RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	WSS1	P38838	269 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	EPL1	P43572	832 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	YGR016W	P53209	190 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	URC2	Q04411	772 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	ECM7	Q06200	448 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	MRPL35	Q06678	367 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	RAX1	Q08760	435 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPC17	YJL011C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.83	□□□□□ -1.8	not detected
RPC17	YJL011C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	TOS3	P43637	560 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	MTM1	P53320	366 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	SMA2	Q04658	369 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	RRN11	Q04712	507 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	IPK1	Q06667	281 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	YFH1	Q07540	174 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	CAP2	P13517	287 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	CBS2	P14905	389 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	NAM9	P27929	486 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	KAR9	P32526	644 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	YBL059W	P34224	193 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	MSG5	P38590	489 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	NDT80	P38830	627 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	YHR177W	P38867	453 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	STE24	P47154	453 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	COS1	P53822	381 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	CCE1	Q03702	353 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	TMS1	Q12116	473 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	YDR061W	Q12298	539 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	PHA2	P32452	334 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	DAD2	P36162	133 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	SIF2	P38262	535 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	SBE22	P38814	852 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	REE1	P40893	198 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	RTT102	P53330	157 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	HER2	Q03557	464 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	YDR286C	Q05530	114 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	ASA1	Q06822	443 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	SRN2	Q99176	213 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	TOA2	P32774	122 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	SDH3	P33421	198 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	CAJ1	P39101	391 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	YPI1	P43587	155 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	YGR117C	P53270	476 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	RRN9	P53437	365 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	AAD15	Q08361	143 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	YRM1	Q12340	786 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	CEX1	Q12453	761 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	POM152	P39685	1337 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	YEF1	P32622	495 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	COX13	P32799	129 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	SPG5	P42933	373 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	PGC1	Q08959	321 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	SFG1	Q12507	346 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.78	□□□□□ -1.8	RIP-Chip
RPC17	YJL011C	TPK3	P05986	398 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	POP5	P28005	173 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	PSO2	P30620	661 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	COX14	P39103	70 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	ATM1	P40416	690 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	NUP116	Q02630	1113 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	YPR078C	Q06813	372 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	MDM36	Q06820	579 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	AHC1	Q12433	566 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPC17	YJL011C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPC17	YJL011C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81

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