Protein–RNA interactions for Protein: P28777

ARO2, Chorismate synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARO2P28777 NSR1YGR159C 1245 nt13.72□□□□□ -0.21
ARO2P28777 YML009W-BYML009W-B 477 nt13.28□□□□□ -0.28
ARO2P28777 SSA3YBL075C 1950 nt12.82□□□□□ -0.36
ARO2P28777 NOP1YDL014W 984 nt12.73□□□□□ -0.37
ARO2P28777 MDJ1YFL016C 1536 nt12.63□□□□□ -0.39
ARO2P28777 YJL027CYJL027C 417 nt11.61□□□□□ -0.55
ARO2P28777 YKL036CYKL036C 393 nt11.4□□□□□ -0.58
ARO2P28777 SRX1YKL086W 384 nt11.13□□□□□ -0.63
ARO2P28777 DBP2YNL112W 1641 nt11.03□□□□□ -0.64
ARO2P28777 Q0297Q0297 156 nt11□□□□□ -0.65
ARO2P28777 YBR190WYBR190W 312 nt10.97□□□□□ -0.65
ARO2P28777 PAC11YDR488C 1602 nt10.9□□□□□ -0.66
ARO2P28777 SSA4YER103W 1929 nt10.87□□□□□ -0.67
ARO2P28777 NVJ2YPR091C 2313 nt10.78□□□□□ -0.68
ARO2P28777 PUT4YOR348C 1884 nt10.73□□□□□ -0.69
ARO2P28777 SPT5YML010W 3192 nt10.67□□□□□ -0.7
ARO2P28777 RTC3YHR087W 336 nt10.59□□□□□ -0.71
ARO2P28777 BDF1YLR399C 2061 nt10.58□□□□□ -0.72
ARO2P28777 FPS1YLL043W 2010 nt10.52□□□□□ -0.73
ARO2P28777 YCR051WYCR051W 669 nt10.43□□□□□ -0.74
ARO2P28777 TAT1YBR069C 1860 nt10.42□□□□□ -0.74
ARO2P28777 TRN1tP(UGG)A 72 nt10.41□□□□□ -0.74
ARO2P28777 SUF9tP(UGG)F 72 nt10.41□□□□□ -0.74
ARO2P28777 SUF8tP(UGG)H 72 nt10.41□□□□□ -0.74
ARO2P28777 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt10.41□□□□□ -0.74
ARO2P28777 SUF7tP(UGG)M 72 nt10.41□□□□□ -0.74
ARO2P28777 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt10.41□□□□□ -0.74
ARO2P28777 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt10.41□□□□□ -0.74
ARO2P28777 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt10.41□□□□□ -0.74
ARO2P28777 SUF11tP(UGG)O2 72 nt10.41□□□□□ -0.74
ARO2P28777 BSC6YOL137W 1494 nt10.29□□□□□ -0.76
ARO2P28777 POA1YBR022W 534 nt10.27□□□□□ -0.77
ARO2P28777 SCS3YGL126W 1143 nt10.25□□□□□ -0.77
ARO2P28777 RVS167YDR388W 1449 nt10.22□□□□□ -0.77
ARO2P28777 ARE1YCR048W 1833 nt10.19□□□□□ -0.78
ARO2P28777 SSA1YAL005C 1929 nt10.16□□□□□ -0.78
ARO2P28777 CCC1YLR220W 969 nt10.16□□□□□ -0.78
ARO2P28777 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.07□□□□□ -0.8
ARO2P28777 SCJ1YMR214W 1134 nt10.07□□□□□ -0.8
ARO2P28777 UME6YDR207C 2511 nt9.93□□□□□ -0.82
ARO2P28777 URN1YPR152C 1398 nt9.89□□□□□ -0.83
ARO2P28777 RPP1BYDL130W 321 nt9.84□□□□□ -0.83
ARO2P28777 SAH1YER043C 1350 nt9.8□□□□□ -0.84
ARO2P28777 MEP2YNL142W 1500 nt9.8□□□□□ -0.84
ARO2P28777 YJL225CYJL225C 5277 nt9.79□□□□□ -0.84
ARO2P28777 OPI9YLR338W 858 nt9.77□□□□□ -0.85
ARO2P28777 YOL085CYOL085C 342 nt9.76□□□□□ -0.85
ARO2P28777 SHR5YOL110W 714 nt9.76□□□□□ -0.85
