RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	ECI1	Q05871	280 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	FAR10	Q06001	478 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ESA1	Q08649	445 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MLH3	Q12083	715 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DIN7	Q12086	430 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YOL107W	Q12239	342 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NYV1	Q12255	253 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	HER1	Q12276	1246 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ATP14	Q12349	124 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PNS1	Q12412	539 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	BUD3	P25558	1636 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	KIN28	P06242	306 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PET54	P10834	293 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ERS1	P17261	260 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GIT1	P25346	518 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SED4	P25365	1065 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RNQ1	P25367	405 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PCL2	P25693	308 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	FUN30	P31380	1131 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PHA2	P32452	334 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	POA1	P38218	177 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SIF2	P38262	535 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YBP1	P38315	674 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NVJ1	P38881	321 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	LYS9	P38999	446 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RFC2	P40348	353 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PSF2	P40359	213 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YIL166C	P40445	542 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MAM33	P40513	266 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YJR056C	P47115	236 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CCC1	P47818	322 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DOC1	P53068	250 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YGR021W	P53212	290 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	IMO32	P53219	342 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	VPS62	P53285	467 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CBK1	P53894	756 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YML131W	Q03102	365 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	FMN1	Q03778	218 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CDA1	Q06702	301 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YNG1	Q08465	219 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	LDB17	Q12342	491 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MET17	P06106	444 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	SPT3	P06844	337 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PUT2	P07275	575 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	VPS34	P22543	875 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MGR1	P25573	417 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PRO1	P32264	428 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	HIR1	P32479	840 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ECM25	P32525	599 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	REC104	P33323	182 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MAL32	P38158	584 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YBR137W	P38276	179 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YBR285W	P38354	144 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	BZZ1	P38822	633 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ATG7	P38862	630 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YHR182W	P38870	785 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	VAB2	P40003	282 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PHM8	P40025	321 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	VFA1	P40080	203 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NDE1	P40215	560 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	ICE2	P40499	491 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	PMT5	P52867	743 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	NCS6	P53088	359 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	AIM14	P53109	570 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	YGR012W	P53206	393 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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