Protein–RNA interactions for Protein: Q08920

CBC2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CBC2Q08920 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.94■□□□□ 0.94
CBC2Q08920 NSR1YGR159C 1245 nt20.88■□□□□ 0.93
CBC2Q08920 NOP1YDL014W 984 nt20.31■□□□□ 0.84
CBC2Q08920 YKL036CYKL036C 393 nt18.71■□□□□ 0.59
CBC2Q08920 MDJ1YFL016C 1536 nt18.62■□□□□ 0.57
CBC2Q08920 Q0297Q0297 156 nt17.8■□□□□ 0.44
CBC2Q08920 SRX1YKL086W 384 nt17.78■□□□□ 0.44
CBC2Q08920 YJL027CYJL027C 417 nt17.46■□□□□ 0.39
CBC2Q08920 SCS3YGL126W 1143 nt17.01■□□□□ 0.31
CBC2Q08920 YCR051WYCR051W 669 nt16.86■□□□□ 0.29
CBC2Q08920 DBP2YNL112W 1641 nt16.48■□□□□ 0.23
CBC2Q08920 YOL085CYOL085C 342 nt16.24■□□□□ 0.19
CBC2Q08920 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.12■□□□□ 0.17
CBC2Q08920 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.12■□□□□ 0.17
CBC2Q08920 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.12■□□□□ 0.17
CBC2Q08920 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.12■□□□□ 0.17
CBC2Q08920 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.12■□□□□ 0.17
CBC2Q08920 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.12■□□□□ 0.17
CBC2Q08920 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.12■□□□□ 0.17
CBC2Q08920 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.12■□□□□ 0.17
CBC2Q08920 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.12■□□□□ 0.17
CBC2Q08920 PKP1YIL042C 1185 nt16.01■□□□□ 0.15
CBC2Q08920 RPP1BYDL130W 321 nt15.97■□□□□ 0.15
CBC2Q08920 CCC1YLR220W 969 nt15.96■□□□□ 0.15
CBC2Q08920 YBR190WYBR190W 312 nt15.87■□□□□ 0.13
CBC2Q08920 RTC3YHR087W 336 nt15.5■□□□□ 0.07
CBC2Q08920 RVS167YDR388W 1449 nt15.39■□□□□ 0.05
CBC2Q08920 SCJ1YMR214W 1134 nt15.37■□□□□ 0.05
CBC2Q08920 PET122YER153C 765 nt15.28■□□□□ 0.04
CBC2Q08920 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.23■□□□□ 0.03
CBC2Q08920 ATS1YAL020C 1002 nt15.21■□□□□ 0.03
CBC2Q08920 SCR1SCR1 522 nt15.05■□□□□ -0
CBC2Q08920 Q0182Q0182 405 nt14.88□□□□□ -0.03
CBC2Q08920 SHR5YOL110W 714 nt14.87□□□□□ -0.03
CBC2Q08920 RRN5YLR141W 1092 nt14.84□□□□□ -0.03
CBC2Q08920 YDJ1YNL064C 1230 nt14.73□□□□□ -0.05
CBC2Q08920 MOT3YMR070W 1473 nt14.72□□□□□ -0.05
CBC2Q08920 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.54□□□□□ -0.08
CBC2Q08920 URN1YPR152C 1398 nt14.5□□□□□ -0.09
CBC2Q08920 DEP1YAL013W 1218 nt14.5□□□□□ -0.09
CBC2Q08920 PUT4YOR348C 1884 nt14.48□□□□□ -0.09
CBC2Q08920 RSB1YOR049C 1065 nt14.48□□□□□ -0.09
CBC2Q08920 GAR1YHR089C 618 nt14.42□□□□□ -0.1
CBC2Q08920 OPI9YLR338W 858 nt14.31□□□□□ -0.12
CBC2Q08920 SAH1YER043C 1350 nt14.25□□□□□ -0.13
CBC2Q08920 YNL208WYNL208W 600 nt14.23□□□□□ -0.13
CBC2Q08920 RPN10YHR200W 807 nt14.22□□□□□ -0.13
CBC2Q08920 ARE1YCR048W 1833 nt14.22□□□□□ -0.13
