Protein–RNA interactions for Protein: Q08601

MCA1, Metacaspase-1, yeastyeast

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCA1Q08601 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.05■□□□□ 0.64
MCA1Q08601 NSR1YGR159C 1245 nt19.03■□□□□ 0.64
MCA1Q08601 NOP1YDL014W 984 nt18.7■□□□□ 0.58
MCA1Q08601 YKL036CYKL036C 393 nt17.5■□□□□ 0.39
MCA1Q08601 MDJ1YFL016C 1536 nt17.31■□□□□ 0.36
MCA1Q08601 Q0297Q0297 156 nt16.45■□□□□ 0.22
MCA1Q08601 YJL027CYJL027C 417 nt16.37■□□□□ 0.21
MCA1Q08601 SRX1YKL086W 384 nt16.33■□□□□ 0.2
MCA1Q08601 SCS3YGL126W 1143 nt16.05■□□□□ 0.16
MCA1Q08601 YCR051WYCR051W 669 nt15.48■□□□□ 0.07
MCA1Q08601 DBP2YNL112W 1641 nt15.14■□□□□ 0.01
MCA1Q08601 YOL085CYOL085C 342 nt15.13■□□□□ 0.01
MCA1Q08601 PKP1YIL042C 1185 nt14.83□□□□□ -0.04
MCA1Q08601 YBR190WYBR190W 312 nt14.78□□□□□ -0.04
MCA1Q08601 RPP1BYDL130W 321 nt14.75□□□□□ -0.05
MCA1Q08601 SCJ1YMR214W 1134 nt14.66□□□□□ -0.06
MCA1Q08601 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MCA1Q08601 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MCA1Q08601 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MCA1Q08601 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MCA1Q08601 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MCA1Q08601 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MCA1Q08601 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MCA1Q08601 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MCA1Q08601 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.62□□□□□ -0.07
MCA1Q08601 CCC1YLR220W 969 nt14.48□□□□□ -0.09
MCA1Q08601 RTC3YHR087W 336 nt14.47□□□□□ -0.09
MCA1Q08601 ATS1YAL020C 1002 nt14.44□□□□□ -0.1
MCA1Q08601 RVS167YDR388W 1449 nt14.15□□□□□ -0.14
MCA1Q08601 PET122YER153C 765 nt14.03□□□□□ -0.16
MCA1Q08601 SCR1SCR1 522 nt14.01□□□□□ -0.17
MCA1Q08601 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.87□□□□□ -0.19
MCA1Q08601 PUT4YOR348C 1884 nt13.71□□□□□ -0.21
MCA1Q08601 RRN5YLR141W 1092 nt13.66□□□□□ -0.22
MCA1Q08601 SSA3YBL075C 1950 nt13.6□□□□□ -0.23
MCA1Q08601 SHR5YOL110W 714 nt13.58□□□□□ -0.24
MCA1Q08601 RSB1YOR049C 1065 nt13.47□□□□□ -0.25
MCA1Q08601 YDJ1YNL064C 1230 nt13.46□□□□□ -0.25
MCA1Q08601 URN1YPR152C 1398 nt13.43□□□□□ -0.26
MCA1Q08601 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.4□□□□□ -0.26
MCA1Q08601 ARE1YCR048W 1833 nt13.37□□□□□ -0.27
MCA1Q08601 DEP1YAL013W 1218 nt13.35□□□□□ -0.27
MCA1Q08601 PST2YDR032C 597 nt13.33□□□□□ -0.28
MCA1Q08601 SAH1YER043C 1350 nt13.31□□□□□ -0.28
MCA1Q08601 OPI9YLR338W 858 nt13.28□□□□□ -0.28
MCA1Q08601 POA1YBR022W 534 nt13.26□□□□□ -0.29
MCA1Q08601 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.23□□□□□ -0.29
MCA1Q08601 RPN10YHR200W 807 nt13.13□□□□□ -0.31
MCA1Q08601 GAR1YHR089C 618 nt13.06□□□□□ -0.32
