BDF1YLR399C 2061 nt11.87□□□□□ -0.51
JHD2P47156 YBL100CYBL100C 315 nt11.86□□□□□ -0.51
JHD2P47156 LSM3YLR438C-A 270 nt11.85□□□□□ -0.51
JHD2P47156 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.84□□□□□ -0.51
JHD2P47156 YDR095CYDR095C 411 nt11.82□□□□□ -0.52
JHD2P47156 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.79□□□□□ -0.52
JHD2P47156 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.79□□□□□ -0.52
JHD2P47156 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.79□□□□□ -0.52
JHD2P47156 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.79□□□□□ -0.52
JHD2P47156 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.79□□□□□ -0.52
JHD2P47156 FUN26YAL022C 1554 nt11.71□□□□□ -0.53
JHD2P47156 EMI2YDR516C 1503 nt11.71□□□□□ -0.53
JHD2P47156 TAT1YBR069C 1860 nt11.7□□□□□ -0.54
JHD2P47156 YLR281CYLR281C 468 nt11.7□□□□□ -0.54
JHD2P47156 TRM9YML014W 840 nt11.68□□□□□ -0.54
JHD2P47156 YBR220CYBR220C 1683 nt11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms