Protein–RNA interactions for Protein: Q12367

RKM5, Ribosomal lysine N-methyltransferase 5, yeastyeast

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKM5Q12367 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.84■□□□□ 0.77
RKM5Q12367 NOP1YDL014W 984 nt19.44■□□□□ 0.7
RKM5Q12367 NSR1YGR159C 1245 nt19.39■□□□□ 0.69
RKM5Q12367 YKL036CYKL036C 393 nt18.31■□□□□ 0.52
RKM5Q12367 Q0297Q0297 156 nt17.18■□□□□ 0.34
RKM5Q12367 YJL027CYJL027C 417 nt17.16■□□□□ 0.34
RKM5Q12367 SRX1YKL086W 384 nt17.01■□□□□ 0.31
RKM5Q12367 SCS3YGL126W 1143 nt16.89■□□□□ 0.29
RKM5Q12367 MDJ1YFL016C 1536 nt16.86■□□□□ 0.29
RKM5Q12367 YCR051WYCR051W 669 nt16.14■□□□□ 0.17
RKM5Q12367 YOL085CYOL085C 342 nt15.86■□□□□ 0.13
RKM5Q12367 PKP1YIL042C 1185 nt15.56■□□□□ 0.08
RKM5Q12367 SCJ1YMR214W 1134 nt15.45■□□□□ 0.06
RKM5Q12367 RPP1BYDL130W 321 nt15.4■□□□□ 0.06
RKM5Q12367 ATS1YAL020C 1002 nt15.2■□□□□ 0.02
RKM5Q12367 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RKM5Q12367 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RKM5Q12367 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RKM5Q12367 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RKM5Q12367 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RKM5Q12367 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RKM5Q12367 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RKM5Q12367 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RKM5Q12367 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RKM5Q12367 DBP2YNL112W 1641 nt15.1■□□□□ 0.01
RKM5Q12367 CCC1YLR220W 969 nt14.97□□□□□ -0.01
RKM5Q12367 PET122YER153C 765 nt14.67□□□□□ -0.06
RKM5Q12367 SCR1SCR1 522 nt14.6□□□□□ -0.07
RKM5Q12367 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.46□□□□□ -0.09
RKM5Q12367 YBR190WYBR190W 312 nt14.4□□□□□ -0.1
RKM5Q12367 RRN5YLR141W 1092 nt14.28□□□□□ -0.12
RKM5Q12367 RVS167YDR388W 1449 nt14.24□□□□□ -0.13
RKM5Q12367 RSB1YOR049C 1065 nt14.09□□□□□ -0.15
RKM5Q12367 RTC3YHR087W 336 nt14.08□□□□□ -0.16
RKM5Q12367 PST2YDR032C 597 nt14.03□□□□□ -0.16
RKM5Q12367 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.01□□□□□ -0.17
RKM5Q12367 YDJ1YNL064C 1230 nt13.99□□□□□ -0.17
RKM5Q12367 SHR5YOL110W 714 nt13.86□□□□□ -0.19
RKM5Q12367 SSA3YBL075C 1950 nt13.68□□□□□ -0.22
RKM5Q12367 YKL097CYKL097C 411 nt13.66□□□□□ -0.22
RKM5Q12367 GAR1YHR089C 618 nt13.59□□□□□ -0.23
RKM5Q12367 SHU1YHL006C 453 nt13.36□□□□□ -0.27
RKM5Q12367 DEP1YAL013W 1218 nt13.31□□□□□ -0.28
RKM5Q12367 PUT4YOR348C 1884 nt13.24□□□□□ -0.29
RKM5Q12367 URN1YPR152C 1398 nt13.22□□□□□ -0.29
RKM5Q12367 YNL208WYNL208W 600 nt13.16□□□□□ -0.3
RKM5Q12367 TIR1YER011W 765 nt13.14□□□□□ -0.31
RKM5Q12367 RPN10YHR200W 807 nt13.1□□□□□ -0.31
RKM5Q12367 YOR139CYOR139C 393 nt13.06□□□□□ -0.32
