RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HAL9	YOL089C	MDM1	Q01846	1127 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	OAZ1	Q02803	292 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	FDH1	Q08911	376 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	AFI1	Q99222	893 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	YIP5	P53108	310 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	YMR155W	Q03795	547 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	YKU80	Q04437	629 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	SOV1	Q04748	898 aa		0.74	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	CMC1	P36064	111 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	GPI18	P38211	433 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	AZR1	P50080	613 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	FMS1	P50264	508 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	YGL262W	P53054	175 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	FRE4	P53746	719 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	YLR287C	Q05881	355 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	MED1	Q12321	566 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	SAL1	D6W196	494 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	COX4	P04037	155 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	ELO2	P25358	347 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	ECM25	P32525	599 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	BYE1	P36106	594 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	YJL055W	P47044	245 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	MDE1	P47095	244 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	COG4	Q06096	861 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	DCS1	Q06151	350 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	TFC6	Q06339	672 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.73	□□□□□ -2.29	not detected
HAL9	YOL089C	EAF3	Q12432	401 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	SEC39	Q12745	709 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	CYC3	P06182	269 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	CKA1	P15790	372 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	COX13	P32799	129 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	HAC1	P41546	238 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	ZIM17	P42844	174 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	SIP4	P46954	829 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	YMR130W	Q04223	302 aa		0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	CDC21	P06785	304 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	DST1	P07273	309 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	RHB1	P25378	209 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	MAM33	P40513	266 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	TRS85	P46944	698 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	OCA2	P53949	197 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	YDR131C	Q03899	556 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	RTN2	Q12443	393 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	HIR3	P47171	1648 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	PRD1	P25375	712 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	CCT6	P39079	546 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	YPR195C	Q06594	109 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	VAM3	Q12241	283 aa		0.72	□□□□□ -2.29
HAL9	YOL089C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	PRR1	P28708	518 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	HIR2	P32480	875 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	NIP100	P33420	868 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	HEL1	P36113	551 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	YMR181C	Q03231	154 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	HMS1	Q12398	434 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	ERV1	P27882	189 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	PXA2	P34230	853 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	COX14	P39103	70 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	HOT1	Q03213	719 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	CCE1	Q03702	353 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	SOR2	Q07786	357 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	NMD4	Q12129	218 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	SFI1	Q12369	946 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	HAP1	P0CE41	1502 aa		0.71	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	MRE11	P32829	692 aa		0.7	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	RRN10	P38204	145 aa		0.7	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	SMF1	P38925	575 aa		0.7	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	MET18	P40469	1032 aa		0.7	□□□□□ -2.3
HAL9	YOL089C	HIT1	P46973	164 aa		0.7	□□□□□ -2.3

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