ARO2P28777 BUD23YCR047C 828 nt9.73□□□□□ -0.85
ARO2P28777 YBR220CYBR220C 1683 nt9.66□□□□□ -0.86
ARO2P28777 PCH2YBR186W 1695 nt9.64□□□□□ -0.87
ARO2P28777 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt9.63□□□□□ -0.87
ARO2P28777 GUT2YIL155C 1950 nt9.63□□□□□ -0.87
ARO2P28777 PKP1YIL042C 1185 nt9.59□□□□□ -0.87
ARO2P28777 BOR1YNL275W 1731 nt9.58□□□□□ -0.88
ARO2P28777 DCW1YKL046C 1350 nt9.56□□□□□ -0.88
ARO2P28777 SEC11YIR022W 504 nt9.54□□□□□ -0.88
ARO2P28777 DEP1YAL013W 1218 nt9.54□□□□□ -0.88
ARO2P28777 RPN10YHR200W 807 nt9.53□□□□□ -0.88
ARO2P28777 Q0182Q0182 405 nt9.52□□□□□ -0.89
ARO2P28777 YMR090WYMR090W 684 nt9.52□□□□□ -0.89
ARO2P28777 PUN1YLR414C 792 nt9.49□□□□□ -0.89
ARO2P28777 MCH5YOR306C 1566 nt9.47□□□□□ -0.89
ARO2P28777 PET122YER153C 765 nt9.45□□□□□ -0.9
ARO2P28777 NAB2YGL122C 1578 nt9.43□□□□□ -0.9
ARO2P28777 EMI2YDR516C 1503 nt9.43□□□□□ -0.9
ARO2P28777 YNL208WYNL208W 600 nt9.43□□□□□ -0.9
ARO2P28777 PTC2YER089C 1395 nt9.42□□□□□ -0.9
ARO2P28777 PIB2YGL023C 1908 nt9.41□□□□□ -0.9
ARO2P28777 SDH1YKL148C 1923 nt9.39□□□□□ -0.91
ARO2P28777 YDJ1YNL064C 1230 nt9.36□□□□□ -0.91
ARO2P28777 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.32□□□□□ -0.92
ARO2P28777 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.32□□□□□ -0.92
ARO2P28777 YDL221WYDL221W 552 nt9.28□□□□□ -0.92
ARO2P28777 YJR018WYJR018W 363 nt9.28□□□□□ -0.92
ARO2P28777 SCR1SCR1 522 nt9.28□□□□□ -0.92
ARO2P28777 RTF1YGL244W 1677 nt9.27□□□□□ -0.93
ARO2P28777 FIS1YIL065C 468 nt9.27□□□□□ -0.93
ARO2P28777 ATS1YAL020C 1002 nt9.24□□□□□ -0.93
ARO2P28777 ALG12YNR030W 1656 nt9.22□□□□□ -0.93
ARO2P28777 YPS1YLR120C 1710 nt9.22□□□□□ -0.93
ARO2P28777 DAL1YIR027C 1383 nt9.19□□□□□ -0.94
ARO2P28777 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.18□□□□□ -0.94
ARO2P28777 GAR1YHR089C 618 nt9.15□□□□□ -0.94
ARO2P28777 SCC4YER147C 1875 nt9.15□□□□□ -0.95
ARO2P28777 PTK1YKL198C 1989 nt9.12□□□□□ -0.95
ARO2P28777 PHO4YFR034C 939 nt9.1□□□□□ -0.95
ARO2P28777 BOP3YNL042W 1191 nt9.1□□□□□ -0.95
ARO2P28777 RRN5YLR141W 1092 nt9.09□□□□□ -0.95
ARO2P28777 YJR120WYJR120W 351 nt9.08□□□□□ -0.96
ARO2P28777 YSC84YHR016C 1407 nt9.06□□□□□ -0.96
ARO2P28777 MOT3YMR070W 1473 nt9.05□□□□□ -0.96
ARO2P28777 INM2YDR287W 879 nt9.04□□□□□ -0.96
ARO2P28777 FPR4YLR449W 1179 nt9.04□□□□□ -0.96
ARO2P28777 HSP60YLR259C 1719 nt9□□□□□ -0.97
ARO2P28777 YDR095CYDR095C 411 nt9□□□□□ -0.97
ARO2P28777 CAC2YML102W 1407 nt8.98□□□□□ -0.97
ARO2P28777 YHL050CYHL050C 2094 nt8.97□□□□□ -0.97
ARO2P28777 RPP2BYDR382W 333 nt8.96□□□□□ -0.98
ARO2P28777 YER088W-BYER088W-B 147 nt8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms