Protein–RNA interactions for Protein: Q12407

YDL199C, Putative metabolite transport protein YDL199C, yeastyeast

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Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL199CQ12407 NSR1YGR159C 1245 nt19.16■□□□□ 0.66
YDL199CQ12407 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.99■□□□□ 0.63
YDL199CQ12407 NOP1YDL014W 984 nt18.34■□□□□ 0.53
YDL199CQ12407 MDJ1YFL016C 1536 nt17.31■□□□□ 0.36
YDL199CQ12407 YKL036CYKL036C 393 nt16.61■□□□□ 0.25
YDL199CQ12407 SRX1YKL086W 384 nt16.01■□□□□ 0.15
YDL199CQ12407 YJL027CYJL027C 417 nt15.95■□□□□ 0.14
YDL199CQ12407 Q0297Q0297 156 nt15.94■□□□□ 0.14
YDL199CQ12407 DBP2YNL112W 1641 nt15.18■□□□□ 0.02
YDL199CQ12407 YCR051WYCR051W 669 nt15.16■□□□□ 0.02
YDL199CQ12407 SCS3YGL126W 1143 nt14.94□□□□□ -0.02
YDL199CQ12407 YBR190WYBR190W 312 nt14.85□□□□□ -0.03
YDL199CQ12407 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.68□□□□□ -0.06
YDL199CQ12407 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.68□□□□□ -0.06
YDL199CQ12407 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.68□□□□□ -0.06
YDL199CQ12407 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.68□□□□□ -0.06
YDL199CQ12407 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.68□□□□□ -0.06
YDL199CQ12407 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.68□□□□□ -0.06
YDL199CQ12407 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.68□□□□□ -0.06
YDL199CQ12407 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.68□□□□□ -0.06
YDL199CQ12407 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.68□□□□□ -0.06
YDL199CQ12407 CCC1YLR220W 969 nt14.51□□□□□ -0.09
YDL199CQ12407 RTC3YHR087W 336 nt14.5□□□□□ -0.09
YDL199CQ12407 YOL085CYOL085C 342 nt14.4□□□□□ -0.1
YDL199CQ12407 RPP1BYDL130W 321 nt14.31□□□□□ -0.12
YDL199CQ12407 RVS167YDR388W 1449 nt14.22□□□□□ -0.13
YDL199CQ12407 PKP1YIL042C 1185 nt14.2□□□□□ -0.14
YDL199CQ12407 SCJ1YMR214W 1134 nt14.07□□□□□ -0.16
YDL199CQ12407 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.77□□□□□ -0.21
YDL199CQ12407 PUT4YOR348C 1884 nt13.73□□□□□ -0.21
YDL199CQ12407 PET122YER153C 765 nt13.7□□□□□ -0.22
YDL199CQ12407 SSA3YBL075C 1950 nt13.65□□□□□ -0.22
YDL199CQ12407 SHR5YOL110W 714 nt13.64□□□□□ -0.23
YDL199CQ12407 SCR1SCR1 522 nt13.47□□□□□ -0.25
YDL199CQ12407 URN1YPR152C 1398 nt13.45□□□□□ -0.26
YDL199CQ12407 ARE1YCR048W 1833 nt13.38□□□□□ -0.27
YDL199CQ12407 DEP1YAL013W 1218 nt13.35□□□□□ -0.27
YDL199CQ12407 YDJ1YNL064C 1230 nt13.34□□□□□ -0.27
YDL199CQ12407 OPI9YLR338W 858 nt13.33□□□□□ -0.28
YDL199CQ12407 SAH1YER043C 1350 nt13.32□□□□□ -0.28
YDL199CQ12407 ATS1YAL020C 1002 nt13.28□□□□□ -0.28
YDL199CQ12407 RRN5YLR141W 1092 nt13.27□□□□□ -0.29
YDL199CQ12407 POA1YBR022W 534 nt13.26□□□□□ -0.29
YDL199CQ12407 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.21□□□□□ -0.29
YDL199CQ12407 RPN10YHR200W 807 nt13.19□□□□□ -0.3
YDL199CQ12407 YNL208WYNL208W 600 nt13.12□□□□□ -0.31
YDL199CQ12407 GAR1YHR089C 618 nt13.08□□□□□ -0.32
