Protein–RNA interactions for Protein: P53897

IGO1, mRNA stability protein IGO1, yeastyeast

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IGO1P53897 NSR1YGR159C 1245 nt19.08■□□□□ 0.64
IGO1P53897 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.07■□□□□ 0.64
IGO1P53897 NOP1YDL014W 984 nt18.32■□□□□ 0.52
IGO1P53897 MDJ1YFL016C 1536 nt17.36■□□□□ 0.37
IGO1P53897 YKL036CYKL036C 393 nt16.66■□□□□ 0.26
IGO1P53897 SRX1YKL086W 384 nt16.01■□□□□ 0.15
IGO1P53897 YJL027CYJL027C 417 nt15.93■□□□□ 0.14
IGO1P53897 Q0297Q0297 156 nt15.92■□□□□ 0.14
IGO1P53897 YCR051WYCR051W 669 nt15.26■□□□□ 0.03
IGO1P53897 DBP2YNL112W 1641 nt15.17■□□□□ 0.02
IGO1P53897 SCS3YGL126W 1143 nt15.05■□□□□ -0
IGO1P53897 YBR190WYBR190W 312 nt14.76□□□□□ -0.05
IGO1P53897 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.67□□□□□ -0.06
IGO1P53897 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.67□□□□□ -0.06
IGO1P53897 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.67□□□□□ -0.06
IGO1P53897 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.67□□□□□ -0.06
IGO1P53897 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.67□□□□□ -0.06
IGO1P53897 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.67□□□□□ -0.06
IGO1P53897 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.67□□□□□ -0.06
IGO1P53897 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.67□□□□□ -0.06
IGO1P53897 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.67□□□□□ -0.06
IGO1P53897 CCC1YLR220W 969 nt14.62□□□□□ -0.07
IGO1P53897 RTC3YHR087W 336 nt14.52□□□□□ -0.09
IGO1P53897 YOL085CYOL085C 342 nt14.46□□□□□ -0.09
IGO1P53897 PKP1YIL042C 1185 nt14.38□□□□□ -0.11
IGO1P53897 RPP1BYDL130W 321 nt14.32□□□□□ -0.12
IGO1P53897 RVS167YDR388W 1449 nt14.18□□□□□ -0.14
IGO1P53897 SCJ1YMR214W 1134 nt14.12□□□□□ -0.15
IGO1P53897 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.8□□□□□ -0.2
IGO1P53897 PET122YER153C 765 nt13.78□□□□□ -0.2
IGO1P53897 PUT4YOR348C 1884 nt13.65□□□□□ -0.22
IGO1P53897 SHR5YOL110W 714 nt13.61□□□□□ -0.23
IGO1P53897 SCR1SCR1 522 nt13.5□□□□□ -0.25
IGO1P53897 URN1YPR152C 1398 nt13.46□□□□□ -0.25
IGO1P53897 DEP1YAL013W 1218 nt13.45□□□□□ -0.26
IGO1P53897 SSA3YBL075C 1950 nt13.4□□□□□ -0.27
IGO1P53897 ATS1YAL020C 1002 nt13.36□□□□□ -0.27
IGO1P53897 RRN5YLR141W 1092 nt13.33□□□□□ -0.28
IGO1P53897 ARE1YCR048W 1833 nt13.33□□□□□ -0.28
IGO1P53897 SAH1YER043C 1350 nt13.32□□□□□ -0.28
IGO1P53897 YDJ1YNL064C 1230 nt13.29□□□□□ -0.28
IGO1P53897 OPI9YLR338W 858 nt13.27□□□□□ -0.29
IGO1P53897 POA1YBR022W 534 nt13.26□□□□□ -0.29
IGO1P53897 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.21□□□□□ -0.29
IGO1P53897 GAR1YHR089C 618 nt13.15□□□□□ -0.3
IGO1P53897 RPN10YHR200W 807 nt13.14□□□□□ -0.31
IGO1P53897 YNL208WYNL208W 600 nt13.09□□□□□ -0.31
