Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.19■□□□□ 0.34
RTR2Q12378 NSR1YGR159C 1245 nt16.98■□□□□ 0.31
RTR2Q12378 NOP1YDL014W 984 nt16.84■□□□□ 0.29
RTR2Q12378 MDJ1YFL016C 1536 nt15.77■□□□□ 0.11
RTR2Q12378 YKL036CYKL036C 393 nt15.7■□□□□ 0.1
RTR2Q12378 Q0297Q0297 156 nt14.8□□□□□ -0.04
RTR2Q12378 SRX1YKL086W 384 nt14.7□□□□□ -0.06
RTR2Q12378 YJL027CYJL027C 417 nt14.67□□□□□ -0.06
RTR2Q12378 SSA3YBL075C 1950 nt14.45□□□□□ -0.1
RTR2Q12378 SCS3YGL126W 1143 nt14.35□□□□□ -0.11
RTR2Q12378 YCR051WYCR051W 669 nt13.94□□□□□ -0.18
RTR2Q12378 YBR190WYBR190W 312 nt13.71□□□□□ -0.21
RTR2Q12378 DBP2YNL112W 1641 nt13.59□□□□□ -0.23
RTR2Q12378 YOL085CYOL085C 342 nt13.58□□□□□ -0.24
RTR2Q12378 RTC3YHR087W 336 nt13.36□□□□□ -0.27
RTR2Q12378 PKP1YIL042C 1185 nt13.31□□□□□ -0.28
RTR2Q12378 RPP1BYDL130W 321 nt13.27□□□□□ -0.29
RTR2Q12378 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.17□□□□□ -0.3
RTR2Q12378 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.17□□□□□ -0.3
RTR2Q12378 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.17□□□□□ -0.3
RTR2Q12378 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.17□□□□□ -0.3
RTR2Q12378 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.17□□□□□ -0.3
RTR2Q12378 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.17□□□□□ -0.3
RTR2Q12378 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.17□□□□□ -0.3
RTR2Q12378 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.17□□□□□ -0.3
RTR2Q12378 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.17□□□□□ -0.3
RTR2Q12378 PUT4YOR348C 1884 nt13.11□□□□□ -0.31
RTR2Q12378 CCC1YLR220W 969 nt13.02□□□□□ -0.33
RTR2Q12378 SCJ1YMR214W 1134 nt13□□□□□ -0.33
RTR2Q12378 ATS1YAL020C 1002 nt12.9□□□□□ -0.34
RTR2Q12378 RVS167YDR388W 1449 nt12.64□□□□□ -0.39
RTR2Q12378 PET122YER153C 765 nt12.63□□□□□ -0.39
RTR2Q12378 POA1YBR022W 534 nt12.62□□□□□ -0.39
RTR2Q12378 SSA4YER103W 1929 nt12.62□□□□□ -0.39
RTR2Q12378 SPT5YML010W 3192 nt12.6□□□□□ -0.39
RTR2Q12378 ARE1YCR048W 1833 nt12.6□□□□□ -0.39
RTR2Q12378 SCR1SCR1 522 nt12.58□□□□□ -0.4
RTR2Q12378 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.53□□□□□ -0.4
RTR2Q12378 BSC6YOL137W 1494 nt12.53□□□□□ -0.4
RTR2Q12378 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.44□□□□□ -0.42
RTR2Q12378 SAH1YER043C 1350 nt12.31□□□□□ -0.44
RTR2Q12378 RRN5YLR141W 1092 nt12.3□□□□□ -0.44
RTR2Q12378 BDF1YLR399C 2061 nt12.22□□□□□ -0.45
RTR2Q12378 OPI9YLR338W 858 nt12.18□□□□□ -0.46
RTR2Q12378 URN1YPR152C 1398 nt12.18□□□□□ -0.46
RTR2Q12378 YDJ1YNL064C 1230 nt12.13□□□□□ -0.47
RTR2Q12378 SHR5YOL110W 714 nt12.11□□□□□ -0.47
RTR2Q12378 BUD23YCR047C 828 nt12.09□□□□□ -0.47
