Protein–RNA interactions for Protein: P38867

YHR177W, Uncharacterized protein YHR177W, yeastyeast

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR177WP38867 NSR1YGR159C 1245 nt19.15■□□□□ 0.66
YHR177WP38867 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.13■□□□□ 0.65
YHR177WP38867 NOP1YDL014W 984 nt18.51■□□□□ 0.55
YHR177WP38867 MDJ1YFL016C 1536 nt17.19■□□□□ 0.34
YHR177WP38867 YKL036CYKL036C 393 nt16.92■□□□□ 0.3
YHR177WP38867 SRX1YKL086W 384 nt16.17■□□□□ 0.18
YHR177WP38867 Q0297Q0297 156 nt16.14■□□□□ 0.17
YHR177WP38867 YJL027CYJL027C 417 nt15.84■□□□□ 0.13
YHR177WP38867 YCR051WYCR051W 669 nt15.34■□□□□ 0.05
YHR177WP38867 SCS3YGL126W 1143 nt15.31■□□□□ 0.04
YHR177WP38867 DBP2YNL112W 1641 nt15.14■□□□□ 0.01
YHR177WP38867 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.73□□□□□ -0.05
YHR177WP38867 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.73□□□□□ -0.05
YHR177WP38867 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.73□□□□□ -0.05
YHR177WP38867 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.73□□□□□ -0.05
YHR177WP38867 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.73□□□□□ -0.05
YHR177WP38867 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.73□□□□□ -0.05
YHR177WP38867 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.73□□□□□ -0.05
YHR177WP38867 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.73□□□□□ -0.05
YHR177WP38867 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.73□□□□□ -0.05
YHR177WP38867 YBR190WYBR190W 312 nt14.68□□□□□ -0.06
YHR177WP38867 YOL085CYOL085C 342 nt14.67□□□□□ -0.06
YHR177WP38867 CCC1YLR220W 969 nt14.6□□□□□ -0.07
YHR177WP38867 RPP1BYDL130W 321 nt14.49□□□□□ -0.09
YHR177WP38867 PKP1YIL042C 1185 nt14.48□□□□□ -0.09
YHR177WP38867 RTC3YHR087W 336 nt14.37□□□□□ -0.11
YHR177WP38867 RVS167YDR388W 1449 nt14.18□□□□□ -0.14
YHR177WP38867 SCJ1YMR214W 1134 nt14.08□□□□□ -0.16
YHR177WP38867 PET122YER153C 765 nt13.88□□□□□ -0.19
YHR177WP38867 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.88□□□□□ -0.19
YHR177WP38867 SCR1SCR1 522 nt13.67□□□□□ -0.22
YHR177WP38867 SHR5YOL110W 714 nt13.65□□□□□ -0.22
YHR177WP38867 ATS1YAL020C 1002 nt13.64□□□□□ -0.23
YHR177WP38867 PUT4YOR348C 1884 nt13.48□□□□□ -0.25
YHR177WP38867 RRN5YLR141W 1092 nt13.47□□□□□ -0.25
YHR177WP38867 YDJ1YNL064C 1230 nt13.43□□□□□ -0.26
YHR177WP38867 URN1YPR152C 1398 nt13.38□□□□□ -0.27
YHR177WP38867 DEP1YAL013W 1218 nt13.34□□□□□ -0.27
YHR177WP38867 OPI9YLR338W 858 nt13.21□□□□□ -0.29
YHR177WP38867 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.2□□□□□ -0.3
YHR177WP38867 ARE1YCR048W 1833 nt13.19□□□□□ -0.3
YHR177WP38867 SAH1YER043C 1350 nt13.19□□□□□ -0.3
YHR177WP38867 GAR1YHR089C 618 nt13.17□□□□□ -0.3
YHR177WP38867 RPN10YHR200W 807 nt13.13□□□□□ -0.31
YHR177WP38867 RSB1YOR049C 1065 nt13.13□□□□□ -0.31
YHR177WP38867 YNL208WYNL208W 600 nt13.1□□□□□ -0.31
YHR177WP38867 POA1YBR022W 534 nt13.05□□□□□ -0.32
