Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 NSR1YGR159C 1245 nt20.72■□□□□ 0.91
LDB17Q12342 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.69■□□□□ 0.9
LDB17Q12342 NOP1YDL014W 984 nt20.12■□□□□ 0.81
LDB17Q12342 YKL036CYKL036C 393 nt18.48■□□□□ 0.55
LDB17Q12342 MDJ1YFL016C 1536 nt18.43■□□□□ 0.54
LDB17Q12342 Q0297Q0297 156 nt17.62■□□□□ 0.41
LDB17Q12342 SRX1YKL086W 384 nt17.6■□□□□ 0.41
LDB17Q12342 YJL027CYJL027C 417 nt17.2■□□□□ 0.34
LDB17Q12342 SCS3YGL126W 1143 nt16.76■□□□□ 0.27
LDB17Q12342 YCR051WYCR051W 669 nt16.63■□□□□ 0.25
LDB17Q12342 DBP2YNL112W 1641 nt16.33■□□□□ 0.2
LDB17Q12342 YOL085CYOL085C 342 nt16.02■□□□□ 0.16
LDB17Q12342 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.97■□□□□ 0.15
LDB17Q12342 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.97■□□□□ 0.15
LDB17Q12342 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.97■□□□□ 0.15
LDB17Q12342 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.97■□□□□ 0.15
LDB17Q12342 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.97■□□□□ 0.15
LDB17Q12342 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.97■□□□□ 0.15
LDB17Q12342 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.97■□□□□ 0.15
LDB17Q12342 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.97■□□□□ 0.15
LDB17Q12342 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.97■□□□□ 0.15
LDB17Q12342 RPP1BYDL130W 321 nt15.79■□□□□ 0.12
LDB17Q12342 YBR190WYBR190W 312 nt15.79■□□□□ 0.12
LDB17Q12342 PKP1YIL042C 1185 nt15.73■□□□□ 0.11
LDB17Q12342 CCC1YLR220W 969 nt15.73■□□□□ 0.11
LDB17Q12342 RTC3YHR087W 336 nt15.36■□□□□ 0.05
LDB17Q12342 RVS167YDR388W 1449 nt15.27■□□□□ 0.04
LDB17Q12342 SCJ1YMR214W 1134 nt15.21■□□□□ 0.03
LDB17Q12342 PET122YER153C 765 nt15.08■□□□□ 0
LDB17Q12342 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.07■□□□□ 0
LDB17Q12342 ATS1YAL020C 1002 nt14.98□□□□□ -0.01
LDB17Q12342 SCR1SCR1 522 nt14.87□□□□□ -0.03
LDB17Q12342 SHR5YOL110W 714 nt14.76□□□□□ -0.05
LDB17Q12342 RRN5YLR141W 1092 nt14.64□□□□□ -0.07
LDB17Q12342 YDJ1YNL064C 1230 nt14.61□□□□□ -0.07
LDB17Q12342 SSA3YBL075C 1950 nt14.48□□□□□ -0.09
LDB17Q12342 PUT4YOR348C 1884 nt14.42□□□□□ -0.1
LDB17Q12342 URN1YPR152C 1398 nt14.37□□□□□ -0.11
LDB17Q12342 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.36□□□□□ -0.11
LDB17Q12342 DEP1YAL013W 1218 nt14.31□□□□□ -0.12
LDB17Q12342 RSB1YOR049C 1065 nt14.27□□□□□ -0.13
LDB17Q12342 GAR1YHR089C 618 nt14.23□□□□□ -0.13
LDB17Q12342 OPI9YLR338W 858 nt14.22□□□□□ -0.13
LDB17Q12342 RPN10YHR200W 807 nt14.14□□□□□ -0.15
LDB17Q12342 YNL208WYNL208W 600 nt14.13□□□□□ -0.15
LDB17Q12342 SAH1YER043C 1350 nt14.12□□□□□ -0.15
LDB17Q12342 ARE1YCR048W 1833 nt14.11□□□□□ -0.15
LDB17Q12342 POA1YBR022W 534 nt13.92□□□□□ -0.18
