RNA–Protein interactions for RNA: YGL227W

VID30, Transcript of Central component of GID Complex, involved in FBPase degradation, yeast

Gene VID30, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VID30	YGL227W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	KRE6	P32486	720 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	TFA2	P36145	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YBR259W	P38338	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YHL049C	P38722	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YFL064C	P43540	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	TRS23	Q03784	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	ARR2	Q06597	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	CDC73	Q06697	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	NMD4	Q12129	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YCR006C	P25350	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	POP4	P38336	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	REV7	P38927	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	SWD1	P39706	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	VHR1	P40522	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	SHE9	Q04172	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	CDC123	Q05791	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	GYP1	Q08484	637 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	PSY3	Q12318	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	DCG1	P32460	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	MNN5	P46982	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	GCV1	P48015	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	RCO1	Q04779	684 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	ENT4	Q07872	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	MCA1	Q08601	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
VID30	YGL227W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YCK1	P23291	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	AGP1	P25376	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	RFC3	P38629	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	HXT7	P39004	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	SIT1	P39980	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	MRX1	P40050	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	NDC80	P40460	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	INA22	P40576	216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	ZIM17	P42844	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	MDV1	P47025	714 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	VPS60	Q03390	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	GIC2	Q06648	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	COX17	Q12287	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	RRT2	P38332	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	SOH1	P38633	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YJR115W	P47152	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	COS12	P53053	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YNL092W	P53934	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	ECI1	Q05871	280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	RRT8	Q08219	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	ENA1	P13587	1091 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	PDX1	P16451	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	SWH1	P35845	1188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	KEL2	P50090	882 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	PFA4	Q12006	378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	IOC2	Q12072	812 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	DAP2	P18962	818 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	AFR1	P33304	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	MCM7	P38132	845 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YBR138C	P38277	524 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	PAN6	P40459	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	YJR030C	P47101	745 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	GOR1	P53839	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	GTB1	Q04924	702 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID30	YGL227W	MLH3	Q12083	715 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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