Protein–RNA interactions for Protein: Q12507

SFG1, Superficial pseudohyphal growth protein 1, yeastyeast

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFG1Q12507 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.34■□□□□ 0.53
SFG1Q12507 NSR1YGR159C 1245 nt18.16■□□□□ 0.5
SFG1Q12507 NOP1YDL014W 984 nt18■□□□□ 0.47
SFG1Q12507 YKL036CYKL036C 393 nt16.66■□□□□ 0.26
SFG1Q12507 MDJ1YFL016C 1536 nt16.41■□□□□ 0.22
SFG1Q12507 Q0297Q0297 156 nt15.72■□□□□ 0.11
SFG1Q12507 SRX1YKL086W 384 nt15.65■□□□□ 0.1
SFG1Q12507 YJL027CYJL027C 417 nt15.57■□□□□ 0.08
SFG1Q12507 SCS3YGL126W 1143 nt15.16■□□□□ 0.02
SFG1Q12507 YCR051WYCR051W 669 nt14.84□□□□□ -0.03
SFG1Q12507 YOL085CYOL085C 342 nt14.36□□□□□ -0.11
SFG1Q12507 DBP2YNL112W 1641 nt14.24□□□□□ -0.13
SFG1Q12507 YBR190WYBR190W 312 nt14.16□□□□□ -0.14
SFG1Q12507 RPP1BYDL130W 321 nt14.11□□□□□ -0.15
SFG1Q12507 PKP1YIL042C 1185 nt14.07□□□□□ -0.16
SFG1Q12507 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SFG1Q12507 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SFG1Q12507 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SFG1Q12507 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SFG1Q12507 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SFG1Q12507 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SFG1Q12507 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SFG1Q12507 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SFG1Q12507 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.04□□□□□ -0.16
SFG1Q12507 CCC1YLR220W 969 nt13.86□□□□□ -0.19
SFG1Q12507 RTC3YHR087W 336 nt13.85□□□□□ -0.19
SFG1Q12507 SCJ1YMR214W 1134 nt13.74□□□□□ -0.21
SFG1Q12507 ATS1YAL020C 1002 nt13.61□□□□□ -0.23
SFG1Q12507 SSA3YBL075C 1950 nt13.55□□□□□ -0.24
SFG1Q12507 RVS167YDR388W 1449 nt13.47□□□□□ -0.25
SFG1Q12507 SCR1SCR1 522 nt13.43□□□□□ -0.26
SFG1Q12507 PET122YER153C 765 nt13.39□□□□□ -0.27
SFG1Q12507 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.33□□□□□ -0.28
SFG1Q12507 PUT4YOR348C 1884 nt13.19□□□□□ -0.3
SFG1Q12507 RRN5YLR141W 1092 nt13.03□□□□□ -0.32
SFG1Q12507 SHR5YOL110W 714 nt12.96□□□□□ -0.33
SFG1Q12507 YDJ1YNL064C 1230 nt12.94□□□□□ -0.34
SFG1Q12507 RSB1YOR049C 1065 nt12.84□□□□□ -0.35
SFG1Q12507 ARE1YCR048W 1833 nt12.78□□□□□ -0.36
SFG1Q12507 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.78□□□□□ -0.36
SFG1Q12507 POA1YBR022W 534 nt12.76□□□□□ -0.37
SFG1Q12507 URN1YPR152C 1398 nt12.74□□□□□ -0.37
SFG1Q12507 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.7□□□□□ -0.38
SFG1Q12507 SAH1YER043C 1350 nt12.69□□□□□ -0.38
SFG1Q12507 OPI9YLR338W 858 nt12.65□□□□□ -0.38
SFG1Q12507 BSC6YOL137W 1494 nt12.59□□□□□ -0.39
SFG1Q12507 DEP1YAL013W 1218 nt12.57□□□□□ -0.4