YHR177WP38867 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.01□□□□□ -0.33
YHR177WP38867 SSA3YBL075C 1950 nt13.01□□□□□ -0.33
YHR177WP38867 PUN1YLR414C 792 nt12.82□□□□□ -0.36
YHR177WP38867 BSC6YOL137W 1494 nt12.8□□□□□ -0.36
YHR177WP38867 YJR018WYJR018W 363 nt12.75□□□□□ -0.37
YHR177WP38867 TIR1YER011W 765 nt12.73□□□□□ -0.37
YHR177WP38867 PTC2YER089C 1395 nt12.71□□□□□ -0.37
YHR177WP38867 BUD23YCR047C 828 nt12.7□□□□□ -0.38
YHR177WP38867 PST2YDR032C 597 nt12.67□□□□□ -0.38
YHR177WP38867 SSA1YAL005C 1929 nt12.62□□□□□ -0.39
YHR177WP38867 NAB2YGL122C 1578 nt12.56□□□□□ -0.4
YHR177WP38867 YJR120WYJR120W 351 nt12.52□□□□□ -0.41
YHR177WP38867 RPP2BYDR382W 333 nt12.44□□□□□ -0.42
YHR177WP38867 SRB2YHR041C 633 nt12.39□□□□□ -0.43
YHR177WP38867 FIS1YIL065C 468 nt12.37□□□□□ -0.43
YHR177WP38867 DAL1YIR027C 1383 nt12.37□□□□□ -0.43
YHR177WP38867 FPR4YLR449W 1179 nt12.35□□□□□ -0.43
YHR177WP38867 SPT5YML010W 3192 nt12.32□□□□□ -0.44
YHR177WP38867 INM2YDR287W 879 nt12.31□□□□□ -0.44
YHR177WP38867 PHO4YFR034C 939 nt12.25□□□□□ -0.45
YHR177WP38867 SHU1YHL006C 453 nt12.2□□□□□ -0.46
YHR177WP38867 YBL100CYBL100C 315 nt12.17□□□□□ -0.46
YHR177WP38867 BDH2YAL061W 1254 nt12.16□□□□□ -0.46
YHR177WP38867 WWM1YFL010C 636 nt12.15□□□□□ -0.46
YHR177WP38867 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.08□□□□□ -0.48
YHR177WP38867 YKL097CYKL097C 411 nt12.08□□□□□ -0.48
YHR177WP38867 YPS1YLR120C 1710 nt12.07□□□□□ -0.48
YHR177WP38867 MEP2YNL142W 1500 nt12.03□□□□□ -0.48
YHR177WP38867 FUN26YAL022C 1554 nt12.03□□□□□ -0.48
YHR177WP38867 YGR021WYGR021W 873 nt12.01□□□□□ -0.49
YHR177WP38867 LSM3YLR438C-A 270 nt11.97□□□□□ -0.49
YHR177WP38867 TRM9YML014W 840 nt11.97□□□□□ -0.49
YHR177WP38867 YDR095CYDR095C 411 nt11.96□□□□□ -0.49
YHR177WP38867 HOM6YJR139C 1080 nt11.96□□□□□ -0.49
YHR177WP38867 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.95□□□□□ -0.5
YHR177WP38867 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.94□□□□□ -0.5
YHR177WP38867 SSA4YER103W 1929 nt11.94□□□□□ -0.5
YHR177WP38867 MNP1YGL068W 585 nt11.89□□□□□ -0.51
YHR177WP38867 ALF1YNL148C 765 nt11.89□□□□□ -0.51
YHR177WP38867 CCT6YDR188W 1641 nt11.86□□□□□ -0.51
YHR177WP38867 DCW1YKL046C 1350 nt11.84□□□□□ -0.51
YHR177WP38867 RKM5YLR137W 1104 nt11.79□□□□□ -0.52
YHR177WP38867 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.76□□□□□ -0.53
YHR177WP38867 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.76□□□□□ -0.53
YHR177WP38867 RPP2AYOL039W 321 nt11.75□□□□□ -0.53
YHR177WP38867 PTP1YDL230W 1008 nt11.72□□□□□ -0.53
YHR177WP38867 SIS1YNL007C 1059 nt11.71□□□□□ -0.53
YHR177WP38867 YOR139CYOR139C 393 nt11.69□□□□□ -0.54
YHR177WP38867 EMI2YDR516C 1503 nt11.69□□□□□ -0.54
YHR177WP38867 CAC2YML102W 1407 nt11.66□□□□□ -0.54
YHR177WP38867 YMR090WYMR090W 684 nt11.61□□□□□ -0.55
YHR177WP38867 YOL037CYOL037C 354 nt11.6□□□□□ -0.55
YHR177WP38867 YDL221WYDL221W 552 nt11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 265.5 ms