Protein–RNA interactions for Protein: Q08887

NDD1, Nuclear division defective protein 1, yeastyeast

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDD1Q08887 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.95■□□□□ 0.94
NDD1Q08887 NSR1YGR159C 1245 nt20.62■□□□□ 0.89
NDD1Q08887 NOP1YDL014W 984 nt20.41■□□□□ 0.86
NDD1Q08887 YKL036CYKL036C 393 nt19.04■□□□□ 0.64
NDD1Q08887 MDJ1YFL016C 1536 nt18.17■□□□□ 0.5
NDD1Q08887 Q0297Q0297 156 nt17.95■□□□□ 0.46
NDD1Q08887 SRX1YKL086W 384 nt17.86■□□□□ 0.45
NDD1Q08887 YJL027CYJL027C 417 nt17.82■□□□□ 0.44
NDD1Q08887 SCS3YGL126W 1143 nt17.45■□□□□ 0.38
NDD1Q08887 YCR051WYCR051W 669 nt16.97■□□□□ 0.31
NDD1Q08887 YOL085CYOL085C 342 nt16.51■□□□□ 0.23
NDD1Q08887 PKP1YIL042C 1185 nt16.26■□□□□ 0.19
NDD1Q08887 DBP2YNL112W 1641 nt16.16■□□□□ 0.18
NDD1Q08887 RPP1BYDL130W 321 nt16.11■□□□□ 0.17
NDD1Q08887 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.03■□□□□ 0.16
NDD1Q08887 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.03■□□□□ 0.16
NDD1Q08887 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.03■□□□□ 0.16
NDD1Q08887 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.03■□□□□ 0.16
NDD1Q08887 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.03■□□□□ 0.16
NDD1Q08887 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.03■□□□□ 0.16
NDD1Q08887 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.03■□□□□ 0.16
NDD1Q08887 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.03■□□□□ 0.16
NDD1Q08887 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.03■□□□□ 0.16
NDD1Q08887 CCC1YLR220W 969 nt15.91■□□□□ 0.14
NDD1Q08887 ATS1YAL020C 1002 nt15.66■□□□□ 0.1
NDD1Q08887 SCJ1YMR214W 1134 nt15.66■□□□□ 0.1
NDD1Q08887 YBR190WYBR190W 312 nt15.4■□□□□ 0.06
NDD1Q08887 PET122YER153C 765 nt15.39■□□□□ 0.05
NDD1Q08887 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.25■□□□□ 0.03
NDD1Q08887 SCR1SCR1 522 nt15.25■□□□□ 0.03
NDD1Q08887 RVS167YDR388W 1449 nt15.18■□□□□ 0.02
NDD1Q08887 RTC3YHR087W 336 nt15.09■□□□□ 0.01
NDD1Q08887 RRN5YLR141W 1092 nt14.98□□□□□ -0.01
NDD1Q08887 YDJ1YNL064C 1230 nt14.72□□□□□ -0.05
NDD1Q08887 SHR5YOL110W 714 nt14.72□□□□□ -0.05
NDD1Q08887 RSB1YOR049C 1065 nt14.71□□□□□ -0.05
NDD1Q08887 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.68□□□□□ -0.06
NDD1Q08887 PST2YDR032C 597 nt14.48□□□□□ -0.09
NDD1Q08887 GAR1YHR089C 618 nt14.4□□□□□ -0.1
NDD1Q08887 DEP1YAL013W 1218 nt14.28□□□□□ -0.12
NDD1Q08887 URN1YPR152C 1398 nt14.21□□□□□ -0.14
NDD1Q08887 YNL208WYNL208W 600 nt14.04□□□□□ -0.16
NDD1Q08887 RPN10YHR200W 807 nt13.99□□□□□ -0.17
NDD1Q08887 YKL097CYKL097C 411 nt13.99□□□□□ -0.17
NDD1Q08887 OPI9YLR338W 858 nt13.94□□□□□ -0.18
NDD1Q08887 TIR1YER011W 765 nt13.9□□□□□ -0.18
NDD1Q08887 PUT4YOR348C 1884 nt13.85□□□□□ -0.19
NDD1Q08887 SHU1YHL006C 453 nt13.85□□□□□ -0.19
NDD1Q08887 SAH1YER043C 1350 nt13.83□□□□□ -0.19
