RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PMT1	P33775	817 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YKL063C	P35725	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ECM8	P38246	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ATG7	P38862	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SER3	P40054	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DDI1	P40087	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
KAR2	YJL034W	PFA3	P42836	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SSN8	P47821	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	COG7	P53195	279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RIB3	Q99258	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MSF1	P08425	469 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PTC6	P25646	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PPQ1	P32945	549 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SPO23	P33757	523 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	NIC96	P34077	839 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	TOD6	P34219	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	TAF14	P35189	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	LEU5	P38702	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	INM1	P38710	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YHK8	P38776	514 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	DMA1	P38823	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	NDE1	P40215	560 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SLD3	P53135	668 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	APC4	Q04601	652 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GAL83	Q04739	417 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	VPS74	Q06385	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RTR2	Q12378	196 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YPR096C	O13587	100 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	TIM9	O74700	87 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ENA1	P13587	1091 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MRPL33	P20084	86 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GYP8	P43570	497 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	HOC1	P47124	396 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	GCV1	P48015	400 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	IGO1	P53897	168 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ARG7	Q04728	441 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	PDR8	Q06149	701 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	VPS36	Q06696	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RSC58	Q07979	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	RRT8	Q08219	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	MCA1	Q08601	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	NSI1	Q12457	570 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KAR2	YJL034W	CDC4	P07834	779 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	HMG1	P12683	1054 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	YSR3	P23501	404 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	ARO7	P32178	256 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	RNP1	P32385	249 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	EMC3	P36039	253 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	ARA1	P38115	344 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	ECM31	P38122	312 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	YEL073C	P39974	107 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	YEL020C	P39994	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	YKE4	P40544	346 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	TIR3	P40552	269 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	MUP1	P50276	574 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	DAM1	P53267	343 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	AAT1	Q01802	451 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	TRX3	P25372	127 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	NEM1	P38757	446 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
KAR2	YJL034W	AXL2	P38928	823 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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