CBC2Q08920 PST2YDR032C 597 nt14.12□□□□□ -0.15
CBC2Q08920 POA1YBR022W 534 nt14.03□□□□□ -0.16 RIP-Chip
CBC2Q08920 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14□□□□□ -0.17
CBC2Q08920 TIR1YER011W 765 nt13.94□□□□□ -0.18
CBC2Q08920 PUN1YLR414C 792 nt13.87□□□□□ -0.19
CBC2Q08920 YJR018WYJR018W 363 nt13.84□□□□□ -0.19
CBC2Q08920 SSA1YAL005C 1929 nt13.81□□□□□ -0.2
CBC2Q08920 PTC2YER089C 1395 nt13.74□□□□□ -0.21
CBC2Q08920 BSC6YOL137W 1494 nt13.72□□□□□ -0.21
CBC2Q08920 BUD23YCR047C 828 nt13.67□□□□□ -0.22
CBC2Q08920 YJR120WYJR120W 351 nt13.67□□□□□ -0.22
CBC2Q08920 SSA3YBL075C 1950 nt13.62□□□□□ -0.23
CBC2Q08920 SRB2YHR041C 633 nt13.62□□□□□ -0.23
CBC2Q08920 NAB2YGL122C 1578 nt13.55□□□□□ -0.24
CBC2Q08920 SHU1YHL006C 453 nt13.55□□□□□ -0.24
CBC2Q08920 RPP2BYDR382W 333 nt13.49□□□□□ -0.25
CBC2Q08920 YKL097CYKL097C 411 nt13.48□□□□□ -0.25
CBC2Q08920 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.38□□□□□ -0.27
CBC2Q08920 FIS1YIL065C 468 nt13.37□□□□□ -0.27
CBC2Q08920 DAL1YIR027C 1383 nt13.36□□□□□ -0.27
CBC2Q08920 INM2YDR287W 879 nt13.34□□□□□ -0.27
CBC2Q08920 WWM1YFL010C 636 nt13.33□□□□□ -0.28
CBC2Q08920 FPR4YLR449W 1179 nt13.33□□□□□ -0.28
CBC2Q08920 YGR139WYGR139W 339 nt13.27□□□□□ -0.29
CBC2Q08920 BDH2YAL061W 1254 nt13.25□□□□□ -0.29
CBC2Q08920 PHO4YFR034C 939 nt13.24□□□□□ -0.29
CBC2Q08920 YBL100CYBL100C 315 nt13.2□□□□□ -0.3
CBC2Q08920 SPT5YML010W 3192 nt13.18□□□□□ -0.3
CBC2Q08920 HOM6YJR139C 1080 nt13.18□□□□□ -0.3
CBC2Q08920 NME1NME1 340 nt13.18□□□□□ -0.3
CBC2Q08920 YGR021WYGR021W 873 nt13.17□□□□□ -0.3
CBC2Q08920 MNP1YGL068W 585 nt13.1□□□□□ -0.31
CBC2Q08920 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.08□□□□□ -0.32
CBC2Q08920 LSM3YLR438C-A 270 nt13.07□□□□□ -0.32
CBC2Q08920 FUN26YAL022C 1554 nt13.06□□□□□ -0.32
CBC2Q08920 YPS1YLR120C 1710 nt13.02□□□□□ -0.32
CBC2Q08920 TRM9YML014W 840 nt13□□□□□ -0.33
CBC2Q08920 YOR139CYOR139C 393 nt13□□□□□ -0.33
CBC2Q08920 RKM5YLR137W 1104 nt12.98□□□□□ -0.33
CBC2Q08920 YDR095CYDR095C 411 nt12.92□□□□□ -0.34
CBC2Q08920 CCT6YDR188W 1641 nt12.89□□□□□ -0.35
CBC2Q08920 MEP2YNL142W 1500 nt12.88□□□□□ -0.35
CBC2Q08920 NPL3YDR432W 1245 nt12.85□□□□□ -0.35
CBC2Q08920 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.85□□□□□ -0.35
CBC2Q08920 ALF1YNL148C 765 nt12.85□□□□□ -0.35
CBC2Q08920 YOL037CYOL037C 354 nt12.82□□□□□ -0.36
CBC2Q08920 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.74□□□□□ -0.37
CBC2Q08920 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.74□□□□□ -0.37
CBC2Q08920 DCW1YKL046C 1350 nt12.71□□□□□ -0.37
CBC2Q08920 SIS1YNL007C 1059 nt12.71□□□□□ -0.37
CBC2Q08920 PTP1YDL230W 1008 nt12.68□□□□□ -0.38
CBC2Q08920 RPP2AYOL039W 321 nt12.68□□□□□ -0.38
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