RTR2Q12378 RSB1YOR049C 1065 nt12.09□□□□□ -0.47
RTR2Q12378 PAC11YDR488C 1602 nt12.08□□□□□ -0.48
RTR2Q12378 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.06□□□□□ -0.48
RTR2Q12378 TAT1YBR069C 1860 nt12.04□□□□□ -0.48
RTR2Q12378 PST2YDR032C 597 nt11.93□□□□□ -0.5
RTR2Q12378 DEP1YAL013W 1218 nt11.89□□□□□ -0.51
RTR2Q12378 NVJ2YPR091C 2313 nt11.89□□□□□ -0.51
RTR2Q12378 MEP2YNL142W 1500 nt11.86□□□□□ -0.51
RTR2Q12378 PUN1YLR414C 792 nt11.83□□□□□ -0.52
RTR2Q12378 PTC2YER089C 1395 nt11.82□□□□□ -0.52
RTR2Q12378 RPN10YHR200W 807 nt11.82□□□□□ -0.52
RTR2Q12378 NAB2YGL122C 1578 nt11.8□□□□□ -0.52
RTR2Q12378 GAR1YHR089C 618 nt11.8□□□□□ -0.52
RTR2Q12378 FPS1YLL043W 2010 nt11.66□□□□□ -0.54
RTR2Q12378 YNL208WYNL208W 600 nt11.64□□□□□ -0.55
RTR2Q12378 DCW1YKL046C 1350 nt11.63□□□□□ -0.55
RTR2Q12378 YJR018WYJR018W 363 nt11.56□□□□□ -0.56
RTR2Q12378 YBR220CYBR220C 1683 nt11.55□□□□□ -0.56
RTR2Q12378 YKL097CYKL097C 411 nt11.54□□□□□ -0.56
RTR2Q12378 FIS1YIL065C 468 nt11.52□□□□□ -0.57
RTR2Q12378 YMR090WYMR090W 684 nt11.51□□□□□ -0.57
RTR2Q12378 DAL1YIR027C 1383 nt11.47□□□□□ -0.57
RTR2Q12378 EMI2YDR516C 1503 nt11.46□□□□□ -0.57
RTR2Q12378 YPS1YLR120C 1710 nt11.46□□□□□ -0.58
RTR2Q12378 FPR4YLR449W 1179 nt11.42□□□□□ -0.58
RTR2Q12378 TIR1YER011W 765 nt11.41□□□□□ -0.58
RTR2Q12378 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.39□□□□□ -0.59
RTR2Q12378 SHU1YHL006C 453 nt11.38□□□□□ -0.59
RTR2Q12378 PCH2YBR186W 1695 nt11.37□□□□□ -0.59
RTR2Q12378 PHO4YFR034C 939 nt11.36□□□□□ -0.59
RTR2Q12378 SDH1YKL148C 1923 nt11.35□□□□□ -0.59
RTR2Q12378 GUT2YIL155C 1950 nt11.34□□□□□ -0.59
RTR2Q12378 YDL221WYDL221W 552 nt11.31□□□□□ -0.6
RTR2Q12378 SEC11YIR022W 504 nt11.31□□□□□ -0.6
RTR2Q12378 SSA1YAL005C 1929 nt11.29□□□□□ -0.6
RTR2Q12378 INM2YDR287W 879 nt11.28□□□□□ -0.6
RTR2Q12378 YDR095CYDR095C 411 nt11.24□□□□□ -0.61
RTR2Q12378 YJR120WYJR120W 351 nt11.14□□□□□ -0.63
RTR2Q12378 CAC2YML102W 1407 nt11.14□□□□□ -0.63
RTR2Q12378 SCC4YER147C 1875 nt11.14□□□□□ -0.63
RTR2Q12378 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.13□□□□□ -0.63
RTR2Q12378 RPP2BYDR382W 333 nt11.12□□□□□ -0.63
RTR2Q12378 PIB2YGL023C 1908 nt11.11□□□□□ -0.63
RTR2Q12378 PTP1YDL230W 1008 nt11.06□□□□□ -0.64
RTR2Q12378 SRB2YHR041C 633 nt11.04□□□□□ -0.64
RTR2Q12378 RPP2AYOL039W 321 nt11.04□□□□□ -0.64
RTR2Q12378 YOR139CYOR139C 393 nt11.03□□□□□ -0.64
RTR2Q12378 YBL100CYBL100C 315 nt11.01□□□□□ -0.65
RTR2Q12378 RTF1YGL244W 1677 nt11.01□□□□□ -0.65
RTR2Q12378 YSC84YHR016C 1407 nt10.99□□□□□ -0.65
RTR2Q12378 IRC15YPL017C 1500 nt10.97□□□□□ -0.65
RTR2Q12378 UME6YDR207C 2511 nt10.95□□□□□ -0.66
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