MCA1Q08601 YNL208WYNL208W 600 nt13.06□□□□□ -0.32
MCA1Q08601 BSC6YOL137W 1494 nt13.05□□□□□ -0.32
MCA1Q08601 YKL097CYKL097C 411 nt12.97□□□□□ -0.33
MCA1Q08601 BUD23YCR047C 828 nt12.89□□□□□ -0.35
MCA1Q08601 PUN1YLR414C 792 nt12.89□□□□□ -0.35
MCA1Q08601 PTC2YER089C 1395 nt12.81□□□□□ -0.36
MCA1Q08601 YJR018WYJR018W 363 nt12.76□□□□□ -0.37
MCA1Q08601 SHU1YHL006C 453 nt12.7□□□□□ -0.38
MCA1Q08601 NAB2YGL122C 1578 nt12.66□□□□□ -0.38
MCA1Q08601 SPT5YML010W 3192 nt12.64□□□□□ -0.39
MCA1Q08601 TIR1YER011W 765 nt12.63□□□□□ -0.39
MCA1Q08601 SSA1YAL005C 1929 nt12.53□□□□□ -0.4
MCA1Q08601 YJR120WYJR120W 351 nt12.53□□□□□ -0.4
MCA1Q08601 FIS1YIL065C 468 nt12.52□□□□□ -0.41
MCA1Q08601 DAL1YIR027C 1383 nt12.45□□□□□ -0.42
MCA1Q08601 FPR4YLR449W 1179 nt12.44□□□□□ -0.42
MCA1Q08601 RPP2BYDR382W 333 nt12.42□□□□□ -0.42
MCA1Q08601 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.38□□□□□ -0.43
MCA1Q08601 SSA4YER103W 1929 nt12.37□□□□□ -0.43
MCA1Q08601 PHO4YFR034C 939 nt12.36□□□□□ -0.43
MCA1Q08601 YOR139CYOR139C 393 nt12.36□□□□□ -0.43
MCA1Q08601 INM2YDR287W 879 nt12.32□□□□□ -0.44
MCA1Q08601 SRB2YHR041C 633 nt12.3□□□□□ -0.44
MCA1Q08601 MEP2YNL142W 1500 nt12.26□□□□□ -0.45
MCA1Q08601 NPL3YDR432W 1245 nt12.23□□□□□ -0.45
MCA1Q08601 YPS1YLR120C 1710 nt12.22□□□□□ -0.45
MCA1Q08601 YBL100CYBL100C 315 nt12.2□□□□□ -0.46
MCA1Q08601 YGR021WYGR021W 873 nt12.18□□□□□ -0.46
MCA1Q08601 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.12□□□□□ -0.47
MCA1Q08601 HOM6YJR139C 1080 nt12.11□□□□□ -0.47
MCA1Q08601 BDH2YAL061W 1254 nt12.11□□□□□ -0.47
MCA1Q08601 WWM1YFL010C 636 nt12.1□□□□□ -0.47
MCA1Q08601 DCW1YKL046C 1350 nt12.09□□□□□ -0.47
MCA1Q08601 YDR095CYDR095C 411 nt12.09□□□□□ -0.47
MCA1Q08601 MNP1YGL068W 585 nt12.05□□□□□ -0.48
MCA1Q08601 YOL037CYOL037C 354 nt12.05□□□□□ -0.48
MCA1Q08601 FUN26YAL022C 1554 nt12.04□□□□□ -0.48
MCA1Q08601 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.95□□□□□ -0.5
MCA1Q08601 RKM5YLR137W 1104 nt11.94□□□□□ -0.5
MCA1Q08601 ALF1YNL148C 765 nt11.94□□□□□ -0.5
MCA1Q08601 TRM9YML014W 840 nt11.92□□□□□ -0.5
MCA1Q08601 BDF1YLR399C 2061 nt11.91□□□□□ -0.5
MCA1Q08601 EMI2YDR516C 1503 nt11.91□□□□□ -0.5
MCA1Q08601 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.88□□□□□ -0.51
MCA1Q08601 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.88□□□□□ -0.51
MCA1Q08601 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.88□□□□□ -0.51
MCA1Q08601 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.88□□□□□ -0.51
MCA1Q08601 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.88□□□□□ -0.51
MCA1Q08601 LSM3YLR438C-A 270 nt11.86□□□□□ -0.51
MCA1Q08601 RPP2AYOL039W 321 nt11.85□□□□□ -0.51
MCA1Q08601 PTP1YDL230W 1008 nt11.84□□□□□ -0.51
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