Protein–RNA interactions for Protein: P43540

YFL064C, Uncharacterized protein YFL064C, yeastyeast

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFL064CP43540 NSR1YGR159C 1245 nt21.41■■□□□ 1.02
YFL064CP43540 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.33■■□□□ 1.01
YFL064CP43540 NOP1YDL014W 984 nt20.61■□□□□ 0.89
YFL064CP43540 MDJ1YFL016C 1536 nt19.27■□□□□ 0.68
YFL064CP43540 YKL036CYKL036C 393 nt18.78■□□□□ 0.6
YFL064CP43540 SRX1YKL086W 384 nt18.01■□□□□ 0.47
YFL064CP43540 Q0297Q0297 156 nt17.97■□□□□ 0.47
YFL064CP43540 YJL027CYJL027C 417 nt17.75■□□□□ 0.43
YFL064CP43540 YCR051WYCR051W 669 nt17.09■□□□□ 0.33
YFL064CP43540 SCS3YGL126W 1143 nt16.97■□□□□ 0.31
YFL064CP43540 DBP2YNL112W 1641 nt16.96■□□□□ 0.3
YFL064CP43540 YBR190WYBR190W 312 nt16.48■□□□□ 0.23
YFL064CP43540 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.44■□□□□ 0.22
YFL064CP43540 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.44■□□□□ 0.22
YFL064CP43540 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.44■□□□□ 0.22
YFL064CP43540 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.44■□□□□ 0.22
YFL064CP43540 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.44■□□□□ 0.22
YFL064CP43540 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.44■□□□□ 0.22
YFL064CP43540 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.44■□□□□ 0.22
YFL064CP43540 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.44■□□□□ 0.22
YFL064CP43540 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.44■□□□□ 0.22
YFL064CP43540 CCC1YLR220W 969 nt16.3■□□□□ 0.2
YFL064CP43540 YOL085CYOL085C 342 nt16.29■□□□□ 0.2
YFL064CP43540 RPP1BYDL130W 321 nt16.13■□□□□ 0.17
YFL064CP43540 RTC3YHR087W 336 nt16.11■□□□□ 0.17
YFL064CP43540 PKP1YIL042C 1185 nt16.09■□□□□ 0.17
YFL064CP43540 RVS167YDR388W 1449 nt15.85■□□□□ 0.13
YFL064CP43540 SCJ1YMR214W 1134 nt15.74■□□□□ 0.11
YFL064CP43540 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.48■□□□□ 0.07
YFL064CP43540 PET122YER153C 765 nt15.45■□□□□ 0.06
YFL064CP43540 SHR5YOL110W 714 nt15.24■□□□□ 0.03
YFL064CP43540 SCR1SCR1 522 nt15.19■□□□□ 0.02
YFL064CP43540 PUT4YOR348C 1884 nt15.18■□□□□ 0.02
YFL064CP43540 ATS1YAL020C 1002 nt15.12■□□□□ 0.01
YFL064CP43540 URN1YPR152C 1398 nt14.99□□□□□ -0.01
YFL064CP43540 RRN5YLR141W 1092 nt14.98□□□□□ -0.01
YFL064CP43540 YDJ1YNL064C 1230 nt14.96□□□□□ -0.01
YFL064CP43540 DEP1YAL013W 1218 nt14.93□□□□□ -0.02
YFL064CP43540 ARE1YCR048W 1833 nt14.83□□□□□ -0.04
YFL064CP43540 OPI9YLR338W 858 nt14.82□□□□□ -0.04
YFL064CP43540 SAH1YER043C 1350 nt14.81□□□□□ -0.04
YFL064CP43540 SSA3YBL075C 1950 nt14.75□□□□□ -0.05
YFL064CP43540 GAR1YHR089C 618 nt14.69□□□□□ -0.06
YFL064CP43540 POA1YBR022W 534 nt14.69□□□□□ -0.06
YFL064CP43540 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.68□□□□□ -0.06
YFL064CP43540 RPN10YHR200W 807 nt14.68□□□□□ -0.06
YFL064CP43540 YNL208WYNL208W 600 nt14.64□□□□□ -0.07