YDL199CQ12407 BSC6YOL137W 1494 nt13.04□□□□□ -0.32
YDL199CQ12407 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.01□□□□□ -0.33
YDL199CQ12407 PUN1YLR414C 792 nt12.94□□□□□ -0.34
YDL199CQ12407 RSB1YOR049C 1065 nt12.9□□□□□ -0.34
YDL199CQ12407 BUD23YCR047C 828 nt12.88□□□□□ -0.35
YDL199CQ12407 PTC2YER089C 1395 nt12.83□□□□□ -0.36
YDL199CQ12407 YJR018WYJR018W 363 nt12.81□□□□□ -0.36
YDL199CQ12407 NAB2YGL122C 1578 nt12.72□□□□□ -0.37
YDL199CQ12407 SPT5YML010W 3192 nt12.66□□□□□ -0.38
YDL199CQ12407 TIR1YER011W 765 nt12.66□□□□□ -0.38
YDL199CQ12407 SSA1YAL005C 1929 nt12.56□□□□□ -0.4
YDL199CQ12407 YJR120WYJR120W 351 nt12.55□□□□□ -0.4
YDL199CQ12407 FIS1YIL065C 468 nt12.51□□□□□ -0.41
YDL199CQ12407 DAL1YIR027C 1383 nt12.49□□□□□ -0.41
YDL199CQ12407 RPP2BYDR382W 333 nt12.48□□□□□ -0.41
YDL199CQ12407 FPR4YLR449W 1179 nt12.44□□□□□ -0.42
YDL199CQ12407 INM2YDR287W 879 nt12.4□□□□□ -0.42
YDL199CQ12407 PHO4YFR034C 939 nt12.37□□□□□ -0.43
YDL199CQ12407 SSA4YER103W 1929 nt12.37□□□□□ -0.43
YDL199CQ12407 PST2YDR032C 597 nt12.35□□□□□ -0.43
YDL199CQ12407 SRB2YHR041C 633 nt12.29□□□□□ -0.44
YDL199CQ12407 MEP2YNL142W 1500 nt12.28□□□□□ -0.44
YDL199CQ12407 YPS1YLR120C 1710 nt12.24□□□□□ -0.45
YDL199CQ12407 YBL100CYBL100C 315 nt12.23□□□□□ -0.45
YDL199CQ12407 BDH2YAL061W 1254 nt12.17□□□□□ -0.46
YDL199CQ12407 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.13□□□□□ -0.47
YDL199CQ12407 YDR095CYDR095C 411 nt12.12□□□□□ -0.47
YDL199CQ12407 FUN26YAL022C 1554 nt12.08□□□□□ -0.48
YDL199CQ12407 DCW1YKL046C 1350 nt12.07□□□□□ -0.48
YDL199CQ12407 WWM1YFL010C 636 nt12.04□□□□□ -0.48
YDL199CQ12407 TRM9YML014W 840 nt11.99□□□□□ -0.49
YDL199CQ12407 ALF1YNL148C 765 nt11.97□□□□□ -0.49
YDL199CQ12407 LSM3YLR438C-A 270 nt11.95□□□□□ -0.5
YDL199CQ12407 EMI2YDR516C 1503 nt11.92□□□□□ -0.5
YDL199CQ12407 SHU1YHL006C 453 nt11.92□□□□□ -0.5
YDL199CQ12407 BDF1YLR399C 2061 nt11.91□□□□□ -0.5
YDL199CQ12407 CCT6YDR188W 1641 nt11.89□□□□□ -0.51
YDL199CQ12407 YGR021WYGR021W 873 nt11.89□□□□□ -0.51
YDL199CQ12407 RPP2AYOL039W 321 nt11.89□□□□□ -0.51
YDL199CQ12407 PTP1YDL230W 1008 nt11.87□□□□□ -0.51
YDL199CQ12407 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.87□□□□□ -0.51
YDL199CQ12407 YMR090WYMR090W 684 nt11.87□□□□□ -0.51
YDL199CQ12407 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.83□□□□□ -0.52
YDL199CQ12407 YDL221WYDL221W 552 nt11.82□□□□□ -0.52
YDL199CQ12407 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.82□□□□□ -0.52
YDL199CQ12407 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.82□□□□□ -0.52
YDL199CQ12407 HOM6YJR139C 1080 nt11.82□□□□□ -0.52
YDL199CQ12407 CAC2YML102W 1407 nt11.82□□□□□ -0.52
YDL199CQ12407 SIS1YNL007C 1059 nt11.8□□□□□ -0.52
YDL199CQ12407 YBR220CYBR220C 1683 nt11.8□□□□□ -0.52
YDL199CQ12407 TAT1YBR069C 1860 nt11.76□□□□□ -0.53
YDL199CQ12407 SDH1YKL148C 1923 nt11.72□□□□□ -0.53
YDL199CQ12407 MNP1YGL068W 585 nt11.71□□□□□ -0.53
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