Protein–RNA interactions for Protein: P25367

RNQ1, [PIN+] prion protein RNQ1, yeastyeast

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1P25367 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.78■□□□□ 0.76
RNQ1P25367 NSR1YGR159C 1245 nt19.4■□□□□ 0.7
RNQ1P25367 NOP1YDL014W 984 nt19.26■□□□□ 0.67
RNQ1P25367 YKL036CYKL036C 393 nt18.04■□□□□ 0.48
RNQ1P25367 MDJ1YFL016C 1536 nt17.08■□□□□ 0.32
RNQ1P25367 Q0297Q0297 156 nt16.97■□□□□ 0.31
RNQ1P25367 YJL027CYJL027C 417 nt16.9■□□□□ 0.3
RNQ1P25367 SRX1YKL086W 384 nt16.87■□□□□ 0.29
RNQ1P25367 SCS3YGL126W 1143 nt16.58■□□□□ 0.24
RNQ1P25367 YCR051WYCR051W 669 nt16.05■□□□□ 0.16
RNQ1P25367 YOL085CYOL085C 342 nt15.65■□□□□ 0.1
RNQ1P25367 PKP1YIL042C 1185 nt15.44■□□□□ 0.06
RNQ1P25367 RPP1BYDL130W 321 nt15.24■□□□□ 0.03
RNQ1P25367 DBP2YNL112W 1641 nt15.21■□□□□ 0.02
RNQ1P25367 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RNQ1P25367 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RNQ1P25367 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RNQ1P25367 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RNQ1P25367 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RNQ1P25367 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RNQ1P25367 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RNQ1P25367 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RNQ1P25367 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.12■□□□□ 0.01
RNQ1P25367 CCC1YLR220W 969 nt15.02■□□□□ -0
RNQ1P25367 SCJ1YMR214W 1134 nt14.9□□□□□ -0.02
RNQ1P25367 ATS1YAL020C 1002 nt14.88□□□□□ -0.03
RNQ1P25367 PET122YER153C 765 nt14.57□□□□□ -0.08
RNQ1P25367 YBR190WYBR190W 312 nt14.43□□□□□ -0.1
RNQ1P25367 SCR1SCR1 522 nt14.42□□□□□ -0.1
RNQ1P25367 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.4□□□□□ -0.1
RNQ1P25367 RVS167YDR388W 1449 nt14.27□□□□□ -0.12
RNQ1P25367 RRN5YLR141W 1092 nt14.18□□□□□ -0.14
RNQ1P25367 RTC3YHR087W 336 nt14.16□□□□□ -0.14
RNQ1P25367 RSB1YOR049C 1065 nt13.94□□□□□ -0.18
RNQ1P25367 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.9□□□□□ -0.18
RNQ1P25367 YDJ1YNL064C 1230 nt13.89□□□□□ -0.19
RNQ1P25367 SHR5YOL110W 714 nt13.86□□□□□ -0.19
RNQ1P25367 PST2YDR032C 597 nt13.75□□□□□ -0.21
RNQ1P25367 GAR1YHR089C 618 nt13.6□□□□□ -0.23
RNQ1P25367 DEP1YAL013W 1218 nt13.46□□□□□ -0.25
RNQ1P25367 URN1YPR152C 1398 nt13.35□□□□□ -0.27
RNQ1P25367 YKL097CYKL097C 411 nt13.31□□□□□ -0.28
RNQ1P25367 YNL208WYNL208W 600 nt13.2□□□□□ -0.3
RNQ1P25367 SHU1YHL006C 453 nt13.16□□□□□ -0.3
RNQ1P25367 RPN10YHR200W 807 nt13.14□□□□□ -0.31
RNQ1P25367 TIR1YER011W 765 nt13.11□□□□□ -0.31
RNQ1P25367 OPI9YLR338W 858 nt13.08□□□□□ -0.32
RNQ1P25367 SAH1YER043C 1350 nt12.98□□□□□ -0.33
RNQ1P25367 PUT4YOR348C 1884 nt12.95□□□□□ -0.34
RNQ1P25367 SSA1YAL005C 1929 nt12.94□□□□□ -0.34
