Protein–RNA interactions for Protein: Q12210

YDL009C, Uncharacterized protein YDL009C, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL009CQ12210 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.04■□□□□ 0.32
YDL009CQ12210 NSR1YGR159C 1245 nt16.98■□□□□ 0.31
YDL009CQ12210 NOP1YDL014W 984 nt16.65■□□□□ 0.26
YDL009CQ12210 YKL036CYKL036C 393 nt15.36■□□□□ 0.05
YDL009CQ12210 MDJ1YFL016C 1536 nt14.94□□□□□ -0.02
YDL009CQ12210 Q0297Q0297 156 nt14.58□□□□□ -0.08
YDL009CQ12210 SRX1YKL086W 384 nt14.53□□□□□ -0.08
YDL009CQ12210 YJL027CYJL027C 417 nt14.32□□□□□ -0.12
YDL009CQ12210 SCS3YGL126W 1143 nt13.96□□□□□ -0.17
YDL009CQ12210 YCR051WYCR051W 669 nt13.74□□□□□ -0.21
YDL009CQ12210 YOL085CYOL085C 342 nt13.28□□□□□ -0.28
YDL009CQ12210 DBP2YNL112W 1641 nt13.27□□□□□ -0.29
YDL009CQ12210 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.11□□□□□ -0.31
YDL009CQ12210 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.11□□□□□ -0.31
YDL009CQ12210 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.11□□□□□ -0.31
YDL009CQ12210 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.11□□□□□ -0.31
YDL009CQ12210 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.11□□□□□ -0.31
YDL009CQ12210 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.11□□□□□ -0.31
YDL009CQ12210 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.11□□□□□ -0.31
YDL009CQ12210 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.11□□□□□ -0.31
YDL009CQ12210 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.11□□□□□ -0.31
YDL009CQ12210 RPP1BYDL130W 321 nt13.06□□□□□ -0.32
YDL009CQ12210 PKP1YIL042C 1185 nt13.01□□□□□ -0.33
YDL009CQ12210 CCC1YLR220W 969 nt12.9□□□□□ -0.34
YDL009CQ12210 YBR190WYBR190W 312 nt12.82□□□□□ -0.36
YDL009CQ12210 RVS167YDR388W 1449 nt12.54□□□□□ -0.4
YDL009CQ12210 ATS1YAL020C 1002 nt12.51□□□□□ -0.41
YDL009CQ12210 SCJ1YMR214W 1134 nt12.5□□□□□ -0.41
YDL009CQ12210 RTC3YHR087W 336 nt12.48□□□□□ -0.41
YDL009CQ12210 PET122YER153C 765 nt12.44□□□□□ -0.42
YDL009CQ12210 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.4□□□□□ -0.42
YDL009CQ12210 SCR1SCR1 522 nt12.37□□□□□ -0.43
YDL009CQ12210 SHR5YOL110W 714 nt12.1□□□□□ -0.47
YDL009CQ12210 RRN5YLR141W 1092 nt12.09□□□□□ -0.47
YDL009CQ12210 YDJ1YNL064C 1230 nt12.04□□□□□ -0.48
YDL009CQ12210 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.85□□□□□ -0.51
YDL009CQ12210 RSB1YOR049C 1065 nt11.84□□□□□ -0.51
YDL009CQ12210 URN1YPR152C 1398 nt11.7□□□□□ -0.54
YDL009CQ12210 GAR1YHR089C 618 nt11.69□□□□□ -0.54
YDL009CQ12210 DEP1YAL013W 1218 nt11.65□□□□□ -0.54
YDL009CQ12210 RPN10YHR200W 807 nt11.61□□□□□ -0.55
YDL009CQ12210 PUT4YOR348C 1884 nt11.58□□□□□ -0.56
YDL009CQ12210 PST2YDR032C 597 nt11.58□□□□□ -0.56
YDL009CQ12210 OPI9YLR338W 858 nt11.56□□□□□ -0.56
YDL009CQ12210 YNL208WYNL208W 600 nt11.56□□□□□ -0.56
YDL009CQ12210 SAH1YER043C 1350 nt11.41□□□□□ -0.58
YDL009CQ12210 ARE1YCR048W 1833 nt11.37□□□□□ -0.59
YDL009CQ12210 TIR1YER011W 765 nt11.33□□□□□ -0.6
YDL009CQ12210 PUN1YLR414C 792 nt11.25□□□□□ -0.61
