RNA–Protein interactions for RNA: YLL017W

YLL017W, Transcript of Non-essential Ras guanine nucleotide exchange factor (GEF), yeast

Gene YLL017W, Length 312 nt, Biotype pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL017W	YLL017W	VPS54	Q12071	889 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	CYB2	P00175	591 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	SCEI	P03882	235 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	MRS3	P10566	314 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	RHB1	P25378	209 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	ECM25	P32525	599 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	PTR2	P32901	601 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	YHR054C	P38780	354 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	LCB2	P40970	561 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	GWT1	P47026	490 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	YJL055W	P47044	245 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	ERO1	Q03103	563 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	GYL1	Q04322	720 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	UAF30	Q08747	228 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	MNE1	P24720	663 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	NDC1	P32500	655 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	MDL1	P33310	695 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	RSM22	P36056	628 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	HAT2	P39984	401 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	SER3	P40054	469 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YJL070C	P40361	888 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YJL132W	P47014	750 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	PNG1	Q02890	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	DCI1	Q08558	271 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	MTR10	Q99189	972 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	SPC110	P32380	944 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	FRE2	P36033	711 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	MEP1	P40260	492 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	VHS2	P40463	436 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	TRS85	P46944	698 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	RTT101	P47050	842 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	AEP3	Q12089	606 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	DAP1	Q12091	152 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	PUP2	P32379	260 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	SHO1	P40073	367 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	ALG8	P40351	577 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YGR016W	P53209	190 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YAP7	Q08182	245 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	ATR1	P13090	542 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YCR100C	P25606	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YCR022C	P25620	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	ANP1	P32629	500 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	SWH1	P35845	1188 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	RTT107	P38850	1070 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	GPI8	P49018	411 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YIP1	P53039	248 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	PCP1	P53259	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	OCA2	P53949	197 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	ARK1	P53974	638 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	ODC1	Q03028	310 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	TAF12	Q03761	539 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	SOR2	Q07786	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	BUG1	Q12191	341 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	NDI1	P32340	513 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YCR041W	P37265	110 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	RRN10	P38204	145 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	DPH2	P32461	534 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	PMU1	P36069	295 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	RXT2	P38255	430 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	CAJ1	P39101	391 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	GCD10	P41814	478 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	PHO86	P46956	311 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	PEX25	Q02969	394 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	SGT1	Q08446	395 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YLL017W	YLL017W	MDS3	P53094	1487 aa		4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.9 ms