Protein–RNA interactions for Protein: Q12298

YDR061W, Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein YDR061W, yeastyeast

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR061WQ12298 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.6■□□□□ 0.73
YDR061WQ12298 NOP1YDL014W 984 nt19.22■□□□□ 0.67
YDR061WQ12298 NSR1YGR159C 1245 nt19.08■□□□□ 0.64
YDR061WQ12298 YKL036CYKL036C 393 nt18.08■□□□□ 0.48
YDR061WQ12298 YJL027CYJL027C 417 nt16.98■□□□□ 0.31
YDR061WQ12298 Q0297Q0297 156 nt16.89■□□□□ 0.29
YDR061WQ12298 SRX1YKL086W 384 nt16.75■□□□□ 0.27
YDR061WQ12298 SCS3YGL126W 1143 nt16.62■□□□□ 0.25
YDR061WQ12298 MDJ1YFL016C 1536 nt16.56■□□□□ 0.24
YDR061WQ12298 YCR051WYCR051W 669 nt15.97■□□□□ 0.15
YDR061WQ12298 YOL085CYOL085C 342 nt15.61■□□□□ 0.09
YDR061WQ12298 PKP1YIL042C 1185 nt15.35■□□□□ 0.05
YDR061WQ12298 SCJ1YMR214W 1134 nt15.23■□□□□ 0.03
YDR061WQ12298 RPP1BYDL130W 321 nt15.17■□□□□ 0.02
YDR061WQ12298 ATS1YAL020C 1002 nt14.97□□□□□ -0.01
YDR061WQ12298 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.9□□□□□ -0.02
YDR061WQ12298 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.9□□□□□ -0.02
YDR061WQ12298 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.9□□□□□ -0.02
YDR061WQ12298 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.9□□□□□ -0.02
YDR061WQ12298 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.9□□□□□ -0.02
YDR061WQ12298 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.9□□□□□ -0.02
YDR061WQ12298 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.9□□□□□ -0.02
YDR061WQ12298 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.9□□□□□ -0.02
YDR061WQ12298 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.9□□□□□ -0.02
YDR061WQ12298 CCC1YLR220W 969 nt14.8□□□□□ -0.04
YDR061WQ12298 DBP2YNL112W 1641 nt14.74□□□□□ -0.05
YDR061WQ12298 SCR1SCR1 522 nt14.47□□□□□ -0.09
YDR061WQ12298 PET122YER153C 765 nt14.45□□□□□ -0.1
YDR061WQ12298 SSA3YBL075C 1950 nt14.29□□□□□ -0.12
YDR061WQ12298 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YDR061WQ12298 YBR190WYBR190W 312 nt14.14□□□□□ -0.15
YDR061WQ12298 RVS167YDR388W 1449 nt14.1□□□□□ -0.15
YDR061WQ12298 RRN5YLR141W 1092 nt14.07□□□□□ -0.16
YDR061WQ12298 RSB1YOR049C 1065 nt13.95□□□□□ -0.18
YDR061WQ12298 RTC3YHR087W 336 nt13.89□□□□□ -0.19
YDR061WQ12298 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.78□□□□□ -0.2
YDR061WQ12298 PST2YDR032C 597 nt13.76□□□□□ -0.21
YDR061WQ12298 YDJ1YNL064C 1230 nt13.76□□□□□ -0.21
YDR061WQ12298 SHR5YOL110W 714 nt13.65□□□□□ -0.22
YDR061WQ12298 YKL097CYKL097C 411 nt13.51□□□□□ -0.25
YDR061WQ12298 GAR1YHR089C 618 nt13.42□□□□□ -0.26
YDR061WQ12298 PUT4YOR348C 1884 nt13.33□□□□□ -0.27
YDR061WQ12298 SHU1YHL006C 453 nt13.13□□□□□ -0.31
YDR061WQ12298 DEP1YAL013W 1218 nt13.13□□□□□ -0.31
YDR061WQ12298 URN1YPR152C 1398 nt13.02□□□□□ -0.33
YDR061WQ12298 RPN10YHR200W 807 nt12.98□□□□□ -0.33
YDR061WQ12298 YNL208WYNL208W 600 nt12.98□□□□□ -0.33
YDR061WQ12298 TIR1YER011W 765 nt12.94□□□□□ -0.34
