Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.12■□□□□ 0.49
HMS1Q12398 NSR1YGR159C 1245 nt18.09■□□□□ 0.49
HMS1Q12398 NOP1YDL014W 984 nt17.58■□□□□ 0.4
HMS1Q12398 YKL036CYKL036C 393 nt16.16■□□□□ 0.18
HMS1Q12398 MDJ1YFL016C 1536 nt16.15■□□□□ 0.18
HMS1Q12398 Q0297Q0297 156 nt15.39■□□□□ 0.05
HMS1Q12398 SRX1YKL086W 384 nt15.38■□□□□ 0.05
HMS1Q12398 YJL027CYJL027C 417 nt15.06■□□□□ 0
HMS1Q12398 SCS3YGL126W 1143 nt14.69□□□□□ -0.06
HMS1Q12398 YCR051WYCR051W 669 nt14.55□□□□□ -0.08
HMS1Q12398 DBP2YNL112W 1641 nt14.29□□□□□ -0.12
HMS1Q12398 YOL085CYOL085C 342 nt14.01□□□□□ -0.17
HMS1Q12398 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.98□□□□□ -0.17
HMS1Q12398 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.98□□□□□ -0.17
HMS1Q12398 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.98□□□□□ -0.17
HMS1Q12398 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.98□□□□□ -0.17
HMS1Q12398 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.98□□□□□ -0.17
HMS1Q12398 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.98□□□□□ -0.17
HMS1Q12398 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.98□□□□□ -0.17
HMS1Q12398 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.98□□□□□ -0.17
HMS1Q12398 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.98□□□□□ -0.17
HMS1Q12398 SSA3YBL075C 1950 nt13.83□□□□□ -0.19
HMS1Q12398 RPP1BYDL130W 321 nt13.8□□□□□ -0.2
HMS1Q12398 YBR190WYBR190W 312 nt13.79□□□□□ -0.2
HMS1Q12398 PKP1YIL042C 1185 nt13.78□□□□□ -0.2
HMS1Q12398 CCC1YLR220W 969 nt13.78□□□□□ -0.2
HMS1Q12398 RTC3YHR087W 336 nt13.44□□□□□ -0.26
HMS1Q12398 RVS167YDR388W 1449 nt13.37□□□□□ -0.27
HMS1Q12398 SCJ1YMR214W 1134 nt13.34□□□□□ -0.27
HMS1Q12398 PET122YER153C 765 nt13.21□□□□□ -0.29
HMS1Q12398 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.18□□□□□ -0.3
HMS1Q12398 ATS1YAL020C 1002 nt13.1□□□□□ -0.31
HMS1Q12398 SCR1SCR1 522 nt13.01□□□□□ -0.33
HMS1Q12398 SHR5YOL110W 714 nt12.9□□□□□ -0.34
HMS1Q12398 RRN5YLR141W 1092 nt12.8□□□□□ -0.36
HMS1Q12398 YDJ1YNL064C 1230 nt12.76□□□□□ -0.37
HMS1Q12398 PUT4YOR348C 1884 nt12.61□□□□□ -0.39
HMS1Q12398 URN1YPR152C 1398 nt12.58□□□□□ -0.4
HMS1Q12398 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.56□□□□□ -0.4
HMS1Q12398 DEP1YAL013W 1218 nt12.54□□□□□ -0.4
HMS1Q12398 RSB1YOR049C 1065 nt12.49□□□□□ -0.41
HMS1Q12398 GAR1YHR089C 618 nt12.46□□□□□ -0.41
HMS1Q12398 OPI9YLR338W 858 nt12.43□□□□□ -0.42
HMS1Q12398 SAH1YER043C 1350 nt12.36□□□□□ -0.43
HMS1Q12398 RPN10YHR200W 807 nt12.36□□□□□ -0.43
HMS1Q12398 ARE1YCR048W 1833 nt12.36□□□□□ -0.43
HMS1Q12398 YNL208WYNL208W 600 nt12.34□□□□□ -0.43
HMS1Q12398 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.18□□□□□ -0.46