YDL009CQ12210 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.21□□□□□ -0.61
YDL009CQ12210 YJR018WYJR018W 363 nt11.19□□□□□ -0.62
YDL009CQ12210 POA1YBR022W 534 nt11.18□□□□□ -0.62
YDL009CQ12210 SSA1YAL005C 1929 nt11.15□□□□□ -0.62
YDL009CQ12210 YKL097CYKL097C 411 nt11.14□□□□□ -0.63
YDL009CQ12210 SHU1YHL006C 453 nt11.07□□□□□ -0.64
YDL009CQ12210 PTC2YER089C 1395 nt11.04□□□□□ -0.64
YDL009CQ12210 RPP2BYDR382W 333 nt11□□□□□ -0.65
YDL009CQ12210 YJR120WYJR120W 351 nt10.98□□□□□ -0.65
YDL009CQ12210 SSA3YBL075C 1950 nt10.96□□□□□ -0.65
YDL009CQ12210 BSC6YOL137W 1494 nt10.95□□□□□ -0.66
YDL009CQ12210 BUD23YCR047C 828 nt10.94□□□□□ -0.66
YDL009CQ12210 NAB2YGL122C 1578 nt10.94□□□□□ -0.66
YDL009CQ12210 SRB2YHR041C 633 nt10.91□□□□□ -0.66
YDL009CQ12210 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.84□□□□□ -0.67
YDL009CQ12210 YGR021WYGR021W 873 nt10.83□□□□□ -0.68
YDL009CQ12210 INM2YDR287W 879 nt10.82□□□□□ -0.68
YDL009CQ12210 DAL1YIR027C 1383 nt10.8□□□□□ -0.68
YDL009CQ12210 WWM1YFL010C 636 nt10.8□□□□□ -0.68
YDL009CQ12210 BDH2YAL061W 1254 nt10.78□□□□□ -0.68
YDL009CQ12210 FIS1YIL065C 468 nt10.75□□□□□ -0.69
YDL009CQ12210 HOM6YJR139C 1080 nt10.75□□□□□ -0.69
YDL009CQ12210 FPR4YLR449W 1179 nt10.71□□□□□ -0.69
YDL009CQ12210 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.69□□□□□ -0.7
YDL009CQ12210 YBL100CYBL100C 315 nt10.69□□□□□ -0.7
YDL009CQ12210 LSM3YLR438C-A 270 nt10.68□□□□□ -0.7
YDL009CQ12210 PHO4YFR034C 939 nt10.67□□□□□ -0.7
YDL009CQ12210 YOR139CYOR139C 393 nt10.66□□□□□ -0.7
YDL009CQ12210 MNP1YGL068W 585 nt10.65□□□□□ -0.7
YDL009CQ12210 Q0182Q0182 405 nt10.63□□□□□ -0.71
YDL009CQ12210 NPL3YDR432W 1245 nt10.6□□□□□ -0.71
YDL009CQ12210 RKM5YLR137W 1104 nt10.59□□□□□ -0.71
YDL009CQ12210 YOL037CYOL037C 354 nt10.58□□□□□ -0.72
YDL009CQ12210 TRM9YML014W 840 nt10.56□□□□□ -0.72
YDL009CQ12210 FUN26YAL022C 1554 nt10.56□□□□□ -0.72
YDL009CQ12210 YPS1YLR120C 1710 nt10.47□□□□□ -0.73
YDL009CQ12210 CCT6YDR188W 1641 nt10.46□□□□□ -0.74
YDL009CQ12210 SPT5YML010W 3192 nt10.42□□□□□ -0.74
YDL009CQ12210 YDR095CYDR095C 411 nt10.42□□□□□ -0.74
YDL009CQ12210 ALF1YNL148C 765 nt10.41□□□□□ -0.74
YDL009CQ12210 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.4□□□□□ -0.74
YDL009CQ12210 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.4□□□□□ -0.74
YDL009CQ12210 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.32□□□□□ -0.76
YDL009CQ12210 MEP2YNL142W 1500 nt10.3□□□□□ -0.76
YDL009CQ12210 YLR281CYLR281C 468 nt10.28□□□□□ -0.76
YDL009CQ12210 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.26□□□□□ -0.77
YDL009CQ12210 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.26□□□□□ -0.77
YDL009CQ12210 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.26□□□□□ -0.77
YDL009CQ12210 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.26□□□□□ -0.77
YDL009CQ12210 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.26□□□□□ -0.77
YDL009CQ12210 SIS1YNL007C 1059 nt10.26□□□□□ -0.77
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