YDR061WQ12298 ARE1YCR048W 1833 nt12.91□□□□□ -0.34
YDR061WQ12298 YOR139CYOR139C 393 nt12.82□□□□□ -0.36
YDR061WQ12298 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.81□□□□□ -0.36
YDR061WQ12298 POA1YBR022W 534 nt12.81□□□□□ -0.36
YDR061WQ12298 NPL3YDR432W 1245 nt12.73□□□□□ -0.37
YDR061WQ12298 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.72□□□□□ -0.37
YDR061WQ12298 OPI9YLR338W 858 nt12.72□□□□□ -0.37
YDR061WQ12298 SAH1YER043C 1350 nt12.69□□□□□ -0.38
YDR061WQ12298 BSC6YOL137W 1494 nt12.68□□□□□ -0.38
YDR061WQ12298 SSA1YAL005C 1929 nt12.65□□□□□ -0.38
YDR061WQ12298 SPT5YML010W 3192 nt12.65□□□□□ -0.38
YDR061WQ12298 YGR021WYGR021W 873 nt12.52□□□□□ -0.41
YDR061WQ12298 SSA4YER103W 1929 nt12.5□□□□□ -0.41
YDR061WQ12298 MNP1YGL068W 585 nt12.46□□□□□ -0.41
YDR061WQ12298 SRB2YHR041C 633 nt12.46□□□□□ -0.41
YDR061WQ12298 YJR018WYJR018W 363 nt12.45□□□□□ -0.42
YDR061WQ12298 HOM6YJR139C 1080 nt12.44□□□□□ -0.42
YDR061WQ12298 YOL037CYOL037C 354 nt12.44□□□□□ -0.42
YDR061WQ12298 WWM1YFL010C 636 nt12.42□□□□□ -0.42
YDR061WQ12298 PUN1YLR414C 792 nt12.41□□□□□ -0.42
YDR061WQ12298 RPP2BYDR382W 333 nt12.37□□□□□ -0.43
YDR061WQ12298 BUD23YCR047C 828 nt12.32□□□□□ -0.44
YDR061WQ12298 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.29□□□□□ -0.44
YDR061WQ12298 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.29□□□□□ -0.44
YDR061WQ12298 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.29□□□□□ -0.44
YDR061WQ12298 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.29□□□□□ -0.44
YDR061WQ12298 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.29□□□□□ -0.44
YDR061WQ12298 RKM5YLR137W 1104 nt12.28□□□□□ -0.44
YDR061WQ12298 YJR120WYJR120W 351 nt12.25□□□□□ -0.45
YDR061WQ12298 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.24□□□□□ -0.45
YDR061WQ12298 PTC2YER089C 1395 nt12.19□□□□□ -0.46
YDR061WQ12298 NAB2YGL122C 1578 nt12.13□□□□□ -0.47
YDR061WQ12298 PUS2YGL063W 1113 nt12.12□□□□□ -0.47
YDR061WQ12298 Q0182Q0182 405 nt12.12□□□□□ -0.47
YDR061WQ12298 BDH2YAL061W 1254 nt12.12□□□□□ -0.47
YDR061WQ12298 BDF1YLR399C 2061 nt12.09□□□□□ -0.47
YDR061WQ12298 YLR281CYLR281C 468 nt12.06□□□□□ -0.48
YDR061WQ12298 LSM3YLR438C-A 270 nt12.04□□□□□ -0.48
YDR061WQ12298 MOT3YMR070W 1473 nt12.01□□□□□ -0.49
YDR061WQ12298 WHI5YOR083W 888 nt11.99□□□□□ -0.49
YDR061WQ12298 MEP2YNL142W 1500 nt11.98□□□□□ -0.49
YDR061WQ12298 PAC11YDR488C 1602 nt11.97□□□□□ -0.49
YDR061WQ12298 INM2YDR287W 879 nt11.96□□□□□ -0.49
YDR061WQ12298 FIS1YIL065C 468 nt11.96□□□□□ -0.49
YDR061WQ12298 TAT1YBR069C 1860 nt11.92□□□□□ -0.5
YDR061WQ12298 YBL100CYBL100C 315 nt11.92□□□□□ -0.5
YDR061WQ12298 FPR4YLR449W 1179 nt11.91□□□□□ -0.5
YDR061WQ12298 DAL1YIR027C 1383 nt11.87□□□□□ -0.51
YDR061WQ12298 TRM9YML014W 840 nt11.86□□□□□ -0.51
YDR061WQ12298 FMP45YDL222C 930 nt11.84□□□□□ -0.51
YDR061WQ12298 DSK2YMR276W 1122 nt11.81□□□□□ -0.52
YDR061WQ12298 FUN26YAL022C 1554 nt11.77□□□□□ -0.53
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