RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	POP1	P41812	875 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.04	□□□□□ -1.92	not detected
VMA10	YHR039C-A	ECM27	P47144	725 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	YGR111W	P53265	400 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	YMR087W	Q04299	284 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	GYL1	Q04322	720 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	IVY1	Q04934	453 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	MDM30	Q05930	598 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	UAF30	Q08747	228 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	CTF3	Q12748	733 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	URA4	P20051	364 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	OPI1	P21957	404 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SIN4	P32259	974 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	VPS17	P32913	551 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	LTV1	P34078	463 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	MIC60	P36112	540 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	VHC1	P38329	1120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	SER3	P40054	469 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	FAU1	P40099	211 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	YTA12	P40341	825 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	TOM22	P49334	152 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	GPI1	P53306	609 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	RBA50	Q04418	439 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	RKM5	Q12367	367 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VMA10	YHR039C-A	HNM1	P19807	563 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	CLN1	P20437	546 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	BUB3	P26449	341 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	BRF1	P29056	596 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	PUP2	P32379	260 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	DPH2	P32461	534 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	FRE1	P32791	686 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	RXT2	P38255	430 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YND1	P40009	630 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	EFM4	P40516	257 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YIR014W	P40570	242 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	AZF1	P41696	914 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YJL055W	P47044	245 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YMR130W	Q04223	302 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	SYO1	Q07395	620 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	VPS54	Q12071	889 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	HSP42	Q12329	375 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	SPO7	P18410	259 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	GLN3	P18494	730 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	SEC62	P21825	274 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	BEM1	P29366	551 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	RAD24	P32641	659 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	REC114	P32841	428 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	HEL1	P36113	551 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	CBP4	P37267	147 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	VPS52	P39904	641 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	SAS2	P40963	338 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YJL132W	P47014	750 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	CUL3	P53202	744 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	PEX25	Q02969	394 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	HSP31	Q04432	237 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	FMP42	Q04991	504 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	DCS1	Q06151	350 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YEH2	Q07950	538 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	NRT1	Q08485	598 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	DCI1	Q08558	271 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	NDD1	Q08887	554 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	MED2	Q12124	431 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	RHB1	P25378	209 aa		3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	MMS4	P38257	691 aa		3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YHR054C	P38780	354 aa		3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YGL082W	P53155	381 aa		3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YLR281C	Q05863	155 aa		3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	GRS2	Q06817	618 aa		3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	YDL009C	Q12210	107 aa		3	□□□□□ -1.93
VMA10	YHR039C-A	CSR2	Q12734	1121 aa		3	□□□□□ -1.93

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