LDB17Q12342 PST2YDR032C 597 nt13.91□□□□□ -0.18
LDB17Q12342 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.9□□□□□ -0.18
LDB17Q12342 PUN1YLR414C 792 nt13.79□□□□□ -0.2
LDB17Q12342 TIR1YER011W 765 nt13.78□□□□□ -0.2
LDB17Q12342 YJR018WYJR018W 363 nt13.71□□□□□ -0.21
LDB17Q12342 SSA1YAL005C 1929 nt13.64□□□□□ -0.23
LDB17Q12342 BSC6YOL137W 1494 nt13.64□□□□□ -0.23
LDB17Q12342 PTC2YER089C 1395 nt13.62□□□□□ -0.23
LDB17Q12342 BUD23YCR047C 828 nt13.53□□□□□ -0.24
LDB17Q12342 YJR120WYJR120W 351 nt13.53□□□□□ -0.24
LDB17Q12342 NAB2YGL122C 1578 nt13.48□□□□□ -0.25
LDB17Q12342 SRB2YHR041C 633 nt13.41□□□□□ -0.26
LDB17Q12342 RPP2BYDR382W 333 nt13.39□□□□□ -0.27
LDB17Q12342 SHU1YHL006C 453 nt13.34□□□□□ -0.27
LDB17Q12342 SPT5YML010W 3192 nt13.3□□□□□ -0.28
LDB17Q12342 FIS1YIL065C 468 nt13.29□□□□□ -0.28
LDB17Q12342 DAL1YIR027C 1383 nt13.28□□□□□ -0.28
LDB17Q12342 INM2YDR287W 879 nt13.26□□□□□ -0.29
LDB17Q12342 YKL097CYKL097C 411 nt13.26□□□□□ -0.29
LDB17Q12342 FPR4YLR449W 1179 nt13.18□□□□□ -0.3
LDB17Q12342 WWM1YFL010C 636 nt13.15□□□□□ -0.3
LDB17Q12342 PHO4YFR034C 939 nt13.15□□□□□ -0.3
LDB17Q12342 BDH2YAL061W 1254 nt13.15□□□□□ -0.3
LDB17Q12342 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.12□□□□□ -0.31
LDB17Q12342 YBL100CYBL100C 315 nt13.09□□□□□ -0.31
LDB17Q12342 YGR021WYGR021W 873 nt13.07□□□□□ -0.32
LDB17Q12342 HOM6YJR139C 1080 nt13.03□□□□□ -0.32
LDB17Q12342 LSM3YLR438C-A 270 nt12.98□□□□□ -0.33
LDB17Q12342 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.97□□□□□ -0.33
LDB17Q12342 SSA4YER103W 1929 nt12.96□□□□□ -0.34
LDB17Q12342 FUN26YAL022C 1554 nt12.94□□□□□ -0.34
LDB17Q12342 YPS1YLR120C 1710 nt12.93□□□□□ -0.34
LDB17Q12342 MNP1YGL068W 585 nt12.9□□□□□ -0.34
LDB17Q12342 TRM9YML014W 840 nt12.89□□□□□ -0.35
LDB17Q12342 YDR095CYDR095C 411 nt12.86□□□□□ -0.35
LDB17Q12342 MEP2YNL142W 1500 nt12.83□□□□□ -0.35
LDB17Q12342 RKM5YLR137W 1104 nt12.83□□□□□ -0.36
LDB17Q12342 CCT6YDR188W 1641 nt12.8□□□□□ -0.36
LDB17Q12342 YOR139CYOR139C 393 nt12.78□□□□□ -0.36
LDB17Q12342 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.76□□□□□ -0.37
LDB17Q12342 ALF1YNL148C 765 nt12.74□□□□□ -0.37
LDB17Q12342 YOL037CYOL037C 354 nt12.69□□□□□ -0.38
LDB17Q12342 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.67□□□□□ -0.38
LDB17Q12342 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.67□□□□□ -0.38
LDB17Q12342 NPL3YDR432W 1245 nt12.65□□□□□ -0.38
LDB17Q12342 SIS1YNL007C 1059 nt12.63□□□□□ -0.39
LDB17Q12342 DCW1YKL046C 1350 nt12.61□□□□□ -0.39
LDB17Q12342 PTP1YDL230W 1008 nt12.6□□□□□ -0.39
LDB17Q12342 RPP2AYOL039W 321 nt12.6□□□□□ -0.39
LDB17Q12342 BDF1YLR399C 2061 nt12.52□□□□□ -0.41
LDB17Q12342 CAC2YML102W 1407 nt12.47□□□□□ -0.41
LDB17Q12342 EMI2YDR516C 1503 nt12.47□□□□□ -0.41
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