Protein–RNA interactions for Protein: Q12006

PFA4, Palmitoyltransferase PFA4, yeastyeast

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4Q12006 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.95■□□□□ 0.78
PFA4Q12006 NSR1YGR159C 1245 nt19.65■□□□□ 0.74
PFA4Q12006 NOP1YDL014W 984 nt19.39■□□□□ 0.69
PFA4Q12006 YKL036CYKL036C 393 nt18.09■□□□□ 0.49
PFA4Q12006 MDJ1YFL016C 1536 nt17.37■□□□□ 0.37
PFA4Q12006 Q0297Q0297 156 nt17.09■□□□□ 0.33
PFA4Q12006 SRX1YKL086W 384 nt17■□□□□ 0.31
PFA4Q12006 YJL027CYJL027C 417 nt16.91■□□□□ 0.3
PFA4Q12006 SCS3YGL126W 1143 nt16.59■□□□□ 0.25
PFA4Q12006 YCR051WYCR051W 669 nt16.12■□□□□ 0.17
PFA4Q12006 YOL085CYOL085C 342 nt15.69■□□□□ 0.1
PFA4Q12006 DBP2YNL112W 1641 nt15.46■□□□□ 0.06
PFA4Q12006 PKP1YIL042C 1185 nt15.45■□□□□ 0.06
PFA4Q12006 RPP1BYDL130W 321 nt15.32■□□□□ 0.04
PFA4Q12006 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.31■□□□□ 0.04
PFA4Q12006 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.31■□□□□ 0.04
PFA4Q12006 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.31■□□□□ 0.04
PFA4Q12006 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.31■□□□□ 0.04
PFA4Q12006 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.31■□□□□ 0.04
PFA4Q12006 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.31■□□□□ 0.04
PFA4Q12006 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.31■□□□□ 0.04
PFA4Q12006 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.31■□□□□ 0.04
PFA4Q12006 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.31■□□□□ 0.04
PFA4Q12006 CCC1YLR220W 969 nt15.12■□□□□ 0.01
PFA4Q12006 ATS1YAL020C 1002 nt14.86□□□□□ -0.03
PFA4Q12006 SCJ1YMR214W 1134 nt14.83□□□□□ -0.04
PFA4Q12006 YBR190WYBR190W 312 nt14.71□□□□□ -0.05
PFA4Q12006 PET122YER153C 765 nt14.66□□□□□ -0.06
PFA4Q12006 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.52□□□□□ -0.09
PFA4Q12006 SCR1SCR1 522 nt14.47□□□□□ -0.09
PFA4Q12006 RVS167YDR388W 1449 nt14.46□□□□□ -0.09
PFA4Q12006 RTC3YHR087W 336 nt14.38□□□□□ -0.11
PFA4Q12006 RRN5YLR141W 1092 nt14.23□□□□□ -0.13
PFA4Q12006 SHR5YOL110W 714 nt14.05□□□□□ -0.16
PFA4Q12006 YDJ1YNL064C 1230 nt14.03□□□□□ -0.16
PFA4Q12006 RSB1YOR049C 1065 nt13.98□□□□□ -0.17
PFA4Q12006 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.96□□□□□ -0.17
PFA4Q12006 PST2YDR032C 597 nt13.74□□□□□ -0.21
PFA4Q12006 GAR1YHR089C 618 nt13.7□□□□□ -0.22
PFA4Q12006 DEP1YAL013W 1218 nt13.61□□□□□ -0.23
PFA4Q12006 URN1YPR152C 1398 nt13.56□□□□□ -0.24
PFA4Q12006 YNL208WYNL208W 600 nt13.38□□□□□ -0.27
PFA4Q12006 RPN10YHR200W 807 nt13.34□□□□□ -0.27
PFA4Q12006 OPI9YLR338W 858 nt13.33□□□□□ -0.28
PFA4Q12006 PUT4YOR348C 1884 nt13.28□□□□□ -0.28
PFA4Q12006 YKL097CYKL097C 411 nt13.26□□□□□ -0.29
PFA4Q12006 TIR1YER011W 765 nt13.23□□□□□ -0.29
PFA4Q12006 SAH1YER043C 1350 nt13.21□□□□□ -0.29
PFA4Q12006 SHU1YHL006C 453 nt13.17□□□□□ -0.3