RNQ1P25367 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.92□□□□□ -0.34
RNQ1P25367 SRB2YHR041C 633 nt12.82□□□□□ -0.36
RNQ1P25367 ARE1YCR048W 1833 nt12.81□□□□□ -0.36
RNQ1P25367 YOR139CYOR139C 393 nt12.78□□□□□ -0.36
RNQ1P25367 YJR018WYJR018W 363 nt12.74□□□□□ -0.37
RNQ1P25367 PUN1YLR414C 792 nt12.68□□□□□ -0.38
RNQ1P25367 YJR120WYJR120W 351 nt12.65□□□□□ -0.38
RNQ1P25367 SSA3YBL075C 1950 nt12.65□□□□□ -0.38
RNQ1P25367 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.64□□□□□ -0.39
RNQ1P25367 WWM1YFL010C 636 nt12.61□□□□□ -0.39
RNQ1P25367 POA1YBR022W 534 nt12.59□□□□□ -0.39
RNQ1P25367 NPL3YDR432W 1245 nt12.57□□□□□ -0.4
RNQ1P25367 MNP1YGL068W 585 nt12.57□□□□□ -0.4
RNQ1P25367 HOM6YJR139C 1080 nt12.54□□□□□ -0.4
RNQ1P25367 PTC2YER089C 1395 nt12.53□□□□□ -0.4
RNQ1P25367 YGR021WYGR021W 873 nt12.52□□□□□ -0.41
RNQ1P25367 RPP2BYDR382W 333 nt12.51□□□□□ -0.41
RNQ1P25367 BUD23YCR047C 828 nt12.38□□□□□ -0.43
RNQ1P25367 YOL037CYOL037C 354 nt12.37□□□□□ -0.43
RNQ1P25367 RKM5YLR137W 1104 nt12.36□□□□□ -0.43
RNQ1P25367 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.34□□□□□ -0.43
RNQ1P25367 BDH2YAL061W 1254 nt12.33□□□□□ -0.44
RNQ1P25367 NAB2YGL122C 1578 nt12.3□□□□□ -0.44
RNQ1P25367 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.26□□□□□ -0.45
RNQ1P25367 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.26□□□□□ -0.45
RNQ1P25367 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.26□□□□□ -0.45
RNQ1P25367 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.26□□□□□ -0.45
RNQ1P25367 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.26□□□□□ -0.45
RNQ1P25367 BSC6YOL137W 1494 nt12.26□□□□□ -0.45
RNQ1P25367 INM2YDR287W 879 nt12.22□□□□□ -0.45
RNQ1P25367 FPR4YLR449W 1179 nt12.22□□□□□ -0.45
RNQ1P25367 DAL1YIR027C 1383 nt12.19□□□□□ -0.46
RNQ1P25367 LSM3YLR438C-A 270 nt12.19□□□□□ -0.46
RNQ1P25367 FIS1YIL065C 468 nt12.18□□□□□ -0.46
RNQ1P25367 YBL100CYBL100C 315 nt12.18□□□□□ -0.46
RNQ1P25367 YLR281CYLR281C 468 nt12.1□□□□□ -0.47
RNQ1P25367 PHO4YFR034C 939 nt12.09□□□□□ -0.47
RNQ1P25367 PUS2YGL063W 1113 nt12.09□□□□□ -0.47
RNQ1P25367 TRM9YML014W 840 nt12.05□□□□□ -0.48
RNQ1P25367 FUN26YAL022C 1554 nt12.05□□□□□ -0.48
RNQ1P25367 WHI5YOR083W 888 nt12.04□□□□□ -0.48
RNQ1P25367 SPT5YML010W 3192 nt11.92□□□□□ -0.5
RNQ1P25367 CCT6YDR188W 1641 nt11.91□□□□□ -0.5
RNQ1P25367 YPR011CYPR011C 981 nt11.87□□□□□ -0.51
RNQ1P25367 MOT3YMR070W 1473 nt11.86□□□□□ -0.51
RNQ1P25367 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.84□□□□□ -0.51
RNQ1P25367 YLR236CYLR236C 324 nt11.81□□□□□ -0.52
RNQ1P25367 ALF1YNL148C 765 nt11.8□□□□□ -0.52
RNQ1P25367 FMP45YDL222C 930 nt11.79□□□□□ -0.52
RNQ1P25367 DSK2YMR276W 1122 nt11.79□□□□□ -0.52
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