IGO1P53897 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.06□□□□□ -0.32
IGO1P53897 RSB1YOR049C 1065 nt13.01□□□□□ -0.33
IGO1P53897 BSC6YOL137W 1494 nt13.01□□□□□ -0.33
IGO1P53897 BUD23YCR047C 828 nt12.91□□□□□ -0.34
IGO1P53897 PUN1YLR414C 792 nt12.87□□□□□ -0.35
IGO1P53897 PTC2YER089C 1395 nt12.82□□□□□ -0.36
IGO1P53897 YJR018WYJR018W 363 nt12.8□□□□□ -0.36
IGO1P53897 TIR1YER011W 765 nt12.68□□□□□ -0.38
IGO1P53897 NAB2YGL122C 1578 nt12.64□□□□□ -0.39
IGO1P53897 SSA1YAL005C 1929 nt12.6□□□□□ -0.39
IGO1P53897 YJR120WYJR120W 351 nt12.56□□□□□ -0.4
IGO1P53897 FPR4YLR449W 1179 nt12.51□□□□□ -0.41
IGO1P53897 SPT5YML010W 3192 nt12.49□□□□□ -0.41
IGO1P53897 FIS1YIL065C 468 nt12.48□□□□□ -0.41
IGO1P53897 RPP2BYDR382W 333 nt12.45□□□□□ -0.42
IGO1P53897 DAL1YIR027C 1383 nt12.43□□□□□ -0.42
IGO1P53897 SRB2YHR041C 633 nt12.4□□□□□ -0.42
IGO1P53897 PST2YDR032C 597 nt12.39□□□□□ -0.43
IGO1P53897 PHO4YFR034C 939 nt12.35□□□□□ -0.43
IGO1P53897 INM2YDR287W 879 nt12.32□□□□□ -0.44
IGO1P53897 SSA4YER103W 1929 nt12.25□□□□□ -0.45
IGO1P53897 YBL100CYBL100C 315 nt12.23□□□□□ -0.45
IGO1P53897 MEP2YNL142W 1500 nt12.2□□□□□ -0.46
IGO1P53897 YPS1YLR120C 1710 nt12.17□□□□□ -0.46
IGO1P53897 BDH2YAL061W 1254 nt12.14□□□□□ -0.47
IGO1P53897 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.12□□□□□ -0.47
IGO1P53897 WWM1YFL010C 636 nt12.11□□□□□ -0.47
IGO1P53897 DCW1YKL046C 1350 nt12.07□□□□□ -0.48
IGO1P53897 FUN26YAL022C 1554 nt12.07□□□□□ -0.48
IGO1P53897 YDR095CYDR095C 411 nt12.05□□□□□ -0.48
IGO1P53897 SHU1YHL006C 453 nt12.02□□□□□ -0.49
IGO1P53897 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12□□□□□ -0.49
IGO1P53897 TRM9YML014W 840 nt11.97□□□□□ -0.49
IGO1P53897 ALF1YNL148C 765 nt11.97□□□□□ -0.49
IGO1P53897 LSM3YLR438C-A 270 nt11.88□□□□□ -0.51
IGO1P53897 YGR021WYGR021W 873 nt11.87□□□□□ -0.51
IGO1P53897 EMI2YDR516C 1503 nt11.86□□□□□ -0.51
IGO1P53897 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.84□□□□□ -0.51
IGO1P53897 MNP1YGL068W 585 nt11.84□□□□□ -0.51
IGO1P53897 HOM6YJR139C 1080 nt11.84□□□□□ -0.51
IGO1P53897 RPP2AYOL039W 321 nt11.84□□□□□ -0.51
IGO1P53897 CCT6YDR188W 1641 nt11.84□□□□□ -0.51
IGO1P53897 PTP1YDL230W 1008 nt11.82□□□□□ -0.52
IGO1P53897 CAC2YML102W 1407 nt11.82□□□□□ -0.52
IGO1P53897 YKL097CYKL097C 411 nt11.79□□□□□ -0.52
IGO1P53897 YMR090WYMR090W 684 nt11.76□□□□□ -0.53
IGO1P53897 YDL221WYDL221W 552 nt11.75□□□□□ -0.53
IGO1P53897 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.75□□□□□ -0.53
IGO1P53897 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.75□□□□□ -0.53
IGO1P53897 BDF1YLR399C 2061 nt11.75□□□□□ -0.53
IGO1P53897 SIS1YNL007C 1059 nt11.73□□□□□ -0.53
IGO1P53897 YBR220CYBR220C 1683 nt11.71□□□□□ -0.53
IGO1P53897 RKM5YLR137W 1104 nt11.68□□□□□ -0.54
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