RKM5Q12367 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.01□□□□□ -0.33
RKM5Q12367 OPI9YLR338W 858 nt12.96□□□□□ -0.33
RKM5Q12367 SSA1YAL005C 1929 nt12.92□□□□□ -0.34
RKM5Q12367 ARE1YCR048W 1833 nt12.91□□□□□ -0.34
RKM5Q12367 SAH1YER043C 1350 nt12.88□□□□□ -0.35
RKM5Q12367 NPL3YDR432W 1245 nt12.83□□□□□ -0.36
RKM5Q12367 POA1YBR022W 534 nt12.82□□□□□ -0.36
RKM5Q12367 SRB2YHR041C 633 nt12.79□□□□□ -0.36
RKM5Q12367 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.78□□□□□ -0.36
RKM5Q12367 YGR021WYGR021W 873 nt12.67□□□□□ -0.38
RKM5Q12367 MNP1YGL068W 585 nt12.66□□□□□ -0.38
RKM5Q12367 HOM6YJR139C 1080 nt12.66□□□□□ -0.38
RKM5Q12367 YJR018WYJR018W 363 nt12.64□□□□□ -0.39
RKM5Q12367 WWM1YFL010C 636 nt12.62□□□□□ -0.39
RKM5Q12367 YOL037CYOL037C 354 nt12.6□□□□□ -0.39
RKM5Q12367 BSC6YOL137W 1494 nt12.59□□□□□ -0.39
RKM5Q12367 PUN1YLR414C 792 nt12.58□□□□□ -0.4
RKM5Q12367 YJR120WYJR120W 351 nt12.57□□□□□ -0.4
RKM5Q12367 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.52□□□□□ -0.41
RKM5Q12367 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.52□□□□□ -0.41
RKM5Q12367 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.52□□□□□ -0.41
RKM5Q12367 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.52□□□□□ -0.41
RKM5Q12367 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.52□□□□□ -0.41
RKM5Q12367 BUD23YCR047C 828 nt12.49□□□□□ -0.41
RKM5Q12367 RPP2BYDR382W 333 nt12.47□□□□□ -0.41
RKM5Q12367 RKM5YLR137W 1104 nt12.47□□□□□ -0.41
RKM5Q12367 PTC2YER089C 1395 nt12.43□□□□□ -0.42
RKM5Q12367 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.42□□□□□ -0.42
RKM5Q12367 NAB2YGL122C 1578 nt12.34□□□□□ -0.43
RKM5Q12367 BDH2YAL061W 1254 nt12.31□□□□□ -0.44
RKM5Q12367 YLR281CYLR281C 468 nt12.28□□□□□ -0.44
RKM5Q12367 PUS2YGL063W 1113 nt12.26□□□□□ -0.45
RKM5Q12367 LSM3YLR438C-A 270 nt12.22□□□□□ -0.45
RKM5Q12367 MOT3YMR070W 1473 nt12.19□□□□□ -0.46
RKM5Q12367 SPT5YML010W 3192 nt12.19□□□□□ -0.46
RKM5Q12367 WHI5YOR083W 888 nt12.17□□□□□ -0.46
RKM5Q12367 INM2YDR287W 879 nt12.13□□□□□ -0.47
RKM5Q12367 DAL1YIR027C 1383 nt12.11□□□□□ -0.47
RKM5Q12367 FPR4YLR449W 1179 nt12.09□□□□□ -0.47
RKM5Q12367 FIS1YIL065C 468 nt12.08□□□□□ -0.48
RKM5Q12367 YBL100CYBL100C 315 nt12.08□□□□□ -0.48
RKM5Q12367 SSA4YER103W 1929 nt12.03□□□□□ -0.48
RKM5Q12367 TRM9YML014W 840 nt11.99□□□□□ -0.49
RKM5Q12367 PHO4YFR034C 939 nt11.98□□□□□ -0.49
RKM5Q12367 YPR011CYPR011C 981 nt11.97□□□□□ -0.49
RKM5Q12367 FUN26YAL022C 1554 nt11.96□□□□□ -0.49
RKM5Q12367 FMP45YDL222C 930 nt11.96□□□□□ -0.49
RKM5Q12367 DSK2YMR276W 1122 nt11.96□□□□□ -0.49
RKM5Q12367 YLR236CYLR236C 324 nt11.93□□□□□ -0.5
RKM5Q12367 IMP2'YIL154C 1041 nt11.9□□□□□ -0.5
RKM5Q12367 CCT6YDR188W 1641 nt11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.4 ms