RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	PCH2	P38126	564 aa		3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YHR054C	P38780	354 aa		3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ECM27	P47144	725 aa		3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	COS5	P47187	383 aa		3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	AZR1	P50080	613 aa		3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YNL146W	P53906	100 aa		3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	COS7	Q07788	383 aa		3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	IES4	Q08561	116 aa		3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ESA1	Q08649	445 aa		3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YOR387C	Q08910	206 aa		3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		3.21	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SNA3	P14359	133 aa		3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	CPR4	P25334	318 aa		3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	NAM9	P27929	486 aa		3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YSC83	P32792	385 aa		3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	COT1	P32798	439 aa		3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	HEL1	P36113	551 aa		3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YFL067W	P43537	175 aa		3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	FRE4	P53746	719 aa		3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	GOR1	P53839	350 aa		3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SKO1	Q02100	647 aa		3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	KAP120	Q02932	1032 aa		3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SPC19	Q03954	165 aa		3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	FIG2	P25653	1609 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	PDX1	P16451	410 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	DAL2	P25335	343 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	RHB1	P25378	209 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SWI3	P32591	825 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YBR137W	P38276	179 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
THP2	YHR167W	SEC9	P40357	651 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SSU1	P41930	458 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SSN8	P47821	323 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YNR048W	P53740	393 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	HXT11	P54862	567 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	DON1	Q05610	365 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	PBA1	Q05778	276 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YLR297W	Q05899	129 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	CDD1	Q06549	142 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SOR2	Q07786	357 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	TIM18	Q08749	192 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	MUM3	Q08750	479 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	PLP2	Q12017	286 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	TMS1	Q12116	473 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ORT1	Q12375	292 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	RMD5	Q12508	421 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	AFI1	Q99222	893 aa		3.19	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SCEI	P03882	235 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	REC107	P21651	314 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	VPS3	P23643	1011 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	CTR86	P25355	563 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SRB4	P32569	687 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YBL059W	P34224	193 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	RIB5	P38145	238 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	MMS4	P38257	691 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	TVP23	P38962	199 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	FAA2	P39518	744 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	CPR7	P47103	393 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	RRN11	Q04712	507 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	MRPL35	Q06678	367 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SGT1	Q08446	395 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	HSP42	Q12329	375 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	EMP46	Q12396	444 aa		3.18	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	JIP3	O13555	125 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	MAS1	P10507	462 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	LSB5	P25369	354 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SPS22	P25380	463 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SWH1	P35845	1188 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YBR056W	P38081	501 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SDS24	P38314	527 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	LCB2	P40970	561 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	HMS2	P47175	358 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	BTN2	P53286	410 aa		3.17	□□□□□ -1.9

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