YFL064CP43540 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.63□□□□□ -0.07
YFL064CP43540 RSB1YOR049C 1065 nt14.59□□□□□ -0.07
YFL064CP43540 BSC6YOL137W 1494 nt14.41□□□□□ -0.1
YFL064CP43540 PUN1YLR414C 792 nt14.37□□□□□ -0.11
YFL064CP43540 BUD23YCR047C 828 nt14.28□□□□□ -0.12
YFL064CP43540 YJR018WYJR018W 363 nt14.28□□□□□ -0.12
YFL064CP43540 PTC2YER089C 1395 nt14.27□□□□□ -0.12
YFL064CP43540 TIR1YER011W 765 nt14.2□□□□□ -0.14
YFL064CP43540 NAB2YGL122C 1578 nt14.1□□□□□ -0.15
YFL064CP43540 SSA1YAL005C 1929 nt14.1□□□□□ -0.15
YFL064CP43540 PST2YDR032C 597 nt14.05□□□□□ -0.16
YFL064CP43540 YJR120WYJR120W 351 nt14.02□□□□□ -0.17
YFL064CP43540 SPT5YML010W 3192 nt13.93□□□□□ -0.18
YFL064CP43540 RPP2BYDR382W 333 nt13.9□□□□□ -0.18
YFL064CP43540 FIS1YIL065C 468 nt13.88□□□□□ -0.19
YFL064CP43540 DAL1YIR027C 1383 nt13.87□□□□□ -0.19
YFL064CP43540 SRB2YHR041C 633 nt13.84□□□□□ -0.19
YFL064CP43540 FPR4YLR449W 1179 nt13.84□□□□□ -0.19
YFL064CP43540 INM2YDR287W 879 nt13.79□□□□□ -0.2
YFL064CP43540 PHO4YFR034C 939 nt13.74□□□□□ -0.21
YFL064CP43540 YBL100CYBL100C 315 nt13.62□□□□□ -0.23
YFL064CP43540 BDH2YAL061W 1254 nt13.6□□□□□ -0.23
YFL064CP43540 YPS1YLR120C 1710 nt13.56□□□□□ -0.24
YFL064CP43540 MEP2YNL142W 1500 nt13.55□□□□□ -0.24
YFL064CP43540 WWM1YFL010C 636 nt13.55□□□□□ -0.24
YFL064CP43540 SHU1YHL006C 453 nt13.54□□□□□ -0.24
YFL064CP43540 SSA4YER103W 1929 nt13.53□□□□□ -0.24
YFL064CP43540 FUN26YAL022C 1554 nt13.46□□□□□ -0.25
YFL064CP43540 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.44□□□□□ -0.26
YFL064CP43540 YDR095CYDR095C 411 nt13.43□□□□□ -0.26
YFL064CP43540 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.43□□□□□ -0.26
YFL064CP43540 TRM9YML014W 840 nt13.39□□□□□ -0.27
YFL064CP43540 YGR021WYGR021W 873 nt13.36□□□□□ -0.27
YFL064CP43540 LSM3YLR438C-A 270 nt13.36□□□□□ -0.27
YFL064CP43540 DCW1YKL046C 1350 nt13.35□□□□□ -0.27
YFL064CP43540 YKL097CYKL097C 411 nt13.33□□□□□ -0.28
YFL064CP43540 HOM6YJR139C 1080 nt13.32□□□□□ -0.28
YFL064CP43540 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.31□□□□□ -0.28
YFL064CP43540 ALF1YNL148C 765 nt13.31□□□□□ -0.28
YFL064CP43540 CCT6YDR188W 1641 nt13.26□□□□□ -0.29
YFL064CP43540 MNP1YGL068W 585 nt13.23□□□□□ -0.29
YFL064CP43540 PTP1YDL230W 1008 nt13.18□□□□□ -0.3
YFL064CP43540 RPP2AYOL039W 321 nt13.18□□□□□ -0.3
YFL064CP43540 EMI2YDR516C 1503 nt13.16□□□□□ -0.3
YFL064CP43540 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.15□□□□□ -0.3
YFL064CP43540 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.15□□□□□ -0.3
YFL064CP43540 CAC2YML102W 1407 nt13.13□□□□□ -0.31
YFL064CP43540 RKM5YLR137W 1104 nt13.12□□□□□ -0.31
YFL064CP43540 SIS1YNL007C 1059 nt13.12□□□□□ -0.31
YFL064CP43540 YMR090WYMR090W 684 nt13.06□□□□□ -0.32
YFL064CP43540 YDL221WYDL221W 552 nt13.04□□□□□ -0.32
YFL064CP43540 BDF1YLR399C 2061 nt13.03□□□□□ -0.32
YFL064CP43540 YBR220CYBR220C 1683 nt12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.2 ms