HMS1Q12398 POA1YBR022W 534 nt12.17□□□□□ -0.46
HMS1Q12398 PST2YDR032C 597 nt12.15□□□□□ -0.46
HMS1Q12398 TIR1YER011W 765 nt12.06□□□□□ -0.48
HMS1Q12398 PUN1YLR414C 792 nt12.06□□□□□ -0.48
HMS1Q12398 YJR018WYJR018W 363 nt11.99□□□□□ -0.49
HMS1Q12398 SSA1YAL005C 1929 nt11.95□□□□□ -0.5
HMS1Q12398 BSC6YOL137W 1494 nt11.95□□□□□ -0.5
HMS1Q12398 PTC2YER089C 1395 nt11.92□□□□□ -0.5
HMS1Q12398 BUD23YCR047C 828 nt11.86□□□□□ -0.51
HMS1Q12398 YJR120WYJR120W 351 nt11.85□□□□□ -0.51
HMS1Q12398 PAC11YDR488C 1602 nt11.81□□□□□ -0.52
HMS1Q12398 NVJ2YPR091C 2313 nt11.78□□□□□ -0.52
HMS1Q12398 NAB2YGL122C 1578 nt11.78□□□□□ -0.52
HMS1Q12398 SRB2YHR041C 633 nt11.76□□□□□ -0.53
HMS1Q12398 RPP2BYDR382W 333 nt11.71□□□□□ -0.53
HMS1Q12398 SHU1YHL006C 453 nt11.68□□□□□ -0.54
HMS1Q12398 FIS1YIL065C 468 nt11.66□□□□□ -0.54
HMS1Q12398 FPS1YLL043W 2010 nt11.62□□□□□ -0.55
HMS1Q12398 DAL1YIR027C 1383 nt11.62□□□□□ -0.55
HMS1Q12398 YKL097CYKL097C 411 nt11.61□□□□□ -0.55
HMS1Q12398 SSA4YER103W 1929 nt11.59□□□□□ -0.55
HMS1Q12398 INM2YDR287W 879 nt11.57□□□□□ -0.56
HMS1Q12398 FPR4YLR449W 1179 nt11.54□□□□□ -0.56
HMS1Q12398 PHO4YFR034C 939 nt11.52□□□□□ -0.57
HMS1Q12398 WWM1YFL010C 636 nt11.51□□□□□ -0.57
HMS1Q12398 SPT5YML010W 3192 nt11.51□□□□□ -0.57
HMS1Q12398 BDH2YAL061W 1254 nt11.5□□□□□ -0.57
HMS1Q12398 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.49□□□□□ -0.57
HMS1Q12398 YBL100CYBL100C 315 nt11.46□□□□□ -0.57
HMS1Q12398 YGR021WYGR021W 873 nt11.43□□□□□ -0.58
HMS1Q12398 HOM6YJR139C 1080 nt11.4□□□□□ -0.58
HMS1Q12398 BDF1YLR399C 2061 nt11.34□□□□□ -0.59
HMS1Q12398 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.34□□□□□ -0.59
HMS1Q12398 MNP1YGL068W 585 nt11.33□□□□□ -0.6
HMS1Q12398 FUN26YAL022C 1554 nt11.33□□□□□ -0.6
HMS1Q12398 YPS1YLR120C 1710 nt11.32□□□□□ -0.6
HMS1Q12398 LSM3YLR438C-A 270 nt11.32□□□□□ -0.6
HMS1Q12398 TRM9YML014W 840 nt11.26□□□□□ -0.61
HMS1Q12398 YDR095CYDR095C 411 nt11.25□□□□□ -0.61
HMS1Q12398 RKM5YLR137W 1104 nt11.23□□□□□ -0.61
HMS1Q12398 MEP2YNL142W 1500 nt11.22□□□□□ -0.61
HMS1Q12398 CCT6YDR188W 1641 nt11.2□□□□□ -0.62
HMS1Q12398 YOR139CYOR139C 393 nt11.19□□□□□ -0.62
HMS1Q12398 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.17□□□□□ -0.62
HMS1Q12398 ALF1YNL148C 765 nt11.15□□□□□ -0.62
HMS1Q12398 TAT1YBR069C 1860 nt11.15□□□□□ -0.63
HMS1Q12398 YOL037CYOL037C 354 nt11.11□□□□□ -0.63
HMS1Q12398 NPL3YDR432W 1245 nt11.07□□□□□ -0.64
HMS1Q12398 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.07□□□□□ -0.64
HMS1Q12398 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.07□□□□□ -0.64
HMS1Q12398 DCW1YKL046C 1350 nt11.05□□□□□ -0.64
HMS1Q12398 SIS1YNL007C 1059 nt11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.1 ms