PFA4Q12006 ARE1YCR048W 1833 nt13.1□□□□□ -0.31
PFA4Q12006 SSA1YAL005C 1929 nt13.07□□□□□ -0.32
PFA4Q12006 SRB2YHR041C 633 nt12.95□□□□□ -0.34
PFA4Q12006 YJR018WYJR018W 363 nt12.93□□□□□ -0.34
PFA4Q12006 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.92□□□□□ -0.34
PFA4Q12006 PUN1YLR414C 792 nt12.92□□□□□ -0.34
PFA4Q12006 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.91□□□□□ -0.34
PFA4Q12006 YJR120WYJR120W 351 nt12.86□□□□□ -0.35
PFA4Q12006 POA1YBR022W 534 nt12.86□□□□□ -0.35
PFA4Q12006 YOR139CYOR139C 393 nt12.76□□□□□ -0.37
PFA4Q12006 PTC2YER089C 1395 nt12.75□□□□□ -0.37
PFA4Q12006 WWM1YFL010C 636 nt12.7□□□□□ -0.38
PFA4Q12006 RPP2BYDR382W 333 nt12.67□□□□□ -0.38
PFA4Q12006 MNP1YGL068W 585 nt12.64□□□□□ -0.39
PFA4Q12006 HOM6YJR139C 1080 nt12.64□□□□□ -0.39
PFA4Q12006 YGR021WYGR021W 873 nt12.63□□□□□ -0.39
PFA4Q12006 BUD23YCR047C 828 nt12.61□□□□□ -0.39
PFA4Q12006 SSA3YBL075C 1950 nt12.57□□□□□ -0.4
PFA4Q12006 BSC6YOL137W 1494 nt12.57□□□□□ -0.4
PFA4Q12006 NPL3YDR432W 1245 nt12.55□□□□□ -0.4
PFA4Q12006 NAB2YGL122C 1578 nt12.54□□□□□ -0.4
PFA4Q12006 BDH2YAL061W 1254 nt12.49□□□□□ -0.41
PFA4Q12006 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.47□□□□□ -0.41
PFA4Q12006 FIS1YIL065C 468 nt12.46□□□□□ -0.41
PFA4Q12006 RKM5YLR137W 1104 nt12.44□□□□□ -0.42
PFA4Q12006 YOL037CYOL037C 354 nt12.43□□□□□ -0.42
PFA4Q12006 DAL1YIR027C 1383 nt12.43□□□□□ -0.42
PFA4Q12006 INM2YDR287W 879 nt12.41□□□□□ -0.42
PFA4Q12006 FPR4YLR449W 1179 nt12.39□□□□□ -0.43
PFA4Q12006 YBL100CYBL100C 315 nt12.36□□□□□ -0.43
PFA4Q12006 PHO4YFR034C 939 nt12.33□□□□□ -0.44
PFA4Q12006 LSM3YLR438C-A 270 nt12.33□□□□□ -0.44
PFA4Q12006 FUN26YAL022C 1554 nt12.22□□□□□ -0.45
PFA4Q12006 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.22□□□□□ -0.45
PFA4Q12006 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.22□□□□□ -0.45
PFA4Q12006 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.22□□□□□ -0.45
PFA4Q12006 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.22□□□□□ -0.45
PFA4Q12006 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.22□□□□□ -0.45
PFA4Q12006 TRM9YML014W 840 nt12.19□□□□□ -0.46
PFA4Q12006 YLR281CYLR281C 468 nt12.14□□□□□ -0.47
PFA4Q12006 CCT6YDR188W 1641 nt12.1□□□□□ -0.47
PFA4Q12006 WHI5YOR083W 888 nt12.08□□□□□ -0.48
PFA4Q12006 PUS2YGL063W 1113 nt12.07□□□□□ -0.48
PFA4Q12006 YPS1YLR120C 1710 nt12.03□□□□□ -0.48
PFA4Q12006 YDR095CYDR095C 411 nt11.99□□□□□ -0.49
PFA4Q12006 ALF1YNL148C 765 nt11.98□□□□□ -0.49
PFA4Q12006 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PFA4Q12006 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PFA4Q12006 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.93□□□□□ -0.5
PFA4Q12006 YPR011CYPR011C 981 nt11.88□□□□□ -0.51
PFA4Q12006 SPT5YML010W 3192 nt11.86□□□□□ -0.51
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