SFG1Q12507 PST2YDR032C 597 nt12.56□□□□□ -0.4
SFG1Q12507 GAR1YHR089C 618 nt12.56□□□□□ -0.4
SFG1Q12507 RPN10YHR200W 807 nt12.51□□□□□ -0.41
SFG1Q12507 BUD23YCR047C 828 nt12.38□□□□□ -0.43
SFG1Q12507 YNL208WYNL208W 600 nt12.38□□□□□ -0.43
SFG1Q12507 PUN1YLR414C 792 nt12.33□□□□□ -0.44
SFG1Q12507 SPT5YML010W 3192 nt12.24□□□□□ -0.45
SFG1Q12507 PTC2YER089C 1395 nt12.22□□□□□ -0.45
SFG1Q12507 YKL097CYKL097C 411 nt12.21□□□□□ -0.45
SFG1Q12507 SSA4YER103W 1929 nt12.16□□□□□ -0.46
SFG1Q12507 TIR1YER011W 765 nt12.16□□□□□ -0.46
SFG1Q12507 NAB2YGL122C 1578 nt12.15□□□□□ -0.46
SFG1Q12507 YJR018WYJR018W 363 nt12.13□□□□□ -0.47
SFG1Q12507 SHU1YHL006C 453 nt11.99□□□□□ -0.49
SFG1Q12507 SSA1YAL005C 1929 nt11.91□□□□□ -0.5
SFG1Q12507 DAL1YIR027C 1383 nt11.9□□□□□ -0.5
SFG1Q12507 FIS1YIL065C 468 nt11.89□□□□□ -0.51
SFG1Q12507 FPR4YLR449W 1179 nt11.88□□□□□ -0.51
SFG1Q12507 MEP2YNL142W 1500 nt11.87□□□□□ -0.51
SFG1Q12507 RPP2BYDR382W 333 nt11.82□□□□□ -0.52
SFG1Q12507 INM2YDR287W 879 nt11.78□□□□□ -0.52
SFG1Q12507 PHO4YFR034C 939 nt11.77□□□□□ -0.53
SFG1Q12507 Q0182Q0182 405 nt11.74□□□□□ -0.53
SFG1Q12507 YJR120WYJR120W 351 nt11.73□□□□□ -0.53
SFG1Q12507 YGR021WYGR021W 873 nt11.72□□□□□ -0.53
SFG1Q12507 YPS1YLR120C 1710 nt11.7□□□□□ -0.54
SFG1Q12507 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.7□□□□□ -0.54
SFG1Q12507 BDF1YLR399C 2061 nt11.68□□□□□ -0.54
SFG1Q12507 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.67□□□□□ -0.54
SFG1Q12507 DCW1YKL046C 1350 nt11.64□□□□□ -0.55
SFG1Q12507 SRB2YHR041C 633 nt11.61□□□□□ -0.55
SFG1Q12507 NPL3YDR432W 1245 nt11.59□□□□□ -0.55
SFG1Q12507 WWM1YFL010C 636 nt11.58□□□□□ -0.56
SFG1Q12507 YBL100CYBL100C 315 nt11.58□□□□□ -0.56
SFG1Q12507 HOM6YJR139C 1080 nt11.57□□□□□ -0.56
SFG1Q12507 YMR090WYMR090W 684 nt11.57□□□□□ -0.56
SFG1Q12507 YOR139CYOR139C 393 nt11.57□□□□□ -0.56
SFG1Q12507 YDR095CYDR095C 411 nt11.56□□□□□ -0.56
SFG1Q12507 TAT1YBR069C 1860 nt11.55□□□□□ -0.56
SFG1Q12507 BDH2YAL061W 1254 nt11.54□□□□□ -0.56
SFG1Q12507 EMI2YDR516C 1503 nt11.52□□□□□ -0.57
SFG1Q12507 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.51□□□□□ -0.57
SFG1Q12507 YOL037CYOL037C 354 nt11.5□□□□□ -0.57
SFG1Q12507 MNP1YGL068W 585 nt11.47□□□□□ -0.57
SFG1Q12507 LSM3YLR438C-A 270 nt11.45□□□□□ -0.58
SFG1Q12507 YBR220CYBR220C 1683 nt11.43□□□□□ -0.58
SFG1Q12507 RKM5YLR137W 1104 nt11.42□□□□□ -0.58
SFG1Q12507 ALF1YNL148C 765 nt11.42□□□□□ -0.58
SFG1Q12507 FUN26YAL022C 1554 nt11.4□□□□□ -0.58
SFG1Q12507 YDL221WYDL221W 552 nt11.39□□□□□ -0.59
SFG1Q12507 RPP2AYOL039W 321 nt11.36□□□□□ -0.59
SFG1Q12507 SDH1YKL148C 1923 nt11.33□□□□□ -0.6
SFG1Q12507 TRM9YML014W 840 nt11.32□□□□□ -0.6
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