NDD1Q08887 SSA1YAL005C 1929 nt13.7□□□□□ -0.22
NDD1Q08887 ARE1YCR048W 1833 nt13.68□□□□□ -0.22
NDD1Q08887 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.61□□□□□ -0.23
NDD1Q08887 YJR018WYJR018W 363 nt13.56□□□□□ -0.24
NDD1Q08887 SRB2YHR041C 633 nt13.55□□□□□ -0.24
NDD1Q08887 PUN1YLR414C 792 nt13.52□□□□□ -0.25
NDD1Q08887 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.48□□□□□ -0.25
NDD1Q08887 POA1YBR022W 534 nt13.45□□□□□ -0.26
NDD1Q08887 YOR139CYOR139C 393 nt13.43□□□□□ -0.26
NDD1Q08887 YJR120WYJR120W 351 nt13.42□□□□□ -0.26
NDD1Q08887 PTC2YER089C 1395 nt13.35□□□□□ -0.27
NDD1Q08887 WWM1YFL010C 636 nt13.34□□□□□ -0.27
NDD1Q08887 RPP2BYDR382W 333 nt13.31□□□□□ -0.28
NDD1Q08887 YGR021WYGR021W 873 nt13.26□□□□□ -0.29
NDD1Q08887 HOM6YJR139C 1080 nt13.26□□□□□ -0.29
NDD1Q08887 MNP1YGL068W 585 nt13.25□□□□□ -0.29
NDD1Q08887 NPL3YDR432W 1245 nt13.23□□□□□ -0.29
NDD1Q08887 BUD23YCR047C 828 nt13.2□□□□□ -0.3
NDD1Q08887 NAB2YGL122C 1578 nt13.13□□□□□ -0.31
NDD1Q08887 SSA3YBL075C 1950 nt13.11□□□□□ -0.31
NDD1Q08887 BSC6YOL137W 1494 nt13.1□□□□□ -0.31
NDD1Q08887 BDH2YAL061W 1254 nt13.1□□□□□ -0.31
NDD1Q08887 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.08□□□□□ -0.32
NDD1Q08887 RKM5YLR137W 1104 nt13.06□□□□□ -0.32
NDD1Q08887 YOL037CYOL037C 354 nt13.06□□□□□ -0.32
NDD1Q08887 INM2YDR287W 879 nt13.03□□□□□ -0.32
NDD1Q08887 DAL1YIR027C 1383 nt13□□□□□ -0.33
NDD1Q08887 FPR4YLR449W 1179 nt13□□□□□ -0.33
NDD1Q08887 FIS1YIL065C 468 nt12.98□□□□□ -0.33
NDD1Q08887 LSM3YLR438C-A 270 nt12.95□□□□□ -0.34
NDD1Q08887 YBL100CYBL100C 315 nt12.95□□□□□ -0.34
NDD1Q08887 PHO4YFR034C 939 nt12.89□□□□□ -0.35
NDD1Q08887 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.89□□□□□ -0.35
NDD1Q08887 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.89□□□□□ -0.35
NDD1Q08887 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.89□□□□□ -0.35
NDD1Q08887 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.89□□□□□ -0.35
NDD1Q08887 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.89□□□□□ -0.35
NDD1Q08887 TRM9YML014W 840 nt12.82□□□□□ -0.36
NDD1Q08887 FUN26YAL022C 1554 nt12.81□□□□□ -0.36
NDD1Q08887 YLR281CYLR281C 468 nt12.77□□□□□ -0.37
NDD1Q08887 PUS2YGL063W 1113 nt12.73□□□□□ -0.37
NDD1Q08887 WHI5YOR083W 888 nt12.71□□□□□ -0.37
NDD1Q08887 CCT6YDR188W 1641 nt12.67□□□□□ -0.38
NDD1Q08887 ALF1YNL148C 765 nt12.57□□□□□ -0.4
NDD1Q08887 YPS1YLR120C 1710 nt12.57□□□□□ -0.4
NDD1Q08887 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.54□□□□□ -0.4
NDD1Q08887 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.52□□□□□ -0.41
NDD1Q08887 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.52□□□□□ -0.41
NDD1Q08887 YDR095CYDR095C 411 nt12.51□□□□□ -0.41
NDD1Q08887 YPR011CYPR011C 981 nt12.49□□□□□ -0.41
NDD1Q08887 DSK2YMR276W 1122 nt12.45□□□□□ -0.42
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