Protein–RNA interactions for Protein: P46973

HIT1, Protein HIT1, yeastyeast

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HIT1P46973 NSR1YGR159C 1245 nt15.88■□□□□ 0.13
HIT1P46973 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.44■□□□□ 0.06
HIT1P46973 NOP1YDL014W 984 nt14.8□□□□□ -0.04
HIT1P46973 MDJ1YFL016C 1536 nt14.61□□□□□ -0.07
HIT1P46973 YJL027CYJL027C 417 nt13.4□□□□□ -0.26
HIT1P46973 YKL036CYKL036C 393 nt13.15□□□□□ -0.3
HIT1P46973 SRX1YKL086W 384 nt12.96□□□□□ -0.33
HIT1P46973 Q0297Q0297 156 nt12.83□□□□□ -0.36
HIT1P46973 DBP2YNL112W 1641 nt12.77□□□□□ -0.37
HIT1P46973 YBR190WYBR190W 312 nt12.62□□□□□ -0.39
HIT1P46973 SSA3YBL075C 1950 nt12.52□□□□□ -0.4
HIT1P46973 RTC3YHR087W 336 nt12.22□□□□□ -0.45
HIT1P46973 YCR051WYCR051W 669 nt12.18□□□□□ -0.46
HIT1P46973 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.08□□□□□ -0.48
HIT1P46973 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.08□□□□□ -0.48
HIT1P46973 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.08□□□□□ -0.48
HIT1P46973 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.08□□□□□ -0.48
HIT1P46973 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.08□□□□□ -0.48
HIT1P46973 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.08□□□□□ -0.48
HIT1P46973 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.08□□□□□ -0.48
HIT1P46973 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.08□□□□□ -0.48
HIT1P46973 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.08□□□□□ -0.48
HIT1P46973 PUT4YOR348C 1884 nt11.93□□□□□ -0.5
HIT1P46973 CCC1YLR220W 969 nt11.84□□□□□ -0.51
HIT1P46973 RVS167YDR388W 1449 nt11.77□□□□□ -0.52
HIT1P46973 SCS3YGL126W 1143 nt11.7□□□□□ -0.54
HIT1P46973 SCJ1YMR214W 1134 nt11.69□□□□□ -0.54
HIT1P46973 ARE1YCR048W 1833 nt11.53□□□□□ -0.56
HIT1P46973 RPP1BYDL130W 321 nt11.49□□□□□ -0.57
HIT1P46973 POA1YBR022W 534 nt11.44□□□□□ -0.58
HIT1P46973 YOL085CYOL085C 342 nt11.43□□□□□ -0.58
HIT1P46973 SPT5YML010W 3192 nt11.35□□□□□ -0.59
HIT1P46973 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.35□□□□□ -0.59
HIT1P46973 BSC6YOL137W 1494 nt11.34□□□□□ -0.59
HIT1P46973 SAH1YER043C 1350 nt11.32□□□□□ -0.6
HIT1P46973 SHR5YOL110W 714 nt11.29□□□□□ -0.6
HIT1P46973 URN1YPR152C 1398 nt11.28□□□□□ -0.6
HIT1P46973 OPI9YLR338W 858 nt11.28□□□□□ -0.6
HIT1P46973 PKP1YIL042C 1185 nt11.27□□□□□ -0.61
HIT1P46973 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.21□□□□□ -0.61
HIT1P46973 SSA4YER103W 1929 nt11.15□□□□□ -0.62
HIT1P46973 DEP1YAL013W 1218 nt11.09□□□□□ -0.63
HIT1P46973 Q0182Q0182 405 nt11.07□□□□□ -0.64
HIT1P46973 PET122YER153C 765 nt11.05□□□□□ -0.64
HIT1P46973 BUD23YCR047C 828 nt10.97□□□□□ -0.65
HIT1P46973 RPN10YHR200W 807 nt10.97□□□□□ -0.65
HIT1P46973 SSA1YAL005C 1929 nt10.96□□□□□ -0.65
HIT1P46973 PUN1YLR414C 792 nt10.92□□□□□ -0.66
HIT1P46973 YNL208WYNL208W 600 nt10.9□□□□□ -0.66
HIT1P46973 YDJ1YNL064C 1230 nt10.88□□□□□ -0.67
HIT1P46973 PTC2YER089C 1395 nt10.87□□□□□ -0.67
HIT1P46973 NAB2YGL122C 1578 nt10.82□□□□□ -0.68
HIT1P46973 BDF1YLR399C 2061 nt10.81□□□□□ -0.68
HIT1P46973 YJR018WYJR018W 363 nt10.73□□□□□ -0.69
HIT1P46973 MEP2YNL142W 1500 nt10.72□□□□□ -0.69
HIT1P46973 SCR1SCR1 522 nt10.71□□□□□ -0.69
HIT1P46973 FIS1YIL065C 468 nt10.68□□□□□ -0.7
HIT1P46973 TAT1YBR069C 1860 nt10.66□□□□□ -0.7
HIT1P46973 GAR1YHR089C 618 nt10.65□□□□□ -0.7
HIT1P46973 RRN5YLR141W 1092 nt10.64□□□□□ -0.71
HIT1P46973 DAL1YIR027C 1383 nt10.58□□□□□ -0.72
HIT1P46973 FPS1YLL043W 2010 nt10.57□□□□□ -0.72
HIT1P46973 YJR120WYJR120W 351 nt10.56□□□□□ -0.72
HIT1P46973 DCW1YKL046C 1350 nt10.52□□□□□ -0.72
HIT1P46973 YPS1YLR120C 1710 nt10.5□□□□□ -0.73
HIT1P46973 PHO4YFR034C 939 nt10.49□□□□□ -0.73
HIT1P46973 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.46□□□□□ -0.73
HIT1P46973 FPR4YLR449W 1179 nt10.45□□□□□ -0.74
HIT1P46973 INM2YDR287W 879 nt10.43□□□□□ -0.74
HIT1P46973 YBR220CYBR220C 1683 nt10.4□□□□□ -0.74
HIT1P46973 PAC11YDR488C 1602 nt10.38□□□□□ -0.75
HIT1P46973 EMI2YDR516C 1503 nt10.37□□□□□ -0.75
HIT1P46973 YDR095CYDR095C 411 nt10.36□□□□□ -0.75
HIT1P46973 TIR1YER011W 765 nt10.35□□□□□ -0.75
HIT1P46973 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.35□□□□□ -0.75
HIT1P46973 RPP2BYDR382W 333 nt10.33□□□□□ -0.76
HIT1P46973 ATS1YAL020C 1002 nt10.3□□□□□ -0.76
HIT1P46973 YMR090WYMR090W 684 nt10.28□□□□□ -0.76
HIT1P46973 YDL221WYDL221W 552 nt10.26□□□□□ -0.77
HIT1P46973 YBL100CYBL100C 315 nt10.24□□□□□ -0.77
HIT1P46973 SDH1YKL148C 1923 nt10.24□□□□□ -0.77
HIT1P46973 NVJ2YPR091C 2313 nt10.22□□□□□ -0.77
HIT1P46973 RSB1YOR049C 1065 nt10.22□□□□□ -0.77
HIT1P46973 PTP1YDL230W 1008 nt10.21□□□□□ -0.77
HIT1P46973 CAC2YML102W 1407 nt10.19□□□□□ -0.78
HIT1P46973 MOT3YMR070W 1473 nt10.17□□□□□ -0.78
HIT1P46973 SRB2YHR041C 633 nt10.14□□□□□ -0.79
HIT1P46973 PCH2YBR186W 1695 nt10.13□□□□□ -0.79
HIT1P46973 RPP2AYOL039W 321 nt10.13□□□□□ -0.79
HIT1P46973 GUT2YIL155C 1950 nt10.12□□□□□ -0.79
HIT1P46973 FUN26YAL022C 1554 nt10.1□□□□□ -0.79
HIT1P46973 BDH2YAL061W 1254 nt10.09□□□□□ -0.79
HIT1P46973 SEC11YIR022W 504 nt10.08□□□□□ -0.8
HIT1P46973 SCC4YER147C 1875 nt10.08□□□□□ -0.8
HIT1P46973 IRC15YPL017C 1500 nt10.07□□□□□ -0.8
HIT1P46973 ALF1YNL148C 765 nt10.02□□□□□ -0.81
HIT1P46973 PIB2YGL023C 1908 nt10□□□□□ -0.81
HIT1P46973 GIS3YLR094C 1509 nt9.99□□□□□ -0.81
HIT1P46973 SIS1YNL007C 1059 nt9.97□□□□□ -0.81
HIT1P46973 CCT6YDR188W 1641 nt9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20 ms